Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QBV6

Protein Details
Accession W1QBV6    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-182RLANTQGKKAKRKARERMLAESRRHydrophilic
255-276NLEHDKQDKKRRRQAKEAHTTFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-206GKKAKRKARERMLAESRRVAIVQKRRELKQAGINSKFRTKKK
264-266KRR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047242  CDC5L/Cef1  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR047240  SANT_CDC5L_II  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG opa:HPODL_01903  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
cd11659  SANT_CDC5_II  
Amino Acid Sequences MAPIYVKGGVWTNVEDAILKAAISKYGLNQWARVSSLLEKKTAKQCKMRWQEWLDPRIKKLEWTKEEDQKLLELVRLRPNQWNSVSMLMNRTANQCIERYQQLLDDNLDDSDLRLTGNMQQAASGADSLNLNPESKPARPDFEDMDDDEREMLSEARARLANTQGKKAKRKARERMLAESRRVAIVQKRRELKQAGINSKFRTKKKFATQMDYNNDVAFAREPEEGRFDTSEEKLQNHRERHEFDEKAERNQAPNLEHDKQDKKRRRQAKEAHTTFQGAAQSYDDDLEFKKRKLELSAPEEDQKVVDIDAKIKDATKELNRATHEKSILFTKADEDEEEESDPLEPKESLSSKLAKLPAPLNDFEIMDSDGEQEPMPQPEPKIETVSVRDVPKAETVHKIADLKLPAPDHKSLLELAKQSSGVDRLVLEEMARLVEGEVSGVENPEIVEAAIEAELSTLDYNKYVAVVENGSATDNAEQLLKNIRQVSEQSGRLEKKFAALTNGYLRNQAALCKDIANKYGVLSDLDRECVVYEQVKRLEERAIDYRSSSLQESIDRMSVAIGEAQQRLRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.14
4 0.15
5 0.13
6 0.11
7 0.12
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.22
14 0.29
15 0.28
16 0.31
17 0.32
18 0.33
19 0.34
20 0.32
21 0.28
22 0.28
23 0.36
24 0.35
25 0.38
26 0.38
27 0.44
28 0.53
29 0.6
30 0.6
31 0.61
32 0.66
33 0.71
34 0.79
35 0.75
36 0.75
37 0.73
38 0.75
39 0.74
40 0.76
41 0.73
42 0.67
43 0.66
44 0.63
45 0.56
46 0.54
47 0.54
48 0.56
49 0.54
50 0.58
51 0.64
52 0.66
53 0.69
54 0.63
55 0.55
56 0.46
57 0.41
58 0.34
59 0.29
60 0.24
61 0.25
62 0.33
63 0.35
64 0.37
65 0.43
66 0.46
67 0.5
68 0.48
69 0.45
70 0.38
71 0.39
72 0.39
73 0.32
74 0.32
75 0.27
76 0.27
77 0.26
78 0.26
79 0.24
80 0.24
81 0.24
82 0.22
83 0.23
84 0.26
85 0.27
86 0.26
87 0.24
88 0.26
89 0.26
90 0.26
91 0.24
92 0.2
93 0.18
94 0.16
95 0.16
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.07
101 0.06
102 0.07
103 0.12
104 0.18
105 0.19
106 0.18
107 0.18
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.14
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.16
121 0.18
122 0.2
123 0.25
124 0.23
125 0.28
126 0.3
127 0.33
128 0.32
129 0.33
130 0.34
131 0.31
132 0.32
133 0.27
134 0.24
135 0.22
136 0.18
137 0.13
138 0.12
139 0.1
140 0.07
141 0.11
142 0.11
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.17
147 0.24
148 0.3
149 0.29
150 0.37
151 0.41
152 0.48
153 0.56
154 0.62
155 0.64
156 0.67
157 0.75
158 0.77
159 0.81
160 0.83
161 0.79
162 0.8
163 0.81
164 0.77
165 0.69
166 0.62
167 0.52
168 0.43
169 0.39
170 0.32
171 0.29
172 0.32
173 0.37
174 0.41
175 0.46
176 0.47
177 0.53
178 0.53
179 0.49
180 0.49
181 0.5
182 0.52
183 0.52
184 0.55
185 0.51
186 0.56
187 0.59
188 0.56
189 0.55
190 0.53
191 0.55
192 0.61
193 0.68
194 0.65
195 0.66
196 0.68
197 0.69
198 0.68
199 0.63
200 0.54
201 0.43
202 0.38
203 0.3
204 0.23
205 0.15
206 0.1
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.15
212 0.15
213 0.16
214 0.15
215 0.14
216 0.15
217 0.16
218 0.19
219 0.17
220 0.19
221 0.22
222 0.3
223 0.36
224 0.37
225 0.4
226 0.41
227 0.43
228 0.48
229 0.52
230 0.44
231 0.39
232 0.46
233 0.43
234 0.41
235 0.44
236 0.38
237 0.31
238 0.32
239 0.33
240 0.23
241 0.27
242 0.31
243 0.27
244 0.28
245 0.33
246 0.39
247 0.44
248 0.53
249 0.58
250 0.6
251 0.68
252 0.75
253 0.77
254 0.79
255 0.81
256 0.81
257 0.82
258 0.77
259 0.7
260 0.61
261 0.55
262 0.45
263 0.37
264 0.28
265 0.17
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.13
275 0.15
276 0.15
277 0.19
278 0.2
279 0.21
280 0.24
281 0.29
282 0.29
283 0.33
284 0.37
285 0.35
286 0.36
287 0.35
288 0.31
289 0.25
290 0.18
291 0.12
292 0.09
293 0.1
294 0.08
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.11
302 0.16
303 0.16
304 0.22
305 0.22
306 0.27
307 0.28
308 0.32
309 0.34
310 0.34
311 0.32
312 0.26
313 0.26
314 0.24
315 0.23
316 0.2
317 0.17
318 0.14
319 0.15
320 0.15
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.14
325 0.14
326 0.12
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.09
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.12
335 0.13
336 0.15
337 0.17
338 0.21
339 0.2
340 0.25
341 0.27
342 0.24
343 0.25
344 0.26
345 0.29
346 0.29
347 0.28
348 0.26
349 0.24
350 0.23
351 0.21
352 0.19
353 0.13
354 0.1
355 0.09
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.12
363 0.13
364 0.12
365 0.12
366 0.16
367 0.19
368 0.2
369 0.22
370 0.21
371 0.22
372 0.24
373 0.28
374 0.29
375 0.27
376 0.27
377 0.24
378 0.24
379 0.26
380 0.25
381 0.22
382 0.22
383 0.24
384 0.24
385 0.26
386 0.26
387 0.22
388 0.25
389 0.24
390 0.2
391 0.22
392 0.22
393 0.22
394 0.25
395 0.25
396 0.22
397 0.21
398 0.22
399 0.2
400 0.21
401 0.22
402 0.2
403 0.2
404 0.2
405 0.19
406 0.18
407 0.18
408 0.17
409 0.14
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.12
414 0.12
415 0.1
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.06
421 0.05
422 0.06
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.08
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.1
467 0.18
468 0.18
469 0.22
470 0.25
471 0.25
472 0.27
473 0.29
474 0.35
475 0.35
476 0.37
477 0.37
478 0.42
479 0.45
480 0.43
481 0.44
482 0.37
483 0.34
484 0.34
485 0.32
486 0.3
487 0.28
488 0.31
489 0.36
490 0.42
491 0.37
492 0.36
493 0.34
494 0.31
495 0.3
496 0.3
497 0.24
498 0.2
499 0.21
500 0.22
501 0.27
502 0.27
503 0.29
504 0.27
505 0.24
506 0.23
507 0.24
508 0.21
509 0.2
510 0.18
511 0.2
512 0.19
513 0.21
514 0.2
515 0.18
516 0.18
517 0.17
518 0.19
519 0.19
520 0.22
521 0.27
522 0.32
523 0.34
524 0.35
525 0.35
526 0.38
527 0.35
528 0.37
529 0.37
530 0.37
531 0.35
532 0.35
533 0.36
534 0.33
535 0.33
536 0.29
537 0.24
538 0.22
539 0.24
540 0.26
541 0.27
542 0.26
543 0.23
544 0.21
545 0.19
546 0.17
547 0.15
548 0.14
549 0.13
550 0.16
551 0.19