Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QCW2

Protein Details
Accession W1QCW2    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
307-331PPLGYDEKPRKQRPQRQNPENLTQEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11cyto_nucl 11, nucl 9, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016853  F:isomerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
KEGG opa:HPODL_04460  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDPSGPPSSGEKDQKLDTLDFEETYEGLGEQDEDAFNDETFGADVKEIGSNFDFTGGLKPASKPQTVNPNLSYAKAAQVDQVIAPMASLWNEEAKTADSASSQPASEQRVLSLEEIEAKLRQPQQQVPQMPQMNPYMYQQQQQLLVAAMASGQFPNPAAAAQALAQGYFPPFQPGVMPFMPFQAQQMMQQGALGQGQQPQQVQPPPAGLQVPQVPQVPQSAPAPVQQQQQQQQQQPALQAPQALQSPPVLNAASPPPHSSQPVPQAVEQKVPASASAPSSSATPAPQSVQQVGSSDATGNFPPLGYDEKPRKQRPQRQNPENLTQEEREKLWRRQNKVSAIIRCSGFMNPRDKDFVTRVQLSQIVTDDPYNEDFYCQVYRVLNSSVGEDDMSSIAQKYLDQSGHRLGGREKRADVALQRMQQQVSKAVTVAKERGERTGVLAKEGALGKVSVGSGKQPRKQLVINTTGSSDEVVVPKENVYSKSSRAFQLSVIEDIYSQVLKLESLERENQERDSKDLWNALRLNDTIETSSTVVSPFISVLSIDKAMKVFNRLFHFLNPEQKIKLMEAIFANLHNIDVVMKGSYANYVNENYEIPKTEKSKIELFQMTVMKTLVLFVSESDFQQVLRFVALIVKGGNNNVLFLSTTKIGLSLITILVSRLELIKQEFSAGLSPQDLAQWQTIYDHLFQALEGRLATIFPPYLSNDDARKVRNSESKSDDSYIWQFLASLSLAGLLSHQRIIVDEIRNEIFGSMGVSKALKESGDLQGAEKHLSNLNLFLNVMGLKASESDITEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.41
3 0.41
4 0.43
5 0.45
6 0.46
7 0.46
8 0.42
9 0.35
10 0.33
11 0.3
12 0.26
13 0.25
14 0.22
15 0.17
16 0.17
17 0.15
18 0.1
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.07
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.12
27 0.13
28 0.12
29 0.13
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.08
35 0.07
36 0.08
37 0.08
38 0.12
39 0.11
40 0.14
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.16
46 0.13
47 0.18
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.2
52 0.27
53 0.33
54 0.35
55 0.33
56 0.37
57 0.46
58 0.49
59 0.54
60 0.47
61 0.49
62 0.46
63 0.45
64 0.41
65 0.31
66 0.32
67 0.28
68 0.27
69 0.21
70 0.22
71 0.22
72 0.19
73 0.19
74 0.14
75 0.12
76 0.11
77 0.09
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.14
87 0.15
88 0.14
89 0.14
90 0.11
91 0.13
92 0.16
93 0.17
94 0.15
95 0.16
96 0.19
97 0.23
98 0.26
99 0.25
100 0.22
101 0.22
102 0.24
103 0.23
104 0.2
105 0.16
106 0.17
107 0.17
108 0.18
109 0.16
110 0.15
111 0.21
112 0.25
113 0.3
114 0.31
115 0.38
116 0.45
117 0.53
118 0.56
119 0.54
120 0.59
121 0.58
122 0.53
123 0.5
124 0.45
125 0.38
126 0.35
127 0.33
128 0.32
129 0.28
130 0.31
131 0.31
132 0.3
133 0.3
134 0.29
135 0.27
136 0.2
137 0.18
138 0.13
139 0.1
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.14
167 0.19
168 0.19
169 0.2
170 0.16
171 0.18
172 0.2
173 0.17
174 0.17
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.2
179 0.19
180 0.17
181 0.18
182 0.17
183 0.13
184 0.13
185 0.11
186 0.08
187 0.12
188 0.14
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.22
193 0.25
194 0.25
195 0.22
196 0.23
197 0.21
198 0.23
199 0.22
200 0.17
201 0.17
202 0.21
203 0.21
204 0.22
205 0.22
206 0.2
207 0.21
208 0.24
209 0.2
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.16
214 0.19
215 0.21
216 0.22
217 0.26
218 0.29
219 0.35
220 0.4
221 0.48
222 0.52
223 0.53
224 0.54
225 0.52
226 0.49
227 0.44
228 0.39
229 0.32
230 0.26
231 0.22
232 0.17
233 0.18
234 0.18
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.12
242 0.1
243 0.12
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.18
248 0.19
249 0.21
250 0.23
251 0.23
252 0.26
253 0.31
254 0.35
255 0.34
256 0.34
257 0.39
258 0.38
259 0.39
260 0.34
261 0.26
262 0.22
263 0.2
264 0.17
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.13
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.16
285 0.15
286 0.13
287 0.12
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.11
297 0.11
298 0.18
299 0.26
300 0.33
301 0.43
302 0.48
303 0.58
304 0.64
305 0.73
306 0.78
307 0.81
308 0.85
309 0.84
310 0.89
311 0.84
312 0.81
313 0.74
314 0.66
315 0.57
316 0.48
317 0.41
318 0.33
319 0.28
320 0.29
321 0.31
322 0.35
323 0.41
324 0.46
325 0.5
326 0.57
327 0.63
328 0.61
329 0.64
330 0.64
331 0.59
332 0.55
333 0.52
334 0.44
335 0.37
336 0.33
337 0.26
338 0.23
339 0.23
340 0.27
341 0.25
342 0.26
343 0.29
344 0.28
345 0.29
346 0.28
347 0.29
348 0.27
349 0.28
350 0.27
351 0.25
352 0.27
353 0.24
354 0.21
355 0.16
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.12
373 0.13
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.11
378 0.1
379 0.1
380 0.08
381 0.07
382 0.05
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.08
391 0.1
392 0.11
393 0.13
394 0.15
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.18
399 0.24
400 0.28
401 0.28
402 0.26
403 0.24
404 0.25
405 0.25
406 0.23
407 0.22
408 0.22
409 0.23
410 0.26
411 0.26
412 0.26
413 0.26
414 0.26
415 0.23
416 0.19
417 0.17
418 0.14
419 0.14
420 0.16
421 0.16
422 0.17
423 0.16
424 0.2
425 0.2
426 0.21
427 0.21
428 0.19
429 0.21
430 0.25
431 0.21
432 0.18
433 0.18
434 0.16
435 0.18
436 0.18
437 0.15
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.06
444 0.05
445 0.1
446 0.17
447 0.23
448 0.28
449 0.32
450 0.34
451 0.37
452 0.39
453 0.41
454 0.39
455 0.39
456 0.37
457 0.33
458 0.31
459 0.28
460 0.25
461 0.2
462 0.14
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.11
470 0.13
471 0.13
472 0.16
473 0.17
474 0.19
475 0.23
476 0.25
477 0.25
478 0.26
479 0.24
480 0.22
481 0.25
482 0.24
483 0.2
484 0.18
485 0.16
486 0.13
487 0.13
488 0.13
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.09
496 0.1
497 0.12
498 0.16
499 0.18
500 0.21
501 0.23
502 0.25
503 0.27
504 0.26
505 0.27
506 0.27
507 0.27
508 0.25
509 0.29
510 0.27
511 0.28
512 0.28
513 0.25
514 0.25
515 0.23
516 0.23
517 0.19
518 0.19
519 0.13
520 0.13
521 0.14
522 0.11
523 0.11
524 0.1
525 0.09
526 0.08
527 0.08
528 0.07
529 0.06
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.07
535 0.09
536 0.09
537 0.1
538 0.1
539 0.11
540 0.12
541 0.16
542 0.17
543 0.2
544 0.25
545 0.28
546 0.29
547 0.29
548 0.36
549 0.34
550 0.41
551 0.39
552 0.37
553 0.35
554 0.35
555 0.34
556 0.28
557 0.3
558 0.21
559 0.2
560 0.18
561 0.19
562 0.18
563 0.17
564 0.17
565 0.11
566 0.11
567 0.08
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.06
575 0.06
576 0.08
577 0.1
578 0.1
579 0.12
580 0.13
581 0.14
582 0.15
583 0.16
584 0.15
585 0.15
586 0.17
587 0.17
588 0.22
589 0.25
590 0.29
591 0.33
592 0.35
593 0.39
594 0.39
595 0.43
596 0.4
597 0.38
598 0.38
599 0.37
600 0.33
601 0.28
602 0.26
603 0.19
604 0.16
605 0.16
606 0.1
607 0.07
608 0.07
609 0.06
610 0.09
611 0.1
612 0.1
613 0.12
614 0.12
615 0.12
616 0.13
617 0.14
618 0.11
619 0.1
620 0.1
621 0.08
622 0.11
623 0.11
624 0.1
625 0.1
626 0.11
627 0.12
628 0.13
629 0.16
630 0.13
631 0.14
632 0.13
633 0.12
634 0.11
635 0.11
636 0.14
637 0.11
638 0.11
639 0.11
640 0.11
641 0.1
642 0.09
643 0.1
644 0.08
645 0.07
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.08
650 0.08
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.1
655 0.12
656 0.14
657 0.14
658 0.15
659 0.15
660 0.15
661 0.17
662 0.15
663 0.14
664 0.12
665 0.12
666 0.11
667 0.12
668 0.12
669 0.12
670 0.13
671 0.12
672 0.12
673 0.12
674 0.14
675 0.15
676 0.16
677 0.14
678 0.13
679 0.13
680 0.12
681 0.15
682 0.15
683 0.13
684 0.12
685 0.11
686 0.11
687 0.11
688 0.12
689 0.1
690 0.1
691 0.09
692 0.11
693 0.13
694 0.16
695 0.18
696 0.21
697 0.22
698 0.28
699 0.32
700 0.34
701 0.37
702 0.37
703 0.42
704 0.47
705 0.49
706 0.5
707 0.54
708 0.56
709 0.55
710 0.55
711 0.48
712 0.45
713 0.44
714 0.38
715 0.3
716 0.25
717 0.2
718 0.17
719 0.19
720 0.13
721 0.1
722 0.07
723 0.08
724 0.08
725 0.08
726 0.09
727 0.1
728 0.11
729 0.12
730 0.12
731 0.11
732 0.12
733 0.17
734 0.22
735 0.25
736 0.25
737 0.28
738 0.29
739 0.29
740 0.28
741 0.24
742 0.17
743 0.12
744 0.14
745 0.1
746 0.1
747 0.11
748 0.11
749 0.11
750 0.12
751 0.14
752 0.11
753 0.12
754 0.16
755 0.2
756 0.25
757 0.25
758 0.25
759 0.28
760 0.3
761 0.3
762 0.27
763 0.24
764 0.22
765 0.24
766 0.24
767 0.23
768 0.23
769 0.22
770 0.21
771 0.18
772 0.17
773 0.14
774 0.13
775 0.1
776 0.09
777 0.07
778 0.08
779 0.1
780 0.09