Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W1QCW2

Protein Details
Accession W1QCW2    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
307-331PPLGYDEKPRKQRPQRQNPENLTQEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11cyto_nucl 11, nucl 9, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016853  F:isomerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
KEGG opa:HPODL_04460  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDPSGPPSSGEKDQKLDTLDFEETYEGLGEQDEDAFNDETFGADVKEIGSNFDFTGGLKPASKPQTVNPNLSYAKAAQVDQVIAPMASLWNEEAKTADSASSQPASEQRVLSLEEIEAKLRQPQQQVPQMPQMNPYMYQQQQQLLVAAMASGQFPNPAAAAQALAQGYFPPFQPGVMPFMPFQAQQMMQQGALGQGQQPQQVQPPPAGLQVPQVPQVPQSAPAPVQQQQQQQQQQPALQAPQALQSPPVLNAASPPPHSSQPVPQAVEQKVPASASAPSSSATPAPQSVQQVGSSDATGNFPPLGYDEKPRKQRPQRQNPENLTQEEREKLWRRQNKVSAIIRCSGFMNPRDKDFVTRVQLSQIVTDDPYNEDFYCQVYRVLNSSVGEDDMSSIAQKYLDQSGHRLGGREKRADVALQRMQQQVSKAVTVAKERGERTGVLAKEGALGKVSVGSGKQPRKQLVINTTGSSDEVVVPKENVYSKSSRAFQLSVIEDIYSQVLKLESLERENQERDSKDLWNALRLNDTIETSSTVVSPFISVLSIDKAMKVFNRLFHFLNPEQKIKLMEAIFANLHNIDVVMKGSYANYVNENYEIPKTEKSKIELFQMTVMKTLVLFVSESDFQQVLRFVALIVKGGNNNVLFLSTTKIGLSLITILVSRLELIKQEFSAGLSPQDLAQWQTIYDHLFQALEGRLATIFPPYLSNDDARKVRNSESKSDDSYIWQFLASLSLAGLLSHQRIIVDEIRNEIFGSMGVSKALKESGDLQGAEKHLSNLNLFLNVMGLKASESDITEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.41
3 0.41
4 0.43
5 0.45
6 0.46
7 0.46
8 0.42
9 0.35
10 0.33
11 0.3
12 0.26
13 0.25
14 0.22
15 0.17
16 0.17
17 0.15
18 0.1
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.07
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.12
27 0.13
28 0.12
29 0.13
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.08
35 0.07
36 0.08
37 0.08
38 0.12
39 0.11
40 0.14
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.16
46 0.13
47 0.18
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.2
52 0.27
53 0.33
54 0.35
55 0.33
56 0.37
57 0.46
58 0.49
59 0.54
60 0.47
61 0.49
62 0.46
63 0.45
64 0.41
65 0.31
66 0.32
67 0.28
68 0.27
69 0.21
70 0.22
71 0.22
72 0.19
73 0.19
74 0.14
75 0.12
76 0.11
77 0.09
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.14
87 0.15
88 0.14
89 0.14
90 0.11
91 0.13
92 0.16
93 0.17
94 0.15
95 0.16
96 0.19
97 0.23
98 0.26
99 0.25
100 0.22
101 0.22
102 0.24
103 0.23
104 0.2
105 0.16
106 0.17
107 0.17
108 0.18
109 0.16
110 0.15
111 0.21
112 0.25
113 0.3
114 0.31
115 0.38
116 0.45
117 0.53
118 0.56
119 0.54
120 0.59
121 0.58
122 0.53
123 0.5
124 0.45
125 0.38
126 0.35
127 0.33
128 0.32
129 0.28
130 0.31
131 0.31
132 0.3
133 0.3
134 0.29
135 0.27
136 0.2
137 0.18
138 0.13
139 0.1
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.14
167 0.19
168 0.19
169 0.2
170 0.16
171 0.18
172 0.2
173 0.17
174 0.17
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.2
179 0.19
180 0.17
181 0.18
182 0.17
183 0.13
184 0.13
185 0.11
186 0.08
187 0.12
188 0.14
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.22
193 0.25
194 0.25
195 0.22
196 0.23
197 0.21
198 0.23
199 0.22
200 0.17
201 0.17
202 0.21
203 0.21
204 0.22
205 0.22
206 0.2
207 0.21
208 0.24
209 0.2
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.16
214 0.19
215 0.21
216 0.22
217 0.26
218 0.29
219 0.35
220 0.4
221 0.48
222 0.52
223 0.53
224 0.54
225 0.52
226 0.49
227 0.44
228 0.39
229 0.32
230 0.26
231 0.22
232 0.17
233 0.18
234 0.18
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.12
242 0.1
243 0.12
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.18
248 0.19
249 0.21
250 0.23
251 0.23
252 0.26
253 0.31
254 0.35
255 0.34
256 0.34
257 0.39
258 0.38
259 0.39
260 0.34
261 0.26
262 0.22
263 0.2
264 0.17
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.13
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.16
285 0.15
286 0.13
287 0.12
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.11
297 0.11
298 0.18
299 0.26
300 0.33
301 0.43
302 0.48
303 0.58
304 0.64
305 0.73
306 0.78
307 0.81
308 0.85
309 0.84
310 0.89
311 0.84
312 0.81
313 0.74
314 0.66
315 0.57
316 0.48
317 0.41
318 0.33
319 0.28
320 0.29
321 0.31
322 0.35
323 0.41
324 0.46
325 0.5
326 0.57
327 0.63
328 0.61
329 0.64
330 0.64
331 0.59
332 0.55
333 0.52
334 0.44
335 0.37
336 0.33
337 0.26
338 0.23
339 0.23
340 0.27
341 0.25
342 0.26
343 0.29
344 0.28
345 0.29
346 0.28
347 0.29
348 0.27
349 0.28
350 0.27
351 0.25
352 0.27
353 0.24
354 0.21
355 0.16
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.12
373 0.13
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.11
378 0.1
379 0.1
380 0.08
381 0.07
382 0.05
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.08
391 0.1
392 0.11
393 0.13
394 0.15
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.18
399 0.24
400 0.28
401 0.28
402 0.26
403 0.24
404 0.25
405 0.25
406 0.23
407 0.22
408 0.22
409 0.23
410 0.26
411 0.26
412 0.26
413 0.26
414 0.26
415 0.23
416 0.19
417 0.17
418 0.14
419 0.14
420 0.16
421 0.16
422 0.17
423 0.16
424 0.2
425 0.2
426 0.21
427 0.21
428 0.19
429 0.21
430 0.25
431 0.21
432 0.18
433 0.18
434 0.16
435 0.18
436 0.18
437 0.15
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.06
444 0.05
445 0.1
446 0.17
447 0.23
448 0.28
449 0.32
450 0.34
451 0.37
452 0.39
453 0.41
454 0.39
455 0.39
456 0.37
457 0.33
458 0.31
459 0.28
460 0.25
461 0.2
462 0.14
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.11
470 0.13
471 0.13
472 0.16
473 0.17
474 0.19
475 0.23
476 0.25
477 0.25
478 0.26
479 0.24
480 0.22
481 0.25
482 0.24
483 0.2
484 0.18
485 0.16
486 0.13
487 0.13
488 0.13
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.09
496 0.1
497 0.12
498 0.16
499 0.18
500 0.21
501 0.23
502 0.25
503 0.27
504 0.26
505 0.27
506 0.27
507 0.27
508 0.25
509 0.29
510 0.27
511 0.28
512 0.28
513 0.25
514 0.25
515 0.23
516 0.23
517 0.19
518 0.19
519 0.13
520 0.13
521 0.14
522 0.11
523 0.11
524 0.1
525 0.09
526 0.08
527 0.08
528 0.07
529 0.06
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.07
535 0.09
536 0.09
537 0.1
538 0.1
539 0.11
540 0.12
541 0.16
542 0.17
543 0.2
544 0.25
545 0.28
546 0.29
547 0.29
548 0.36
549 0.34
550 0.41
551 0.39
552 0.37
553 0.35
554 0.35
555 0.34
556 0.28
557 0.3
558 0.21
559 0.2
560 0.18
561 0.19
562 0.18
563 0.17
564 0.17
565 0.11
566 0.11
567 0.08
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.06
575 0.06
576 0.08
577 0.1
578 0.1
579 0.12
580 0.13
581 0.14
582 0.15
583 0.16
584 0.15
585 0.15
586 0.17
587 0.17
588 0.22
589 0.25
590 0.29
591 0.33
592 0.35
593 0.39
594 0.39
595 0.43
596 0.4
597 0.38
598 0.38
599 0.37
600 0.33
601 0.28
602 0.26
603 0.19
604 0.16
605 0.16
606 0.1
607 0.07
608 0.07
609 0.06
610 0.09
611 0.1
612 0.1
613 0.12
614 0.12
615 0.12
616 0.13
617 0.14
618 0.11
619 0.1
620 0.1
621 0.08
622 0.11
623 0.11
624 0.1
625 0.1
626 0.11
627 0.12
628 0.13
629 0.16
630 0.13
631 0.14
632 0.13
633 0.12
634 0.11
635 0.11
636 0.14
637 0.11
638 0.11
639 0.11
640 0.11
641 0.1
642 0.09
643 0.1
644 0.08
645 0.07
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.08
650 0.08
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.1
655 0.12
656 0.14
657 0.14
658 0.15
659 0.15
660 0.15
661 0.17
662 0.15
663 0.14
664 0.12
665 0.12
666 0.11
667 0.12
668 0.12
669 0.12
670 0.13
671 0.12
672 0.12
673 0.12
674 0.14
675 0.15
676 0.16
677 0.14
678 0.13
679 0.13
680 0.12
681 0.15
682 0.15
683 0.13
684 0.12
685 0.11
686 0.11
687 0.11
688 0.12
689 0.1
690 0.1
691 0.09
692 0.11
693 0.13
694 0.16
695 0.18
696 0.21
697 0.22
698 0.28
699 0.32
700 0.34
701 0.37
702 0.37
703 0.42
704 0.47
705 0.49
706 0.5
707 0.54
708 0.56
709 0.55
710 0.55
711 0.48
712 0.45
713 0.44
714 0.38
715 0.3
716 0.25
717 0.2
718 0.17
719 0.19
720 0.13
721 0.1
722 0.07
723 0.08
724 0.08
725 0.08
726 0.09
727 0.1
728 0.11
729 0.12
730 0.12
731 0.11
732 0.12
733 0.17
734 0.22
735 0.25
736 0.25
737 0.28
738 0.29
739 0.29
740 0.28
741 0.24
742 0.17
743 0.12
744 0.14
745 0.1
746 0.1
747 0.11
748 0.11
749 0.11
750 0.12
751 0.14
752 0.11
753 0.12
754 0.16
755 0.2
756 0.25
757 0.25
758 0.25
759 0.28
760 0.3
761 0.3
762 0.27
763 0.24
764 0.22
765 0.24
766 0.24
767 0.23
768 0.23
769 0.22
770 0.21
771 0.18
772 0.17
773 0.14
774 0.13
775 0.1
776 0.09
777 0.07
778 0.08
779 0.1
780 0.09