Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QAA9

Protein Details
Accession W1QAA9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-72AGLDDSSKSKKKNKNKKKKKSEKKPATVTANWPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-64KSKKKNKNKKKKKSEKKP
Subcellular Location(s) E.R. 6, cyto 5.5, cyto_nucl 5.5, nucl 4.5, mito 3, extr 3, vacu 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001440  TPR_1  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG opa:HPODL_02907  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00515  TPR_1  
PF13432  TPR_16  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSDSSLSRFVQTHKVALAVTAIVGAGSVAGLLYYLNQQSAGLDDSSKSKKKNKNKKKKKSEKKPATVTANWPSSNIPINESTGLPNVTEDLVKGMTKEERNKWALALKETGNQYYKAEDFKPAIECYSLALLCKTDPVFYANRAACYAAQGEHEKCIDDCTEALKLNPGYSKCLLRRAHAYENIEKYEEAIYDLTALTIYGGLNDQSPETFLERNLKKLANKINEERFSTLPKELPSSSSISSFFGAFAKENIDLDESKYPDQSCSQFLVKGLNEMAKDTYDNYVNADVLFHQAVTSYEKDSSNTDVKHAALAYEYKGTFDFLKGESESAVSNFNKALSLAPRCRTHVLLGLVNADKGDFASADEEIGKAIKMNPEDPDIYYHYGQLFYLMGDLDKAKDNFEKSKLYNPENVFGHIQLACIAYRKGESATCDELFREAKRKFPTSPEVPNYYGEILFDRQDYAAAAKQFDTAARLQEVLPTFNIGALPLINKSAIFQVNKDIAGCEQLLKTACELDPKSEVARINLGQIYLQAQKVKDAIELFEEACRLSRSNDDRVQAISLMEASKIQLKIKEDPILSAKVEEILRRAGIERNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.29
3 0.27
4 0.25
5 0.15
6 0.13
7 0.09
8 0.08
9 0.06
10 0.06
11 0.05
12 0.03
13 0.03
14 0.03
15 0.02
16 0.02
17 0.02
18 0.03
19 0.04
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.12
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.12
31 0.18
32 0.27
33 0.32
34 0.37
35 0.44
36 0.53
37 0.64
38 0.74
39 0.79
40 0.83
41 0.89
42 0.94
43 0.96
44 0.97
45 0.98
46 0.98
47 0.98
48 0.97
49 0.96
50 0.95
51 0.92
52 0.89
53 0.83
54 0.79
55 0.76
56 0.71
57 0.61
58 0.52
59 0.44
60 0.39
61 0.4
62 0.33
63 0.28
64 0.23
65 0.26
66 0.26
67 0.26
68 0.24
69 0.21
70 0.21
71 0.17
72 0.16
73 0.14
74 0.13
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.13
82 0.18
83 0.25
84 0.33
85 0.37
86 0.44
87 0.47
88 0.47
89 0.47
90 0.46
91 0.43
92 0.39
93 0.37
94 0.3
95 0.33
96 0.34
97 0.36
98 0.33
99 0.3
100 0.27
101 0.26
102 0.26
103 0.25
104 0.24
105 0.24
106 0.23
107 0.25
108 0.28
109 0.25
110 0.24
111 0.21
112 0.2
113 0.17
114 0.19
115 0.16
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.16
121 0.15
122 0.11
123 0.12
124 0.15
125 0.16
126 0.18
127 0.26
128 0.24
129 0.25
130 0.25
131 0.25
132 0.21
133 0.21
134 0.21
135 0.13
136 0.15
137 0.19
138 0.19
139 0.2
140 0.2
141 0.19
142 0.18
143 0.19
144 0.16
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.15
149 0.14
150 0.14
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.22
155 0.21
156 0.23
157 0.25
158 0.32
159 0.29
160 0.38
161 0.37
162 0.36
163 0.43
164 0.44
165 0.49
166 0.48
167 0.51
168 0.49
169 0.51
170 0.49
171 0.43
172 0.36
173 0.3
174 0.25
175 0.2
176 0.15
177 0.11
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.06
183 0.06
184 0.04
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.2
200 0.2
201 0.24
202 0.27
203 0.29
204 0.28
205 0.35
206 0.42
207 0.4
208 0.45
209 0.48
210 0.53
211 0.53
212 0.54
213 0.5
214 0.43
215 0.38
216 0.35
217 0.3
218 0.24
219 0.22
220 0.23
221 0.2
222 0.21
223 0.19
224 0.2
225 0.19
226 0.18
227 0.18
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.13
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.11
243 0.15
244 0.14
245 0.14
246 0.16
247 0.16
248 0.15
249 0.18
250 0.17
251 0.16
252 0.17
253 0.18
254 0.17
255 0.17
256 0.2
257 0.18
258 0.17
259 0.16
260 0.15
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.13
289 0.17
290 0.18
291 0.18
292 0.18
293 0.17
294 0.17
295 0.17
296 0.16
297 0.12
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.09
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.17
327 0.21
328 0.26
329 0.28
330 0.3
331 0.32
332 0.31
333 0.28
334 0.28
335 0.26
336 0.23
337 0.22
338 0.22
339 0.2
340 0.19
341 0.17
342 0.11
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.07
358 0.09
359 0.11
360 0.12
361 0.14
362 0.16
363 0.18
364 0.18
365 0.19
366 0.19
367 0.21
368 0.2
369 0.2
370 0.18
371 0.17
372 0.16
373 0.14
374 0.11
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.05
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.11
383 0.11
384 0.13
385 0.16
386 0.19
387 0.23
388 0.26
389 0.3
390 0.28
391 0.37
392 0.41
393 0.41
394 0.46
395 0.43
396 0.46
397 0.41
398 0.42
399 0.34
400 0.28
401 0.28
402 0.2
403 0.18
404 0.13
405 0.13
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.11
413 0.12
414 0.14
415 0.18
416 0.23
417 0.23
418 0.23
419 0.22
420 0.24
421 0.24
422 0.24
423 0.28
424 0.23
425 0.3
426 0.35
427 0.39
428 0.39
429 0.43
430 0.5
431 0.48
432 0.56
433 0.55
434 0.55
435 0.52
436 0.51
437 0.46
438 0.39
439 0.32
440 0.23
441 0.2
442 0.16
443 0.15
444 0.14
445 0.13
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.14
451 0.14
452 0.15
453 0.14
454 0.15
455 0.15
456 0.15
457 0.16
458 0.13
459 0.15
460 0.15
461 0.15
462 0.14
463 0.19
464 0.2
465 0.18
466 0.17
467 0.16
468 0.15
469 0.15
470 0.15
471 0.1
472 0.1
473 0.08
474 0.09
475 0.08
476 0.09
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.14
481 0.18
482 0.18
483 0.19
484 0.24
485 0.27
486 0.28
487 0.27
488 0.23
489 0.18
490 0.2
491 0.19
492 0.15
493 0.12
494 0.15
495 0.16
496 0.16
497 0.16
498 0.17
499 0.17
500 0.23
501 0.24
502 0.24
503 0.25
504 0.26
505 0.27
506 0.28
507 0.29
508 0.24
509 0.29
510 0.26
511 0.27
512 0.26
513 0.25
514 0.21
515 0.2
516 0.21
517 0.19
518 0.21
519 0.21
520 0.2
521 0.22
522 0.24
523 0.24
524 0.23
525 0.21
526 0.19
527 0.19
528 0.21
529 0.19
530 0.19
531 0.18
532 0.15
533 0.16
534 0.17
535 0.15
536 0.15
537 0.24
538 0.28
539 0.37
540 0.42
541 0.42
542 0.42
543 0.42
544 0.42
545 0.34
546 0.29
547 0.2
548 0.16
549 0.15
550 0.13
551 0.12
552 0.11
553 0.16
554 0.18
555 0.21
556 0.24
557 0.28
558 0.35
559 0.4
560 0.46
561 0.41
562 0.43
563 0.44
564 0.44
565 0.4
566 0.34
567 0.28
568 0.26
569 0.27
570 0.25
571 0.23
572 0.23
573 0.22
574 0.23
575 0.24