Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QBX8

Protein Details
Accession W1QBX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-294EDMKRNTRRYARRQVKWISRTHydrophilic
393-419EQYAIHLKSRRHRSNVKKSHRRLVHTKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
401-415SRRHRSNVKKSHRRL
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12, cyto 3.5, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG opa:HPODL_01922  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MLRMSCKVISVIGTTGVGKSQFAVELARAVDGEIVNADSMQMYRGLDQITNKHPMAERKGVPHHVMDHTPWDTEYYIHRFKHEAMAAIADIHRRGKTAILVGGTHYYLQSLLFLNKTLDTATSEQLTDAERAVLDGPPDEVFRTLQQKDPVVAQKFHPNDHRRVRRALEIYFSTKQRTSDLYRSQQQQETSALRYQMLFFWLYARQDVLDERLDSRVDKMLQQGALDEIRAMHAFRAQMEPKMDLDRGVWQVIGYKEFLPYLEEGPERLAGCIEDMKRNTRRYARRQVKWISRTLTRELAREGQFGWPNGGQVVVLDATELGNWEQDVAQRGVDVCRRFLAGSPPVRALTVPETLEGVLAIPGEAGNDETKWQHHYCETCVDETGRPTLFVGEQYAIHLKSRRHRSNVKKSHRRLVHTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.16
4 0.15
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.13
11 0.11
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.12
16 0.12
17 0.14
18 0.12
19 0.12
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.12
32 0.13
33 0.15
34 0.19
35 0.24
36 0.28
37 0.34
38 0.33
39 0.34
40 0.37
41 0.42
42 0.47
43 0.49
44 0.47
45 0.48
46 0.56
47 0.57
48 0.55
49 0.51
50 0.48
51 0.43
52 0.42
53 0.36
54 0.35
55 0.32
56 0.3
57 0.27
58 0.24
59 0.21
60 0.19
61 0.24
62 0.25
63 0.31
64 0.31
65 0.32
66 0.32
67 0.34
68 0.41
69 0.37
70 0.32
71 0.25
72 0.26
73 0.24
74 0.24
75 0.23
76 0.16
77 0.15
78 0.16
79 0.15
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.17
84 0.19
85 0.2
86 0.18
87 0.18
88 0.19
89 0.2
90 0.18
91 0.16
92 0.12
93 0.1
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.12
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.12
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.12
130 0.18
131 0.18
132 0.22
133 0.25
134 0.26
135 0.26
136 0.3
137 0.35
138 0.32
139 0.32
140 0.3
141 0.35
142 0.35
143 0.38
144 0.42
145 0.4
146 0.45
147 0.54
148 0.61
149 0.57
150 0.6
151 0.6
152 0.58
153 0.56
154 0.49
155 0.43
156 0.36
157 0.38
158 0.37
159 0.35
160 0.3
161 0.28
162 0.28
163 0.25
164 0.26
165 0.27
166 0.31
167 0.37
168 0.41
169 0.45
170 0.49
171 0.51
172 0.5
173 0.44
174 0.38
175 0.35
176 0.3
177 0.27
178 0.25
179 0.21
180 0.18
181 0.18
182 0.16
183 0.13
184 0.12
185 0.1
186 0.08
187 0.09
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.14
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.08
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.14
224 0.14
225 0.17
226 0.18
227 0.19
228 0.18
229 0.21
230 0.19
231 0.15
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.11
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.13
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.15
254 0.13
255 0.12
256 0.11
257 0.08
258 0.09
259 0.14
260 0.14
261 0.17
262 0.18
263 0.26
264 0.32
265 0.35
266 0.41
267 0.46
268 0.54
269 0.58
270 0.68
271 0.71
272 0.71
273 0.77
274 0.8
275 0.81
276 0.76
277 0.73
278 0.66
279 0.61
280 0.59
281 0.54
282 0.53
283 0.45
284 0.42
285 0.39
286 0.42
287 0.37
288 0.34
289 0.31
290 0.29
291 0.3
292 0.28
293 0.29
294 0.21
295 0.2
296 0.19
297 0.18
298 0.12
299 0.08
300 0.09
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.07
313 0.09
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.13
318 0.14
319 0.17
320 0.22
321 0.22
322 0.19
323 0.19
324 0.21
325 0.21
326 0.22
327 0.26
328 0.29
329 0.33
330 0.34
331 0.36
332 0.35
333 0.35
334 0.32
335 0.28
336 0.24
337 0.23
338 0.2
339 0.18
340 0.19
341 0.18
342 0.18
343 0.14
344 0.11
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.09
356 0.11
357 0.13
358 0.18
359 0.19
360 0.22
361 0.26
362 0.29
363 0.31
364 0.38
365 0.39
366 0.34
367 0.36
368 0.35
369 0.32
370 0.31
371 0.33
372 0.25
373 0.23
374 0.22
375 0.21
376 0.2
377 0.19
378 0.19
379 0.16
380 0.16
381 0.19
382 0.24
383 0.22
384 0.25
385 0.29
386 0.32
387 0.4
388 0.51
389 0.56
390 0.61
391 0.7
392 0.77
393 0.84
394 0.89
395 0.91
396 0.9
397 0.89
398 0.91
399 0.89