Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QLE1

Protein Details
Accession W1QLE1    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-123GVAPRAKMNQQRSRRFRSARDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
401-411RRREENDKRRK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG opa:HPODL_04821  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSRKYPKIISPVIEEEPIVVGDVEQPVQYSNPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPPPETEAEMMVEIFRYTDRVLNMARPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSARDAALAQEELERQIQEREMRGEEIDLAIKGKKSWDSNSITPGTPFMDILARSLRYWVAYKLANDPGWASLQVIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRSDPEYNPNTTHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKVLREDVFAKDQAQRQLKLADQVNMDEATRQRLLAADQKKPFLWLHVSILREYLEVELNIPRLSFNFDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDVRDNGIDILVDIWKRVLPSMKDYLTCDGKLNLEGVETLMSHLAQKEDEIFRKRYEGERRREENDKRRKLEREQTNAVKNQLLKTVTKGKEKAPIMPTQNMTLTSLTTGETAGGLKMTNSEIVQNINTISKANAANKNVADILKKALFNNTEANGNASAVSVVKEAEIEEQEPIDVSEKKRSASAAFNSDSEQSDAEVIDTTDSIRLWEPGYKTRYYQQKFETTDAEEIEKIRKDMVRCYVEGISWALLYYFQGCPSWNWYYPYHYAPFAADFTNLSDIKVEFKQGTPFRPFEQLMSVLPAASGHNLPEVFRPLMSEPHSEIIDFYPTDFKIDMNGAKMAWQGICLLPFIDETRLLKTVREKYSELTEYEIERNTNRNEVLFLGRKNKYFDKFLKFYETKNKEEIYIHARKTGLAGKVFIMDKFDPKGTLKYELDVATDQYFDISNDTYLAMEYRLPAKVNSKSMLLAGYRPHLKLLTQQDKDQIVYSSNKFYRNNRNFQARNDIDYKPHIGPHGDTMYTMRVGGYKSFIHMYQEQAQSQAYQPPAQNSYQNQGYNNYQNQGYNNYQNQGYNNYNQGYNRGYNNYNNQNYNNANYNNYQGYGQRQNQGQYYNEFQRRPNRGNSRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.66
4 0.66
5 0.61
6 0.58
7 0.57
8 0.53
9 0.46
10 0.39
11 0.32
12 0.27
13 0.23
14 0.17
15 0.11
16 0.08
17 0.1
18 0.12
19 0.11
20 0.1
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.15
25 0.16
26 0.23
27 0.3
28 0.32
29 0.33
30 0.34
31 0.37
32 0.36
33 0.36
34 0.29
35 0.23
36 0.22
37 0.21
38 0.18
39 0.15
40 0.13
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.13
48 0.18
49 0.24
50 0.27
51 0.36
52 0.46
53 0.52
54 0.58
55 0.58
56 0.57
57 0.57
58 0.56
59 0.48
60 0.41
61 0.35
62 0.29
63 0.26
64 0.21
65 0.16
66 0.12
67 0.11
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.13
72 0.14
73 0.17
74 0.19
75 0.27
76 0.37
77 0.43
78 0.45
79 0.44
80 0.45
81 0.44
82 0.44
83 0.39
84 0.32
85 0.29
86 0.26
87 0.24
88 0.24
89 0.21
90 0.2
91 0.18
92 0.15
93 0.1
94 0.13
95 0.19
96 0.26
97 0.36
98 0.45
99 0.55
100 0.66
101 0.74
102 0.8
103 0.84
104 0.82
105 0.79
106 0.8
107 0.78
108 0.72
109 0.69
110 0.61
111 0.52
112 0.5
113 0.43
114 0.33
115 0.26
116 0.22
117 0.18
118 0.18
119 0.17
120 0.14
121 0.16
122 0.19
123 0.21
124 0.23
125 0.26
126 0.26
127 0.28
128 0.27
129 0.25
130 0.22
131 0.19
132 0.17
133 0.14
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.16
139 0.2
140 0.23
141 0.27
142 0.34
143 0.39
144 0.41
145 0.47
146 0.47
147 0.42
148 0.38
149 0.35
150 0.29
151 0.22
152 0.19
153 0.13
154 0.14
155 0.13
156 0.15
157 0.18
158 0.18
159 0.17
160 0.19
161 0.19
162 0.17
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.2
167 0.22
168 0.26
169 0.31
170 0.29
171 0.28
172 0.27
173 0.24
174 0.22
175 0.21
176 0.16
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.13
195 0.14
196 0.16
197 0.18
198 0.22
199 0.29
200 0.31
201 0.33
202 0.35
203 0.4
204 0.42
205 0.41
206 0.47
207 0.43
208 0.44
209 0.43
210 0.39
211 0.39
212 0.36
213 0.33
214 0.23
215 0.21
216 0.17
217 0.17
218 0.16
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.07
225 0.05
226 0.04
227 0.03
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.08
232 0.09
233 0.12
234 0.14
235 0.15
236 0.18
237 0.21
238 0.22
239 0.25
240 0.26
241 0.27
242 0.28
243 0.29
244 0.27
245 0.27
246 0.3
247 0.34
248 0.37
249 0.35
250 0.34
251 0.36
252 0.35
253 0.37
254 0.35
255 0.31
256 0.26
257 0.26
258 0.26
259 0.23
260 0.22
261 0.18
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.16
269 0.21
270 0.26
271 0.29
272 0.32
273 0.34
274 0.34
275 0.36
276 0.34
277 0.29
278 0.28
279 0.23
280 0.26
281 0.27
282 0.28
283 0.26
284 0.27
285 0.23
286 0.19
287 0.17
288 0.13
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.15
302 0.15
303 0.16
304 0.17
305 0.18
306 0.14
307 0.15
308 0.12
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.08
328 0.12
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.15
334 0.14
335 0.14
336 0.09
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.09
346 0.13
347 0.13
348 0.18
349 0.24
350 0.25
351 0.26
352 0.27
353 0.3
354 0.28
355 0.28
356 0.24
357 0.19
358 0.18
359 0.17
360 0.16
361 0.12
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.09
376 0.12
377 0.18
378 0.22
379 0.24
380 0.24
381 0.26
382 0.28
383 0.32
384 0.4
385 0.44
386 0.48
387 0.56
388 0.6
389 0.62
390 0.69
391 0.7
392 0.7
393 0.72
394 0.72
395 0.66
396 0.69
397 0.7
398 0.69
399 0.69
400 0.68
401 0.65
402 0.64
403 0.65
404 0.64
405 0.61
406 0.55
407 0.47
408 0.39
409 0.32
410 0.29
411 0.24
412 0.19
413 0.21
414 0.29
415 0.31
416 0.35
417 0.36
418 0.34
419 0.4
420 0.41
421 0.43
422 0.37
423 0.39
424 0.37
425 0.39
426 0.38
427 0.31
428 0.31
429 0.25
430 0.23
431 0.17
432 0.14
433 0.1
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.07
459 0.09
460 0.11
461 0.16
462 0.2
463 0.21
464 0.23
465 0.23
466 0.24
467 0.22
468 0.2
469 0.16
470 0.12
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.14
475 0.16
476 0.16
477 0.17
478 0.19
479 0.17
480 0.16
481 0.15
482 0.16
483 0.13
484 0.12
485 0.11
486 0.08
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.09
505 0.1
506 0.17
507 0.18
508 0.19
509 0.19
510 0.2
511 0.2
512 0.23
513 0.25
514 0.24
515 0.24
516 0.24
517 0.24
518 0.25
519 0.23
520 0.18
521 0.15
522 0.09
523 0.09
524 0.08
525 0.07
526 0.06
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.11
538 0.13
539 0.19
540 0.23
541 0.23
542 0.24
543 0.29
544 0.38
545 0.38
546 0.41
547 0.4
548 0.44
549 0.46
550 0.47
551 0.43
552 0.36
553 0.35
554 0.3
555 0.26
556 0.18
557 0.16
558 0.17
559 0.16
560 0.13
561 0.14
562 0.16
563 0.16
564 0.2
565 0.28
566 0.27
567 0.27
568 0.3
569 0.28
570 0.25
571 0.25
572 0.21
573 0.13
574 0.1
575 0.09
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.08
583 0.09
584 0.09
585 0.15
586 0.19
587 0.19
588 0.22
589 0.23
590 0.27
591 0.3
592 0.32
593 0.29
594 0.25
595 0.23
596 0.2
597 0.2
598 0.17
599 0.14
600 0.11
601 0.1
602 0.1
603 0.15
604 0.14
605 0.13
606 0.12
607 0.12
608 0.15
609 0.15
610 0.16
611 0.12
612 0.13
613 0.21
614 0.22
615 0.28
616 0.29
617 0.3
618 0.31
619 0.35
620 0.35
621 0.28
622 0.28
623 0.24
624 0.2
625 0.21
626 0.19
627 0.14
628 0.13
629 0.12
630 0.1
631 0.1
632 0.09
633 0.06
634 0.09
635 0.09
636 0.1
637 0.11
638 0.15
639 0.14
640 0.13
641 0.15
642 0.14
643 0.19
644 0.21
645 0.21
646 0.19
647 0.21
648 0.22
649 0.19
650 0.19
651 0.15
652 0.15
653 0.12
654 0.12
655 0.13
656 0.13
657 0.15
658 0.14
659 0.13
660 0.12
661 0.15
662 0.16
663 0.14
664 0.15
665 0.13
666 0.14
667 0.14
668 0.13
669 0.1
670 0.1
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.08
676 0.08
677 0.08
678 0.09
679 0.09
680 0.11
681 0.11
682 0.14
683 0.17
684 0.17
685 0.18
686 0.25
687 0.33
688 0.36
689 0.39
690 0.37
691 0.37
692 0.44
693 0.45
694 0.37
695 0.31
696 0.28
697 0.27
698 0.28
699 0.27
700 0.21
701 0.2
702 0.24
703 0.22
704 0.25
705 0.22
706 0.2
707 0.2
708 0.21
709 0.26
710 0.26
711 0.28
712 0.32
713 0.35
714 0.37
715 0.42
716 0.46
717 0.44
718 0.47
719 0.51
720 0.51
721 0.51
722 0.51
723 0.56
724 0.51
725 0.51
726 0.54
727 0.52
728 0.47
729 0.48
730 0.46
731 0.39
732 0.39
733 0.39
734 0.37
735 0.39
736 0.36
737 0.35
738 0.35
739 0.32
740 0.34
741 0.35
742 0.31
743 0.25
744 0.25
745 0.22
746 0.26
747 0.27
748 0.24
749 0.23
750 0.2
751 0.21
752 0.23
753 0.23
754 0.21
755 0.23
756 0.27
757 0.25
758 0.31
759 0.29
760 0.27
761 0.3
762 0.28
763 0.28
764 0.24
765 0.24
766 0.17
767 0.16
768 0.15
769 0.12
770 0.11
771 0.09
772 0.1
773 0.09
774 0.09
775 0.09
776 0.09
777 0.09
778 0.09
779 0.09
780 0.08
781 0.08
782 0.09
783 0.11
784 0.13
785 0.14
786 0.16
787 0.22
788 0.27
789 0.32
790 0.32
791 0.3
792 0.29
793 0.29
794 0.3
795 0.25
796 0.22
797 0.19
798 0.24
799 0.26
800 0.26
801 0.27
802 0.24
803 0.24
804 0.29
805 0.37
806 0.41
807 0.41
808 0.43
809 0.47
810 0.49
811 0.49
812 0.43
813 0.33
814 0.26
815 0.29
816 0.29
817 0.32
818 0.34
819 0.4
820 0.42
821 0.49
822 0.57
823 0.6
824 0.67
825 0.65
826 0.73
827 0.7
828 0.7
829 0.73
830 0.64
831 0.61
832 0.56
833 0.5
834 0.43
835 0.43
836 0.44
837 0.34
838 0.34
839 0.31
840 0.28
841 0.28
842 0.31
843 0.31
844 0.27
845 0.25
846 0.25
847 0.25
848 0.24
849 0.22
850 0.15
851 0.13
852 0.15
853 0.16
854 0.17
855 0.15
856 0.17
857 0.2
858 0.2
859 0.23
860 0.24
861 0.28
862 0.33
863 0.37
864 0.35
865 0.34
866 0.34
867 0.3
868 0.3
869 0.3
870 0.25
871 0.24
872 0.26
873 0.3
874 0.33
875 0.34
876 0.38
877 0.35
878 0.4
879 0.42
880 0.43
881 0.39
882 0.4
883 0.44
884 0.47
885 0.47
886 0.43
887 0.39
888 0.38
889 0.39
890 0.41
891 0.4
892 0.4
893 0.4
894 0.4
895 0.4
896 0.4
897 0.4
898 0.4
899 0.39
900 0.35
901 0.37
902 0.36
903 0.37
904 0.36
905 0.38
906 0.36
907 0.36
908 0.36
909 0.36
910 0.38
911 0.42
912 0.51
913 0.56
914 0.58
915 0.58
916 0.55
917 0.57
918 0.56
919 0.53
920 0.52
921 0.44
922 0.41
923 0.38
924 0.41
925 0.36
926 0.34
927 0.31
928 0.26
929 0.31
930 0.37
931 0.41
932 0.42
933 0.44
934 0.47
935 0.5
936 0.52
937 0.47
938 0.43
939 0.46
940 0.49
941 0.53
942 0.51
943 0.53
944 0.59
945 0.65
946 0.66
947 0.68