Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QCM3

Protein Details
Accession W1QCM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
514-543ALEKITKERERESRRKKRGQTRVGRRGGIVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
520-539KERERESRRKKRGQTRVGRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
KEGG opa:HPODL_03919  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MFEGSSGGQPPPQQQMTPQMIIQNLMRMDPQQRNAVIMKNPQLQMFLQHYEQQRKAALNQSMNPQMQAKIIQQQQQRQIQQQRQQISGQVPGQMPHQIPTPVPAPQVAQKNPGMQAQKRMVRKRSSAKDPLDPSGTPVGSPVISQGPHPVQNMGYPPGAQSGPVPPPVAQAPPQPVVPLSERIEDTHKWSKTFENEEKEVPTSIKVYEQIIERDMDYDRRSVAETKKPFNAEQLQAMARDLKFYQTIRDSRLKAIALTEAGKNAESIWGDGYSGYGNGFSAGKTRLVFPRNRKKHSRVPDDYIPPEAYEKQANKPEELVPIRLEFDVDRDSFKLNDTFLWNLNEGTISVERFAQILMEDYKFPQGQASNVEKIVSSIKEQINEYHPMVYGEFKGSDLRLPISVDITIGNNQLVDKFDWDLANPDNDPEEFARVMCEEMALPNEFMTAISHAIREQCQIYVKSLFSVGYKFDGSPITSDEFKDLNRSQIDKDSVVRARHHLQEYTPSLQEITFDALEKITKERERESRRKKRGQTRVGRRGGIVLPDLHDLPKTFRTPVPSTVLPSGVNLGPPVDSYIDFPLQVEIPQEQLQALEEFRAQERVQAVPVDRVGPVVASNGVAYQIDMQRAIVRIKLRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.39
3 0.43
4 0.43
5 0.41
6 0.36
7 0.34
8 0.36
9 0.33
10 0.29
11 0.23
12 0.21
13 0.21
14 0.2
15 0.27
16 0.32
17 0.35
18 0.36
19 0.36
20 0.39
21 0.41
22 0.44
23 0.42
24 0.42
25 0.46
26 0.47
27 0.48
28 0.45
29 0.45
30 0.39
31 0.4
32 0.37
33 0.33
34 0.28
35 0.32
36 0.39
37 0.45
38 0.47
39 0.44
40 0.43
41 0.42
42 0.44
43 0.47
44 0.47
45 0.44
46 0.46
47 0.49
48 0.53
49 0.51
50 0.48
51 0.42
52 0.35
53 0.31
54 0.31
55 0.27
56 0.27
57 0.32
58 0.37
59 0.41
60 0.48
61 0.55
62 0.6
63 0.62
64 0.63
65 0.68
66 0.7
67 0.72
68 0.72
69 0.67
70 0.62
71 0.58
72 0.54
73 0.47
74 0.44
75 0.38
76 0.35
77 0.31
78 0.29
79 0.29
80 0.29
81 0.27
82 0.22
83 0.24
84 0.21
85 0.2
86 0.22
87 0.23
88 0.2
89 0.2
90 0.2
91 0.19
92 0.24
93 0.32
94 0.31
95 0.34
96 0.34
97 0.37
98 0.38
99 0.42
100 0.42
101 0.36
102 0.43
103 0.46
104 0.5
105 0.55
106 0.62
107 0.64
108 0.65
109 0.71
110 0.73
111 0.73
112 0.76
113 0.76
114 0.73
115 0.73
116 0.7
117 0.66
118 0.59
119 0.5
120 0.44
121 0.41
122 0.36
123 0.27
124 0.23
125 0.2
126 0.16
127 0.16
128 0.15
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.18
133 0.2
134 0.23
135 0.24
136 0.24
137 0.21
138 0.23
139 0.26
140 0.23
141 0.2
142 0.16
143 0.16
144 0.18
145 0.17
146 0.14
147 0.13
148 0.15
149 0.17
150 0.19
151 0.2
152 0.17
153 0.19
154 0.21
155 0.22
156 0.19
157 0.2
158 0.23
159 0.24
160 0.24
161 0.22
162 0.21
163 0.22
164 0.22
165 0.23
166 0.2
167 0.22
168 0.22
169 0.23
170 0.28
171 0.25
172 0.3
173 0.33
174 0.33
175 0.31
176 0.32
177 0.35
178 0.38
179 0.46
180 0.45
181 0.43
182 0.44
183 0.45
184 0.45
185 0.42
186 0.36
187 0.28
188 0.22
189 0.16
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.15
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.17
199 0.15
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.15
208 0.19
209 0.24
210 0.29
211 0.33
212 0.36
213 0.41
214 0.43
215 0.41
216 0.42
217 0.42
218 0.35
219 0.32
220 0.31
221 0.27
222 0.25
223 0.25
224 0.22
225 0.16
226 0.16
227 0.14
228 0.12
229 0.15
230 0.15
231 0.18
232 0.21
233 0.24
234 0.27
235 0.34
236 0.34
237 0.33
238 0.36
239 0.32
240 0.26
241 0.25
242 0.21
243 0.16
244 0.15
245 0.14
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.12
272 0.17
273 0.22
274 0.28
275 0.36
276 0.46
277 0.53
278 0.6
279 0.66
280 0.67
281 0.72
282 0.76
283 0.76
284 0.71
285 0.69
286 0.69
287 0.66
288 0.61
289 0.54
290 0.43
291 0.33
292 0.29
293 0.23
294 0.17
295 0.17
296 0.17
297 0.2
298 0.26
299 0.27
300 0.26
301 0.27
302 0.27
303 0.28
304 0.28
305 0.24
306 0.19
307 0.18
308 0.19
309 0.17
310 0.16
311 0.09
312 0.1
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.12
321 0.1
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.14
326 0.15
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.11
331 0.09
332 0.1
333 0.09
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.05
341 0.04
342 0.06
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.11
352 0.12
353 0.18
354 0.21
355 0.2
356 0.2
357 0.2
358 0.18
359 0.18
360 0.2
361 0.14
362 0.12
363 0.17
364 0.18
365 0.2
366 0.2
367 0.22
368 0.23
369 0.26
370 0.25
371 0.2
372 0.19
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.13
377 0.1
378 0.1
379 0.09
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.1
384 0.11
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.13
407 0.13
408 0.14
409 0.13
410 0.13
411 0.12
412 0.12
413 0.14
414 0.12
415 0.13
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.11
421 0.09
422 0.09
423 0.06
424 0.07
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.11
439 0.12
440 0.13
441 0.13
442 0.14
443 0.18
444 0.19
445 0.21
446 0.22
447 0.21
448 0.2
449 0.2
450 0.19
451 0.15
452 0.15
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.13
457 0.14
458 0.15
459 0.14
460 0.14
461 0.16
462 0.16
463 0.16
464 0.17
465 0.17
466 0.17
467 0.16
468 0.23
469 0.21
470 0.24
471 0.27
472 0.29
473 0.28
474 0.34
475 0.37
476 0.31
477 0.33
478 0.34
479 0.36
480 0.38
481 0.38
482 0.37
483 0.38
484 0.44
485 0.45
486 0.39
487 0.35
488 0.4
489 0.43
490 0.42
491 0.37
492 0.3
493 0.27
494 0.25
495 0.25
496 0.17
497 0.16
498 0.12
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.14
504 0.16
505 0.19
506 0.22
507 0.25
508 0.31
509 0.41
510 0.5
511 0.6
512 0.69
513 0.73
514 0.8
515 0.87
516 0.91
517 0.91
518 0.92
519 0.92
520 0.92
521 0.92
522 0.92
523 0.88
524 0.8
525 0.7
526 0.64
527 0.55
528 0.47
529 0.38
530 0.28
531 0.23
532 0.24
533 0.24
534 0.2
535 0.19
536 0.17
537 0.19
538 0.24
539 0.24
540 0.25
541 0.27
542 0.34
543 0.37
544 0.41
545 0.43
546 0.39
547 0.41
548 0.41
549 0.4
550 0.33
551 0.29
552 0.28
553 0.21
554 0.2
555 0.16
556 0.14
557 0.12
558 0.12
559 0.13
560 0.11
561 0.11
562 0.13
563 0.17
564 0.18
565 0.17
566 0.17
567 0.17
568 0.16
569 0.16
570 0.16
571 0.13
572 0.15
573 0.17
574 0.17
575 0.15
576 0.14
577 0.16
578 0.15
579 0.15
580 0.13
581 0.13
582 0.14
583 0.16
584 0.2
585 0.18
586 0.21
587 0.22
588 0.23
589 0.24
590 0.26
591 0.26
592 0.26
593 0.28
594 0.25
595 0.23
596 0.22
597 0.2
598 0.16
599 0.15
600 0.12
601 0.11
602 0.1
603 0.1
604 0.09
605 0.1
606 0.1
607 0.1
608 0.13
609 0.16
610 0.17
611 0.17
612 0.18
613 0.2
614 0.23
615 0.24
616 0.23