Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QBL1

Protein Details
Accession W1QBL1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-146FVSECFDKKKRRHIPESSKELLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
132-156KKKRRHIPESSKELLEKAFKVKRFP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
KEGG opa:HPODL_04024  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MTTSLIGNKNEPSLDSQRREGNLASENCVFARDIRKEGVKVLEDSLRSERNALLAIGAGGAVDRVERHYRRLLDGWEAAIMEIRSNDKYESLWRGFAIEKAEVETEMRKVEKQWPGELDVYKECFVSECFDKKKRRHIPESSKELLEKAFKVKRFPNSKERERIARECGISPLQVRVWFTNKRARSKSRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.43
4 0.46
5 0.47
6 0.49
7 0.43
8 0.38
9 0.37
10 0.35
11 0.34
12 0.3
13 0.29
14 0.26
15 0.26
16 0.22
17 0.17
18 0.24
19 0.23
20 0.25
21 0.28
22 0.31
23 0.31
24 0.34
25 0.36
26 0.3
27 0.28
28 0.28
29 0.28
30 0.25
31 0.27
32 0.29
33 0.25
34 0.23
35 0.23
36 0.21
37 0.18
38 0.18
39 0.15
40 0.1
41 0.08
42 0.08
43 0.06
44 0.06
45 0.04
46 0.03
47 0.03
48 0.03
49 0.03
50 0.03
51 0.06
52 0.13
53 0.15
54 0.18
55 0.24
56 0.26
57 0.29
58 0.32
59 0.3
60 0.27
61 0.27
62 0.24
63 0.19
64 0.17
65 0.14
66 0.12
67 0.1
68 0.07
69 0.06
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.12
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.17
84 0.16
85 0.11
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.09
94 0.1
95 0.09
96 0.11
97 0.18
98 0.23
99 0.24
100 0.27
101 0.27
102 0.3
103 0.33
104 0.32
105 0.27
106 0.24
107 0.24
108 0.21
109 0.2
110 0.16
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.16
115 0.2
116 0.26
117 0.34
118 0.43
119 0.47
120 0.58
121 0.64
122 0.69
123 0.72
124 0.77
125 0.8
126 0.82
127 0.85
128 0.78
129 0.69
130 0.6
131 0.52
132 0.44
133 0.36
134 0.28
135 0.28
136 0.3
137 0.31
138 0.37
139 0.42
140 0.49
141 0.55
142 0.6
143 0.62
144 0.66
145 0.73
146 0.76
147 0.76
148 0.75
149 0.74
150 0.72
151 0.68
152 0.65
153 0.58
154 0.5
155 0.48
156 0.41
157 0.35
158 0.31
159 0.29
160 0.26
161 0.26
162 0.28
163 0.28
164 0.33
165 0.36
166 0.4
167 0.46
168 0.5
169 0.58
170 0.63