Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1Q6X2

Protein Details
Accession W1Q6X2    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MIRTIKPKNARSKRALDKRQPKIVENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-16KNARSKRAL
349-350KR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG opa:HPODL_02601  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MIRTIKPKNARSKRALDKRQPKIVENVKTALFVPGTTSNKALHDISVDLAALKKPDVKRFTKKNEVLPFEDASKLEFFSEKNDASLLVFMSSNKKRPNNLTFVRTFNYKIYDMVELLVLNNYKLLEEFKKATFQVGLKPMFVFNGPIFDTHPLFKQIKSLFLDFFRGEVTKLQDVSGLQHVIAVSAIEEDDNDESISKLPLVHFRVYKLKTYKSAEPKLPRVELEETGPRLDFKIGRHQYPDPEMEKEALKVPKQLQPTQKKNVDVDRMGDKIAKVHVGTQDLSKLQTRKMKGLKSKYDQLSDSEDEVSGDEDGISDGEEDEIIDSSADQEEGDTEFLDAEEELPERKKRRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.88
3 0.88
4 0.88
5 0.88
6 0.9
7 0.84
8 0.76
9 0.75
10 0.74
11 0.71
12 0.65
13 0.59
14 0.5
15 0.47
16 0.44
17 0.37
18 0.28
19 0.19
20 0.19
21 0.23
22 0.26
23 0.26
24 0.28
25 0.26
26 0.27
27 0.31
28 0.27
29 0.2
30 0.18
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.14
35 0.11
36 0.11
37 0.12
38 0.11
39 0.11
40 0.17
41 0.2
42 0.29
43 0.36
44 0.43
45 0.53
46 0.62
47 0.71
48 0.75
49 0.76
50 0.77
51 0.79
52 0.76
53 0.7
54 0.64
55 0.56
56 0.47
57 0.43
58 0.34
59 0.26
60 0.22
61 0.18
62 0.15
63 0.14
64 0.12
65 0.15
66 0.2
67 0.18
68 0.17
69 0.17
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.13
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.17
78 0.2
79 0.26
80 0.33
81 0.37
82 0.41
83 0.49
84 0.55
85 0.56
86 0.58
87 0.59
88 0.55
89 0.54
90 0.51
91 0.45
92 0.4
93 0.32
94 0.31
95 0.25
96 0.22
97 0.21
98 0.2
99 0.18
100 0.16
101 0.14
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.09
106 0.07
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.1
112 0.1
113 0.13
114 0.16
115 0.17
116 0.2
117 0.2
118 0.21
119 0.21
120 0.2
121 0.22
122 0.26
123 0.26
124 0.23
125 0.23
126 0.22
127 0.2
128 0.19
129 0.15
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.14
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.22
143 0.2
144 0.25
145 0.26
146 0.26
147 0.23
148 0.23
149 0.26
150 0.19
151 0.19
152 0.14
153 0.12
154 0.11
155 0.12
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.11
165 0.09
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.06
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.13
188 0.16
189 0.19
190 0.2
191 0.22
192 0.3
193 0.31
194 0.37
195 0.36
196 0.36
197 0.39
198 0.43
199 0.49
200 0.5
201 0.54
202 0.55
203 0.57
204 0.6
205 0.58
206 0.55
207 0.47
208 0.42
209 0.39
210 0.33
211 0.3
212 0.28
213 0.24
214 0.24
215 0.23
216 0.19
217 0.17
218 0.18
219 0.17
220 0.15
221 0.25
222 0.27
223 0.29
224 0.33
225 0.35
226 0.36
227 0.38
228 0.41
229 0.33
230 0.32
231 0.31
232 0.28
233 0.27
234 0.24
235 0.26
236 0.25
237 0.23
238 0.26
239 0.28
240 0.32
241 0.37
242 0.42
243 0.46
244 0.53
245 0.6
246 0.64
247 0.66
248 0.65
249 0.64
250 0.65
251 0.62
252 0.53
253 0.48
254 0.43
255 0.39
256 0.35
257 0.33
258 0.25
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.15
263 0.18
264 0.2
265 0.22
266 0.22
267 0.21
268 0.24
269 0.22
270 0.24
271 0.26
272 0.24
273 0.27
274 0.34
275 0.36
276 0.41
277 0.48
278 0.55
279 0.59
280 0.67
281 0.71
282 0.71
283 0.78
284 0.74
285 0.71
286 0.64
287 0.58
288 0.54
289 0.47
290 0.41
291 0.33
292 0.27
293 0.22
294 0.21
295 0.19
296 0.12
297 0.09
298 0.07
299 0.06
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.07
319 0.09
320 0.1
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.08
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.11
331 0.17
332 0.25