Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QBA9

Protein Details
Accession W1QBA9    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-281GSSRGRSERGRDRYRERQQPRKGNRDDEEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-274GPRSRGPPRGSSRGRSERGRDRYRERQQPRKG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
KEGG opa:HPODL_03955  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MSDFATKLTTVVDDDDQMDVETAELPPHLAHIGETEQTAPSASPERVSMEPEEHDPNELRPGSLLLSGVDELDTRAIKLYIDSFLKPDLKFENREAYAKFNYTLEWVDDKKINIVFEQPDAALEALSLLSEVSDGLSPEQERGAMEYISNDPGFNDQNVRLSIRQSYWGDRKVKGARNYSRYYLIHGEPEPTQRKRTYRNYKAGRGGARNRGPDLITGEDTGPVEEQDGDSHRKLEVSGRWDGPRSRGPPRGSSRGRSERGRDRYRERQQPRKGNRDDEEDLFPDFLKNRDRSPARMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.15
4 0.14
5 0.13
6 0.1
7 0.09
8 0.09
9 0.08
10 0.08
11 0.07
12 0.08
13 0.07
14 0.08
15 0.09
16 0.07
17 0.07
18 0.1
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.1
27 0.1
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.15
32 0.19
33 0.19
34 0.22
35 0.22
36 0.2
37 0.21
38 0.24
39 0.28
40 0.24
41 0.26
42 0.24
43 0.23
44 0.27
45 0.26
46 0.22
47 0.18
48 0.18
49 0.17
50 0.17
51 0.16
52 0.09
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.07
59 0.09
60 0.09
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.12
68 0.14
69 0.15
70 0.15
71 0.18
72 0.23
73 0.22
74 0.23
75 0.25
76 0.27
77 0.3
78 0.31
79 0.36
80 0.33
81 0.36
82 0.34
83 0.33
84 0.32
85 0.3
86 0.28
87 0.2
88 0.18
89 0.17
90 0.17
91 0.14
92 0.16
93 0.15
94 0.17
95 0.19
96 0.19
97 0.2
98 0.21
99 0.19
100 0.15
101 0.18
102 0.16
103 0.15
104 0.15
105 0.12
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.07
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.03
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.07
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.09
144 0.12
145 0.13
146 0.14
147 0.13
148 0.14
149 0.15
150 0.14
151 0.19
152 0.18
153 0.23
154 0.26
155 0.33
156 0.35
157 0.34
158 0.41
159 0.43
160 0.49
161 0.5
162 0.54
163 0.54
164 0.58
165 0.6
166 0.55
167 0.54
168 0.47
169 0.44
170 0.39
171 0.32
172 0.29
173 0.26
174 0.26
175 0.22
176 0.29
177 0.32
178 0.3
179 0.34
180 0.35
181 0.4
182 0.47
183 0.56
184 0.6
185 0.63
186 0.71
187 0.74
188 0.77
189 0.78
190 0.76
191 0.71
192 0.67
193 0.64
194 0.63
195 0.61
196 0.56
197 0.5
198 0.46
199 0.4
200 0.34
201 0.31
202 0.25
203 0.21
204 0.19
205 0.18
206 0.17
207 0.17
208 0.15
209 0.12
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.12
216 0.15
217 0.16
218 0.17
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.21
223 0.23
224 0.23
225 0.28
226 0.31
227 0.33
228 0.37
229 0.39
230 0.38
231 0.41
232 0.41
233 0.44
234 0.48
235 0.5
236 0.55
237 0.61
238 0.66
239 0.64
240 0.65
241 0.68
242 0.7
243 0.72
244 0.69
245 0.7
246 0.7
247 0.74
248 0.77
249 0.74
250 0.73
251 0.79
252 0.82
253 0.84
254 0.83
255 0.84
256 0.85
257 0.88
258 0.9
259 0.89
260 0.87
261 0.85
262 0.81
263 0.79
264 0.73
265 0.66
266 0.61
267 0.52
268 0.46
269 0.37
270 0.32
271 0.26
272 0.23
273 0.23
274 0.26
275 0.28
276 0.29
277 0.39
278 0.43
279 0.46