FuNGI

W1QDM1

Protein Details

Accession

W1QDM1

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
71-111	LSALKETKKAKFKNKLLRVSIAKRRQRKDKKDNQAKPAEDA	Hydrophilic
518-542	EEKLGVKPEDKKRKKQTGVVKQAKI	Basic
642-662	GQDNGRDRKRQREGGRDERAG	Basic
665-687	RRGANGRPNDSKRRKTDTQTAPE	Hydrophilic
693-712	LPNDVKRLIGFKRKRRHAKK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
77-108	TKKAKFKNKLLRVSIAKRRQRKDKKDNQAKPA
520-532	KLGVKPEDKKRKK
632-679	KAKNHRKDGEGQDNGRDRKRQREGGRDERAGGGRRGANGRPNDSKRRK
698-712	KRLIGFKRKRRHAKK

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034809 Nop4_RRM4 IPR034808 Nop4p_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	opa:HPODL_01883 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12676 RRM3_Nop4p cd12677 RRM4_Nop4p

Amino Acid Sequences

MTDKQPAAEGEDHLDRRTLFVQSIPVEATKEELNEFFSQYAPVRHSVIVTDTEGKSRGFGFVSFVTDEDALSALKETKKAKFKNKLLRVSIAKRRQRKDKKDNQAKPAEDAKFKSQEIALKKSAKLIVRNLPWSVKDPNELVKVFLKFGKVKEAHIPKKKDGKMSGFGFVTMMKHAAAEKAVKETVGLKLQGREVAVDFAIDKSKWEEFRKEKSEEGEEDEEEDDEEDEDEEREDEEQEEDEEDEEGEEDEEDEGEVKEEKKADDSEDDESDSDGEDLNFNRPRPNKQENFSIFVRNVPYDATRESLEEHFSKFGPIKYALPVMDKDTQLAKGSAFVAFRREEDYEECLLNAPEVNPNSMLIPDDVSPLYVYEGRVLQITATVDRDSAARMAERNALARKELLGRVPTEKDKRNLFLLNEGRITSGSRLASLISKTDLDVREKSYNLRVQQLNKNPSLHLSLTRLAIRNLPRAMNEKALKALGRKAIVQFAAEVKEGKRQPLNKEELARSQRHKEFIEEKLGVKPEDKKRKKQTGVVKQAKIINEVKGSGVLGRSRGYGFLEFRDHKHALMALRWLNAHEVSREDILVGLTEEQKKVAESEGTIAKRRLIVEFAIENAKVVKRRHEQIAYSKAKNHRKDGEGQDNGRDRKRQREGGRDERAGGGRRGANGRPNDSKRRKTDTQTAPEASKSGLPNDVKRLIGFKRKRRHAKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.27
3	0.28
4	0.29
5	0.26
6	0.19
7	0.2
8	0.26
9	0.25
10	0.27
11	0.25
12	0.23
13	0.22
14	0.21
15	0.21
16	0.16
17	0.16
18	0.16
19	0.15
20	0.19
21	0.19
22	0.21
23	0.19
24	0.18
25	0.19
26	0.2
27	0.23
28	0.22
29	0.23
30	0.24
31	0.24
32	0.24
33	0.23
34	0.23
35	0.22
36	0.22
37	0.25
38	0.23
39	0.25
40	0.27
41	0.25
42	0.24
43	0.21
44	0.21
45	0.16
46	0.15
47	0.17
48	0.17
49	0.2
50	0.19
51	0.19
52	0.19
53	0.18
54	0.17
55	0.13
56	0.12
57	0.09
58	0.08
59	0.1
60	0.12
61	0.14
62	0.19
63	0.23
64	0.3
65	0.4
66	0.49
67	0.58
68	0.65
69	0.73
70	0.79
71	0.85
72	0.86
73	0.81
74	0.81
75	0.8
76	0.78
77	0.78
78	0.77
79	0.77
80	0.77
81	0.8
82	0.83
83	0.85
84	0.87
85	0.88
86	0.88
87	0.91
88	0.92
89	0.93
90	0.92
91	0.9
92	0.81
93	0.75
94	0.73
95	0.67
96	0.6
97	0.55
98	0.53
99	0.48
100	0.47
101	0.43
102	0.37
103	0.38
104	0.39
105	0.41
106	0.41
107	0.41
108	0.41
109	0.44
110	0.47
111	0.45
112	0.45
113	0.45
114	0.47
115	0.48
116	0.51
117	0.48
118	0.47
119	0.44
120	0.43
121	0.4
122	0.33
123	0.31
124	0.3
125	0.33
126	0.35
127	0.34
128	0.32
129	0.33
130	0.31
131	0.3
132	0.3
133	0.29
134	0.26
135	0.27
136	0.35
137	0.31
138	0.32
139	0.4
140	0.48
141	0.53
142	0.59
143	0.64
144	0.62
145	0.71
146	0.73
147	0.71
148	0.67
149	0.65
150	0.64
151	0.6
152	0.57
153	0.47
154	0.43
155	0.35
156	0.29
157	0.23
158	0.15
159	0.13
160	0.08
161	0.09
162	0.09
163	0.1
164	0.11
165	0.12
166	0.12
167	0.15
168	0.16
169	0.15
170	0.15
171	0.16
172	0.18
173	0.19
174	0.2
175	0.18
176	0.2
177	0.22
178	0.23
179	0.21
180	0.19
181	0.15
182	0.15
183	0.13
184	0.11
185	0.1
186	0.09
187	0.12
188	0.1
189	0.1
190	0.12
191	0.16
192	0.21
193	0.25
194	0.33
195	0.37
196	0.47
197	0.53
198	0.53
199	0.51
200	0.5
201	0.51
202	0.43
203	0.43
204	0.36
205	0.3
206	0.28
207	0.26
208	0.22
209	0.17
210	0.15
211	0.09
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.07
244	0.07
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.12
249	0.13
250	0.15
251	0.16
252	0.18
253	0.19
254	0.18
255	0.19
256	0.16
257	0.16
258	0.14
259	0.11
260	0.09
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.07
265	0.12
266	0.15
267	0.16
268	0.22
269	0.24
270	0.3
271	0.37
272	0.46
273	0.47
274	0.47
275	0.57
276	0.53
277	0.56
278	0.51
279	0.46
280	0.37
281	0.33
282	0.31
283	0.21
284	0.19
285	0.14
286	0.14
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.11
291	0.12
292	0.14
293	0.13
294	0.16
295	0.15
296	0.15
297	0.14
298	0.14
299	0.15
300	0.15
301	0.15
302	0.15
303	0.16
304	0.16
305	0.16
306	0.18
307	0.17
308	0.17
309	0.17
310	0.18
311	0.2
312	0.19
313	0.18
314	0.17
315	0.17
316	0.17
317	0.16
318	0.12
319	0.1
320	0.1
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.12
325	0.12
326	0.12
327	0.14
328	0.14
329	0.13
330	0.15
331	0.18
332	0.17
333	0.16
334	0.16
335	0.13
336	0.13
337	0.11
338	0.1
339	0.06
340	0.08
341	0.09
342	0.09
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.09
348	0.06
349	0.07
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.07
357	0.08
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.09
379	0.12
380	0.12
381	0.15
382	0.17
383	0.17
384	0.17
385	0.16
386	0.16
387	0.16
388	0.17
389	0.16
390	0.15
391	0.16
392	0.19
393	0.22
394	0.27
395	0.3
396	0.33
397	0.36
398	0.37
399	0.38
400	0.39
401	0.39
402	0.33
403	0.36
404	0.35
405	0.32
406	0.3
407	0.28
408	0.24
409	0.21
410	0.22
411	0.14
412	0.14
413	0.12
414	0.11
415	0.11
416	0.11
417	0.13
418	0.12
419	0.12
420	0.1
421	0.1
422	0.1
423	0.15
424	0.16
425	0.18
426	0.19
427	0.23
428	0.25
429	0.25
430	0.27
431	0.29
432	0.32
433	0.3
434	0.35
435	0.34
436	0.37
437	0.45
438	0.52
439	0.51
440	0.5
441	0.49
442	0.43
443	0.41
444	0.38
445	0.31
446	0.25
447	0.22
448	0.21
449	0.22
450	0.25
451	0.24
452	0.21
453	0.25
454	0.26
455	0.28
456	0.28
457	0.27
458	0.26
459	0.3
460	0.31
461	0.34
462	0.32
463	0.27
464	0.27
465	0.27
466	0.27
467	0.24
468	0.26
469	0.22
470	0.22
471	0.23
472	0.22
473	0.25
474	0.24
475	0.22
476	0.18
477	0.16
478	0.17
479	0.15
480	0.16
481	0.13
482	0.2
483	0.21
484	0.23
485	0.27
486	0.31
487	0.36
488	0.44
489	0.5
490	0.47
491	0.52
492	0.51
493	0.54
494	0.55
495	0.55
496	0.5
497	0.53
498	0.52
499	0.51
500	0.49
501	0.47
502	0.46
503	0.45
504	0.48
505	0.41
506	0.38
507	0.38
508	0.39
509	0.34
510	0.31
511	0.36
512	0.38
513	0.48
514	0.54
515	0.59
516	0.68
517	0.78
518	0.81
519	0.81
520	0.81
521	0.81
522	0.85
523	0.84
524	0.76
525	0.7
526	0.68
527	0.61
528	0.55
529	0.47
530	0.39
531	0.31
532	0.29
533	0.25
534	0.21
535	0.2
536	0.16
537	0.16
538	0.13
539	0.13
540	0.13
541	0.14
542	0.14
543	0.15
544	0.16
545	0.18
546	0.18
547	0.2
548	0.27
549	0.27
550	0.3
551	0.36
552	0.34
553	0.3
554	0.3
555	0.3
556	0.25
557	0.25
558	0.29
559	0.24
560	0.25
561	0.25
562	0.24
563	0.23
564	0.23
565	0.21
566	0.16
567	0.16
568	0.17
569	0.17
570	0.17
571	0.14
572	0.13
573	0.12
574	0.11
575	0.1
576	0.09
577	0.13
578	0.16
579	0.16
580	0.16
581	0.16
582	0.16
583	0.16
584	0.17
585	0.14
586	0.12
587	0.16
588	0.23
589	0.26
590	0.29
591	0.29
592	0.29
593	0.3
594	0.31
595	0.28
596	0.23
597	0.21
598	0.22
599	0.22
600	0.22
601	0.22
602	0.21
603	0.19
604	0.2
605	0.23
606	0.24
607	0.25
608	0.33
609	0.37
610	0.43
611	0.52
612	0.55
613	0.57
614	0.61
615	0.7
616	0.68
617	0.64
618	0.65
619	0.66
620	0.69
621	0.7
622	0.69
623	0.66
624	0.63
625	0.7
626	0.72
627	0.73
628	0.72
629	0.67
630	0.67
631	0.68
632	0.69
633	0.65
634	0.63
635	0.56
636	0.59
637	0.66
638	0.67
639	0.68
640	0.73
641	0.77
642	0.8
643	0.85
644	0.77
645	0.7
646	0.65
647	0.62
648	0.56
649	0.47
650	0.43
651	0.36
652	0.38
653	0.41
654	0.4
655	0.42
656	0.44
657	0.5
658	0.54
659	0.59
660	0.65
661	0.71
662	0.76
663	0.77
664	0.8
665	0.8
666	0.78
667	0.81
668	0.8
669	0.79
670	0.78
671	0.74
672	0.67
673	0.61
674	0.54
675	0.44
676	0.39
677	0.32
678	0.26
679	0.3
680	0.32
681	0.35
682	0.42
683	0.45
684	0.41
685	0.4
686	0.44
687	0.44
688	0.5
689	0.55
690	0.57
691	0.64
692	0.74

W1QDM1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer