Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1Q999

Protein Details
Accession W1Q999    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-44KQSLKFKPKVVARRTKEERDSNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, mito_nucl 10.833, cyto_nucl 8.833, mito 7.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG opa:HPODL_02579  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSNNRLDSISRPSGNVSGGGPSKQSLKFKPKVVARRTKEERDSNVPVATPGVSKKPGSLAKNLQRNPRTPGMRHLQNTKVVMAGPLAMGTVSLANSGQSKGTKMVKKSADTYDLAQSIKAQTTKKAKGNTESDDEGDDDMTARIDLGQAYDWKDVDTQYFPVRAERHQHYEYGEEPIPDSTIKTEIHREVSVPLDSEPTSREQSVEVKQEEDATVKFIPDEQANADVSITDYQGKQEAARLADDYRAIITKLDEIQLEENAEEMLFLQLPKQLNVESASHEVKMEIDDDLSQEKDATSDVIGTLRVHESGKVTIKMGDTVLDVTRGAATHLVQSIVQLDEDTKECLELGTVNEKIVASLSLSDEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.24
4 0.22
5 0.23
6 0.23
7 0.22
8 0.2
9 0.26
10 0.3
11 0.36
12 0.39
13 0.47
14 0.52
15 0.58
16 0.65
17 0.68
18 0.72
19 0.76
20 0.78
21 0.74
22 0.78
23 0.8
24 0.81
25 0.81
26 0.79
27 0.76
28 0.73
29 0.74
30 0.66
31 0.59
32 0.5
33 0.41
34 0.34
35 0.28
36 0.22
37 0.18
38 0.2
39 0.22
40 0.22
41 0.23
42 0.29
43 0.35
44 0.36
45 0.42
46 0.47
47 0.52
48 0.62
49 0.65
50 0.68
51 0.66
52 0.66
53 0.65
54 0.64
55 0.61
56 0.54
57 0.57
58 0.56
59 0.59
60 0.59
61 0.6
62 0.56
63 0.55
64 0.55
65 0.47
66 0.38
67 0.3
68 0.27
69 0.2
70 0.16
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.04
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.07
83 0.08
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.16
88 0.24
89 0.28
90 0.3
91 0.37
92 0.4
93 0.43
94 0.46
95 0.45
96 0.41
97 0.38
98 0.38
99 0.34
100 0.31
101 0.28
102 0.24
103 0.21
104 0.18
105 0.19
106 0.21
107 0.17
108 0.22
109 0.31
110 0.38
111 0.42
112 0.47
113 0.47
114 0.51
115 0.55
116 0.53
117 0.48
118 0.43
119 0.38
120 0.32
121 0.29
122 0.22
123 0.17
124 0.12
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.12
146 0.14
147 0.14
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.24
152 0.26
153 0.31
154 0.31
155 0.32
156 0.29
157 0.29
158 0.27
159 0.26
160 0.23
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.07
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.14
172 0.15
173 0.17
174 0.17
175 0.17
176 0.16
177 0.17
178 0.16
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.12
190 0.17
191 0.2
192 0.25
193 0.22
194 0.21
195 0.21
196 0.22
197 0.21
198 0.18
199 0.14
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.13
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.16
228 0.15
229 0.16
230 0.16
231 0.13
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.09
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.12
260 0.14
261 0.16
262 0.17
263 0.16
264 0.2
265 0.2
266 0.19
267 0.19
268 0.17
269 0.15
270 0.15
271 0.12
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.15
296 0.2
297 0.25
298 0.24
299 0.24
300 0.26
301 0.26
302 0.26
303 0.24
304 0.2
305 0.15
306 0.16
307 0.15
308 0.13
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.1
315 0.1
316 0.13
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.14
321 0.15
322 0.14
323 0.13
324 0.1
325 0.1
326 0.12
327 0.14
328 0.15
329 0.13
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.13
336 0.18
337 0.18
338 0.18
339 0.2
340 0.2
341 0.19
342 0.18
343 0.15
344 0.1
345 0.11