Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QFI9

Protein Details
Accession W1QFI9    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-54LEKAVKTLKEKVKETKKKGKGKKKEESESESSDBasic
108-151DSEEEKKEEKKEKKEKKEEKKEKKEKKEKKVKEEKKEEKKESSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-45IKKAVKPAKEALKGKKLEKAVKTLKEKVKETKKKGKGKKK
113-147KKEEKKEKKEKKEEKKEKKEKKEKKVKEEKKEEKK
458-478RGGRGGFGGGRGGARGGFGRE
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG opa:HPODL_00258  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKGDIKKAVKPAKEALKGKKLEKAVKTLKEKVKETKKKGKGKKKEESESESSDSSDSSDSSDSEGEKDSSHSSDSSDSNDSSNSSDSSDSDNSSDSDSSESSDSESDSEEEKKEEKKEKKEKKEEKKEKKEKKEKKVKEEKKEEKKESSDSDSSDSDASGSDSSDSDSSDSDSSDSSDSDSSDSSNSSDSDSDSEEKKEKSTVKKQSSSSDSDSSDSDGSDSDSSDSDSSESASDASEPRKRKAEEEQETPSKKPKEVATLFVGRLAWAVDDQRLLEEFQSLDGVLSARVMTERETGRSRGYGYVDFESKEQAQKALEQFQGREIEGRPINLDMSTSKPQTPSQNQKFQDRAKKYGDTPSQPSDTLFVGNLSFQADRDTLKEFFEQHGTVLGIRIPTHPESEQPKGFGYVQFGSVDEAKAALEALNGEYIAGRPVRLDFSAPRDPNGGSRNGTPTPRGGRGGFGGGRGGARGGFGRERSSGSGSNSIPVAFKGKKKTFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.7
3 0.7
4 0.71
5 0.73
6 0.71
7 0.69
8 0.67
9 0.66
10 0.64
11 0.64
12 0.64
13 0.68
14 0.73
15 0.75
16 0.75
17 0.75
18 0.76
19 0.76
20 0.78
21 0.79
22 0.81
23 0.82
24 0.84
25 0.86
26 0.91
27 0.91
28 0.91
29 0.91
30 0.92
31 0.92
32 0.92
33 0.89
34 0.87
35 0.82
36 0.77
37 0.7
38 0.6
39 0.5
40 0.4
41 0.32
42 0.25
43 0.19
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.15
52 0.18
53 0.16
54 0.15
55 0.17
56 0.18
57 0.18
58 0.19
59 0.17
60 0.16
61 0.19
62 0.2
63 0.22
64 0.23
65 0.22
66 0.21
67 0.21
68 0.21
69 0.19
70 0.19
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.19
79 0.19
80 0.18
81 0.2
82 0.19
83 0.14
84 0.14
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.11
93 0.12
94 0.11
95 0.13
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.19
100 0.24
101 0.3
102 0.38
103 0.45
104 0.53
105 0.63
106 0.72
107 0.8
108 0.86
109 0.9
110 0.91
111 0.94
112 0.95
113 0.95
114 0.96
115 0.96
116 0.95
117 0.96
118 0.96
119 0.94
120 0.94
121 0.94
122 0.92
123 0.92
124 0.93
125 0.91
126 0.91
127 0.92
128 0.91
129 0.91
130 0.92
131 0.87
132 0.83
133 0.77
134 0.72
135 0.66
136 0.62
137 0.54
138 0.45
139 0.42
140 0.35
141 0.32
142 0.26
143 0.21
144 0.14
145 0.11
146 0.11
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.16
183 0.18
184 0.19
185 0.19
186 0.23
187 0.26
188 0.33
189 0.42
190 0.49
191 0.54
192 0.6
193 0.61
194 0.63
195 0.62
196 0.59
197 0.53
198 0.47
199 0.4
200 0.34
201 0.32
202 0.27
203 0.22
204 0.17
205 0.12
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.11
225 0.16
226 0.19
227 0.21
228 0.27
229 0.28
230 0.3
231 0.38
232 0.45
233 0.45
234 0.48
235 0.51
236 0.52
237 0.53
238 0.51
239 0.49
240 0.4
241 0.35
242 0.34
243 0.3
244 0.32
245 0.32
246 0.35
247 0.32
248 0.34
249 0.33
250 0.31
251 0.28
252 0.18
253 0.17
254 0.13
255 0.09
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.06
280 0.1
281 0.11
282 0.14
283 0.17
284 0.18
285 0.19
286 0.2
287 0.21
288 0.19
289 0.21
290 0.2
291 0.2
292 0.21
293 0.21
294 0.2
295 0.19
296 0.19
297 0.17
298 0.18
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.18
303 0.2
304 0.23
305 0.25
306 0.24
307 0.23
308 0.26
309 0.27
310 0.23
311 0.23
312 0.18
313 0.22
314 0.22
315 0.22
316 0.19
317 0.17
318 0.18
319 0.15
320 0.15
321 0.09
322 0.14
323 0.18
324 0.19
325 0.2
326 0.22
327 0.25
328 0.33
329 0.41
330 0.47
331 0.51
332 0.58
333 0.6
334 0.65
335 0.69
336 0.68
337 0.69
338 0.64
339 0.61
340 0.58
341 0.59
342 0.55
343 0.57
344 0.56
345 0.51
346 0.51
347 0.5
348 0.47
349 0.43
350 0.41
351 0.33
352 0.26
353 0.22
354 0.16
355 0.12
356 0.1
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.13
366 0.16
367 0.15
368 0.17
369 0.19
370 0.18
371 0.2
372 0.23
373 0.21
374 0.18
375 0.19
376 0.18
377 0.16
378 0.15
379 0.14
380 0.11
381 0.12
382 0.13
383 0.15
384 0.16
385 0.19
386 0.19
387 0.24
388 0.29
389 0.35
390 0.36
391 0.34
392 0.33
393 0.33
394 0.34
395 0.3
396 0.28
397 0.23
398 0.22
399 0.21
400 0.2
401 0.19
402 0.18
403 0.17
404 0.12
405 0.11
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.06
410 0.05
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.1
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.11
423 0.14
424 0.14
425 0.18
426 0.18
427 0.26
428 0.36
429 0.36
430 0.36
431 0.36
432 0.36
433 0.39
434 0.39
435 0.36
436 0.29
437 0.32
438 0.36
439 0.38
440 0.4
441 0.36
442 0.39
443 0.41
444 0.43
445 0.43
446 0.38
447 0.36
448 0.36
449 0.41
450 0.35
451 0.29
452 0.26
453 0.22
454 0.22
455 0.19
456 0.17
457 0.1
458 0.11
459 0.12
460 0.15
461 0.18
462 0.2
463 0.23
464 0.25
465 0.28
466 0.3
467 0.34
468 0.33
469 0.33
470 0.38
471 0.35
472 0.36
473 0.33
474 0.3
475 0.26
476 0.24
477 0.27
478 0.25
479 0.31
480 0.4