Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QGA7

Protein Details
Accession W1QGA7    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAKRRQKKRTHVKLSEDQLAKHydrophilic
211-231SKNVKKLVKVHKKTNKKLPNLHydrophilic
326-358KLEQIHAVRRKEKERRRKEQEENIQRKKKVKISBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
280-284GKRKK
331-356HAVRRKEKERRRKEQEENIQRKKKVK
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 13.332, cyto_mito 10.165, nucl 8.5, cyto_nucl 7.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG opa:HPODL_01042  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKRRQKKRTHVKLSEDQLAKIPRSMVIHLGTALHNHTLTQLVRDTRIMMLPHTAINLRERNRNKLKDFVVMAGPLGISQLMIFSQNEETGSTQLRFSAMPRGPTINFKIHEYSLCKDVARYQKMPKSVSKSGPEFLNPPLLVMSGFTNPKEAEQHEKLMVTMFQNMFPPISPQNTKVSTIKRVLLLQKDKETGLVDLRHYVIDTKLVDVSKNVKKLVKVHKKTNKKLPNLSKVDDVADIILDPYAQAGFTSDSEVEEDAVVEVKEDVAVKTKGAAEEGGKRKKAVKLTEIGPRMKLELVKIEEGVCDGKVLYHSRIKKSVKEINKLEQIHAVRRKEKERRRKEQEENIQRKKKVKISSEAESEAESEEEFSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.84
3 0.74
4 0.64
5 0.6
6 0.56
7 0.48
8 0.41
9 0.35
10 0.29
11 0.3
12 0.3
13 0.28
14 0.25
15 0.25
16 0.23
17 0.24
18 0.21
19 0.2
20 0.2
21 0.17
22 0.15
23 0.14
24 0.14
25 0.17
26 0.17
27 0.18
28 0.21
29 0.22
30 0.24
31 0.24
32 0.25
33 0.22
34 0.26
35 0.24
36 0.19
37 0.21
38 0.2
39 0.2
40 0.2
41 0.19
42 0.17
43 0.23
44 0.29
45 0.3
46 0.38
47 0.42
48 0.5
49 0.59
50 0.66
51 0.63
52 0.64
53 0.63
54 0.61
55 0.58
56 0.5
57 0.43
58 0.34
59 0.3
60 0.22
61 0.19
62 0.12
63 0.1
64 0.07
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.21
86 0.2
87 0.22
88 0.24
89 0.27
90 0.27
91 0.32
92 0.35
93 0.33
94 0.31
95 0.32
96 0.33
97 0.3
98 0.33
99 0.32
100 0.3
101 0.26
102 0.26
103 0.23
104 0.2
105 0.27
106 0.32
107 0.34
108 0.37
109 0.41
110 0.44
111 0.5
112 0.53
113 0.51
114 0.5
115 0.5
116 0.52
117 0.51
118 0.49
119 0.47
120 0.45
121 0.4
122 0.34
123 0.28
124 0.29
125 0.22
126 0.2
127 0.17
128 0.16
129 0.14
130 0.13
131 0.13
132 0.09
133 0.11
134 0.1
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.15
139 0.15
140 0.2
141 0.21
142 0.24
143 0.23
144 0.23
145 0.22
146 0.2
147 0.2
148 0.13
149 0.15
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.14
157 0.11
158 0.14
159 0.15
160 0.17
161 0.22
162 0.23
163 0.26
164 0.27
165 0.29
166 0.3
167 0.31
168 0.31
169 0.27
170 0.29
171 0.3
172 0.33
173 0.35
174 0.33
175 0.33
176 0.32
177 0.31
178 0.29
179 0.26
180 0.19
181 0.17
182 0.16
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.13
187 0.12
188 0.12
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.19
198 0.2
199 0.23
200 0.24
201 0.24
202 0.26
203 0.34
204 0.44
205 0.48
206 0.5
207 0.58
208 0.65
209 0.74
210 0.8
211 0.82
212 0.8
213 0.76
214 0.8
215 0.79
216 0.8
217 0.75
218 0.69
219 0.61
220 0.53
221 0.47
222 0.37
223 0.28
224 0.17
225 0.12
226 0.09
227 0.07
228 0.05
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.13
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.16
263 0.14
264 0.23
265 0.32
266 0.37
267 0.37
268 0.38
269 0.42
270 0.46
271 0.51
272 0.48
273 0.45
274 0.43
275 0.47
276 0.54
277 0.55
278 0.52
279 0.46
280 0.4
281 0.36
282 0.32
283 0.29
284 0.22
285 0.24
286 0.26
287 0.25
288 0.25
289 0.24
290 0.22
291 0.22
292 0.21
293 0.13
294 0.1
295 0.08
296 0.09
297 0.12
298 0.15
299 0.19
300 0.26
301 0.32
302 0.38
303 0.47
304 0.5
305 0.53
306 0.59
307 0.64
308 0.65
309 0.68
310 0.68
311 0.68
312 0.73
313 0.68
314 0.6
315 0.59
316 0.53
317 0.53
318 0.56
319 0.54
320 0.52
321 0.57
322 0.66
323 0.69
324 0.76
325 0.77
326 0.8
327 0.85
328 0.88
329 0.91
330 0.91
331 0.92
332 0.92
333 0.92
334 0.92
335 0.92
336 0.91
337 0.86
338 0.83
339 0.8
340 0.77
341 0.75
342 0.72
343 0.72
344 0.7
345 0.72
346 0.72
347 0.66
348 0.59
349 0.5
350 0.42
351 0.33
352 0.27
353 0.19