Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QHL9

Protein Details
Accession W1QHL9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-272SAPVIKRLKSKVRNKRSDKEELKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-264KSKVRNK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG opa:HPODL_03684  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MEVSLSVEETNQLRAKLGLPLISTGDRPSETKRKNNDLDETNKIRSQLGLPLITSEKADNDPEYENYRRVEDERMKQKQLDELQQRISKTKSDLHRHKLESGETLLARLDKEENTDDEWLAKLGTSQQVKVTRKRKATLEDDDLQGVSVAHNKEDYAELLGESQEVVFTLKDKSVFDEEEDQLESHELAKRRRVKEFLEGQVKENKNGDNKEQDNGFKIGEKIIPKRQTKKLVSLDLDDDEQESQPSDYSAPVIKRLKSKVRNKRSDKEELKEANFQRLKLINEDLEKEDDIELNKFLSASRRQRQESRPIAIEEHQQEEGAVVLDEDADFLEKLNGDDTVEKSENVEEVAEVADTTESNSSLTHVSEKLAVLHDEVDANMGLSRTLKLLKDRAELASKSDGSKINLVYRDDKGRVLNQKEAYKYLSHRFHGHKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.25
4 0.26
5 0.23
6 0.21
7 0.23
8 0.25
9 0.25
10 0.25
11 0.21
12 0.22
13 0.2
14 0.22
15 0.28
16 0.36
17 0.42
18 0.5
19 0.58
20 0.65
21 0.71
22 0.75
23 0.75
24 0.73
25 0.71
26 0.71
27 0.68
28 0.63
29 0.57
30 0.51
31 0.43
32 0.37
33 0.33
34 0.3
35 0.29
36 0.26
37 0.25
38 0.27
39 0.28
40 0.27
41 0.25
42 0.19
43 0.17
44 0.17
45 0.19
46 0.17
47 0.18
48 0.2
49 0.22
50 0.27
51 0.28
52 0.29
53 0.28
54 0.29
55 0.29
56 0.28
57 0.35
58 0.37
59 0.44
60 0.51
61 0.57
62 0.59
63 0.59
64 0.59
65 0.57
66 0.55
67 0.55
68 0.52
69 0.5
70 0.54
71 0.55
72 0.54
73 0.5
74 0.46
75 0.39
76 0.36
77 0.38
78 0.4
79 0.48
80 0.56
81 0.61
82 0.68
83 0.67
84 0.68
85 0.64
86 0.56
87 0.49
88 0.42
89 0.37
90 0.28
91 0.25
92 0.22
93 0.19
94 0.17
95 0.15
96 0.14
97 0.11
98 0.14
99 0.16
100 0.17
101 0.19
102 0.2
103 0.19
104 0.17
105 0.17
106 0.14
107 0.11
108 0.09
109 0.07
110 0.09
111 0.15
112 0.16
113 0.16
114 0.22
115 0.31
116 0.36
117 0.44
118 0.49
119 0.51
120 0.56
121 0.6
122 0.6
123 0.59
124 0.62
125 0.6
126 0.58
127 0.54
128 0.48
129 0.44
130 0.38
131 0.31
132 0.23
133 0.16
134 0.09
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.04
155 0.05
156 0.06
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.12
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.2
168 0.17
169 0.15
170 0.15
171 0.13
172 0.09
173 0.12
174 0.14
175 0.16
176 0.24
177 0.32
178 0.35
179 0.39
180 0.41
181 0.41
182 0.46
183 0.51
184 0.51
185 0.51
186 0.49
187 0.47
188 0.52
189 0.5
190 0.42
191 0.37
192 0.32
193 0.28
194 0.29
195 0.3
196 0.29
197 0.29
198 0.3
199 0.3
200 0.28
201 0.25
202 0.25
203 0.22
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.17
209 0.19
210 0.25
211 0.33
212 0.37
213 0.44
214 0.5
215 0.57
216 0.56
217 0.61
218 0.6
219 0.58
220 0.54
221 0.49
222 0.44
223 0.35
224 0.32
225 0.23
226 0.17
227 0.12
228 0.1
229 0.08
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.07
237 0.1
238 0.1
239 0.17
240 0.21
241 0.23
242 0.29
243 0.35
244 0.43
245 0.5
246 0.6
247 0.64
248 0.71
249 0.79
250 0.81
251 0.85
252 0.81
253 0.82
254 0.78
255 0.71
256 0.7
257 0.64
258 0.59
259 0.58
260 0.52
261 0.51
262 0.47
263 0.43
264 0.38
265 0.37
266 0.35
267 0.3
268 0.32
269 0.25
270 0.25
271 0.28
272 0.24
273 0.22
274 0.21
275 0.19
276 0.17
277 0.15
278 0.14
279 0.13
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.14
286 0.21
287 0.3
288 0.37
289 0.44
290 0.48
291 0.57
292 0.63
293 0.67
294 0.66
295 0.62
296 0.58
297 0.52
298 0.51
299 0.45
300 0.45
301 0.37
302 0.32
303 0.27
304 0.24
305 0.22
306 0.19
307 0.17
308 0.11
309 0.08
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.11
326 0.12
327 0.18
328 0.18
329 0.18
330 0.19
331 0.19
332 0.18
333 0.16
334 0.15
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.11
351 0.13
352 0.12
353 0.13
354 0.15
355 0.16
356 0.17
357 0.18
358 0.18
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.1
373 0.14
374 0.16
375 0.21
376 0.28
377 0.33
378 0.36
379 0.39
380 0.41
381 0.45
382 0.43
383 0.41
384 0.42
385 0.38
386 0.35
387 0.38
388 0.37
389 0.33
390 0.38
391 0.37
392 0.36
393 0.4
394 0.42
395 0.42
396 0.43
397 0.47
398 0.44
399 0.44
400 0.42
401 0.45
402 0.51
403 0.51
404 0.55
405 0.54
406 0.59
407 0.59
408 0.58
409 0.53
410 0.49
411 0.5
412 0.51
413 0.52
414 0.49
415 0.54