Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QF38

Protein Details
Accession W1QF38    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34YDPLKEEKVKRVRKPGPAGWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-256KRKKTSLGIRKKVK
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
KEGG opa:HPODL_04132  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKVINKYYPPDYDPLKEEKVKRVRKPGPAGWPTVRLMIPFSMKCLNCGEYIGKSKKFNAKKESTREDYLGIRIFNFHFRCPQCFSDLVFRTDPKNGDFECVSGCRRNYERKEGKIAADETMDDIVKRLEEEEYREMLAKEGKKENEETAMEQLERRLNEQQKEQEATEEIEELQERHRRLEKAKPRILEDQELLDEKEAKLAFKAKSQSNSLTVNPTPEGNQISLLSGYSSSDDETVTIKRKKTSLGIRKKVKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.48
3 0.44
4 0.45
5 0.44
6 0.47
7 0.48
8 0.53
9 0.59
10 0.64
11 0.68
12 0.73
13 0.74
14 0.77
15 0.82
16 0.79
17 0.8
18 0.74
19 0.73
20 0.66
21 0.62
22 0.53
23 0.48
24 0.41
25 0.31
26 0.28
27 0.25
28 0.27
29 0.22
30 0.24
31 0.28
32 0.27
33 0.29
34 0.3
35 0.28
36 0.23
37 0.26
38 0.24
39 0.22
40 0.31
41 0.35
42 0.37
43 0.37
44 0.43
45 0.5
46 0.55
47 0.59
48 0.6
49 0.63
50 0.67
51 0.74
52 0.77
53 0.73
54 0.69
55 0.62
56 0.55
57 0.47
58 0.42
59 0.35
60 0.27
61 0.21
62 0.19
63 0.19
64 0.24
65 0.24
66 0.21
67 0.27
68 0.28
69 0.32
70 0.35
71 0.36
72 0.31
73 0.31
74 0.32
75 0.33
76 0.34
77 0.34
78 0.31
79 0.3
80 0.29
81 0.31
82 0.3
83 0.21
84 0.23
85 0.2
86 0.21
87 0.2
88 0.18
89 0.17
90 0.18
91 0.19
92 0.18
93 0.18
94 0.2
95 0.23
96 0.32
97 0.34
98 0.43
99 0.48
100 0.48
101 0.55
102 0.53
103 0.5
104 0.46
105 0.42
106 0.32
107 0.25
108 0.21
109 0.15
110 0.13
111 0.12
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.1
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.18
128 0.16
129 0.17
130 0.22
131 0.22
132 0.23
133 0.25
134 0.25
135 0.25
136 0.24
137 0.21
138 0.19
139 0.19
140 0.17
141 0.16
142 0.17
143 0.16
144 0.15
145 0.16
146 0.21
147 0.25
148 0.28
149 0.34
150 0.37
151 0.38
152 0.4
153 0.38
154 0.32
155 0.28
156 0.27
157 0.21
158 0.17
159 0.12
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.13
164 0.16
165 0.17
166 0.21
167 0.26
168 0.29
169 0.33
170 0.43
171 0.48
172 0.54
173 0.59
174 0.58
175 0.57
176 0.62
177 0.62
178 0.56
179 0.47
180 0.39
181 0.36
182 0.34
183 0.29
184 0.22
185 0.2
186 0.15
187 0.19
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.21
192 0.21
193 0.25
194 0.31
195 0.32
196 0.36
197 0.4
198 0.42
199 0.41
200 0.43
201 0.39
202 0.39
203 0.35
204 0.33
205 0.3
206 0.27
207 0.24
208 0.24
209 0.25
210 0.19
211 0.2
212 0.17
213 0.18
214 0.17
215 0.16
216 0.13
217 0.1
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.12
226 0.16
227 0.23
228 0.28
229 0.31
230 0.35
231 0.37
232 0.41
233 0.48
234 0.55
235 0.57
236 0.63
237 0.7