Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QBR4

Protein Details
Accession W1QBR4    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-132FRRSRYNPYQEMKRHRRRQQAQDAAGHydrophilic
255-282SSSTSNSTKKSKKKREEPEDKKKPKIEIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
157-175IKRERDKSEEEGEKRKRAR
263-280KKSKKKREEPEDKKKPKI
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG opa:HPODL_01866  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
Amino Acid Sequences MSSRRTRRQPEPQKDYGDSEENRSYDEESLEEVTRCICGNDELVIPDDAGPEFDEVDTGFFIQCESCSVWQHGFCVGITDEDTAPEKYWCEQCQPQHHDLFTDKYGFRRSRYNPYQEMKRHRRRQQAQDAAGTAASAGSGSGSPPASAAETPSKPEIKRERDKSEEEGEKRKRARGTLNSRDAEYEQMLKRVLEESAKESGVQPDDVNLSSSNESASRETRSRKKVKDDNSQEEDITQHSNLSQPQKTTPPSSASSSTSNSTKKSKKKREEPEDKKKPKIEISDEKPFKPNLPSQKISMNEMRRRVFSIMEFVSNIQAELSNEEDFKRSLLNYTSEDSTDEILRLQKLLIECYNESVTKLDSLTEKLNTWEKSYG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.72
3 0.67
4 0.64
5 0.54
6 0.52
7 0.5
8 0.42
9 0.4
10 0.37
11 0.33
12 0.27
13 0.26
14 0.2
15 0.17
16 0.2
17 0.2
18 0.19
19 0.17
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.13
24 0.11
25 0.1
26 0.12
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.16
31 0.16
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.09
52 0.11
53 0.13
54 0.16
55 0.19
56 0.22
57 0.23
58 0.24
59 0.22
60 0.2
61 0.17
62 0.18
63 0.15
64 0.13
65 0.13
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.15
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.16
75 0.21
76 0.22
77 0.26
78 0.31
79 0.37
80 0.47
81 0.53
82 0.55
83 0.54
84 0.52
85 0.48
86 0.45
87 0.42
88 0.34
89 0.32
90 0.27
91 0.26
92 0.34
93 0.34
94 0.33
95 0.38
96 0.41
97 0.47
98 0.55
99 0.59
100 0.59
101 0.63
102 0.71
103 0.69
104 0.75
105 0.76
106 0.78
107 0.8
108 0.81
109 0.85
110 0.85
111 0.88
112 0.88
113 0.86
114 0.79
115 0.72
116 0.64
117 0.54
118 0.44
119 0.33
120 0.22
121 0.12
122 0.08
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.1
136 0.14
137 0.14
138 0.16
139 0.19
140 0.23
141 0.22
142 0.3
143 0.37
144 0.4
145 0.49
146 0.55
147 0.58
148 0.6
149 0.63
150 0.6
151 0.58
152 0.56
153 0.5
154 0.53
155 0.51
156 0.52
157 0.51
158 0.51
159 0.46
160 0.42
161 0.47
162 0.47
163 0.53
164 0.56
165 0.62
166 0.58
167 0.56
168 0.53
169 0.45
170 0.37
171 0.27
172 0.23
173 0.15
174 0.16
175 0.16
176 0.14
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.09
181 0.1
182 0.11
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.12
204 0.14
205 0.18
206 0.25
207 0.33
208 0.42
209 0.49
210 0.53
211 0.61
212 0.65
213 0.7
214 0.74
215 0.75
216 0.74
217 0.71
218 0.67
219 0.57
220 0.5
221 0.41
222 0.32
223 0.24
224 0.16
225 0.1
226 0.09
227 0.11
228 0.15
229 0.21
230 0.21
231 0.21
232 0.24
233 0.29
234 0.32
235 0.33
236 0.32
237 0.3
238 0.31
239 0.33
240 0.33
241 0.3
242 0.3
243 0.3
244 0.29
245 0.3
246 0.3
247 0.29
248 0.35
249 0.41
250 0.47
251 0.57
252 0.65
253 0.71
254 0.79
255 0.86
256 0.89
257 0.92
258 0.93
259 0.93
260 0.94
261 0.9
262 0.88
263 0.82
264 0.76
265 0.71
266 0.68
267 0.66
268 0.65
269 0.65
270 0.68
271 0.67
272 0.64
273 0.61
274 0.53
275 0.47
276 0.43
277 0.42
278 0.42
279 0.47
280 0.47
281 0.46
282 0.52
283 0.5
284 0.5
285 0.51
286 0.5
287 0.49
288 0.54
289 0.54
290 0.49
291 0.51
292 0.47
293 0.41
294 0.33
295 0.33
296 0.27
297 0.26
298 0.25
299 0.22
300 0.24
301 0.21
302 0.19
303 0.12
304 0.12
305 0.11
306 0.12
307 0.14
308 0.13
309 0.13
310 0.14
311 0.16
312 0.15
313 0.15
314 0.15
315 0.13
316 0.16
317 0.19
318 0.22
319 0.23
320 0.26
321 0.28
322 0.26
323 0.26
324 0.24
325 0.22
326 0.19
327 0.17
328 0.15
329 0.17
330 0.17
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.17
335 0.21
336 0.22
337 0.24
338 0.24
339 0.28
340 0.31
341 0.28
342 0.28
343 0.25
344 0.23
345 0.2
346 0.19
347 0.18
348 0.17
349 0.2
350 0.24
351 0.25
352 0.24
353 0.27
354 0.35
355 0.34