Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QL49

Protein Details
Accession W1QL49    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
540-559SRTFVRRKAVPNKRRRARGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
545-557RRKAVPNKRRRAR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG opa:HPODL_00021  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSDPLFEAVSDDEQTESELNRLLQEDHETEELTVPVITRESEPEPPAPVRLVFSDRESKTLNLTLSLGYQRQIVQELIEDDGLVILGRGLGLETIVANLLHVLGLSVIEDKKSLVLLVNASEAEIYKIGEELRELAWLDGKDEPVSFLSVSRDPTTLDKRRRLYEKGGILAITTRVLVTDFLGDVLNPDLVTGIVFLHAERVKEYSSERFIANLYRKKNKWGFVKALSDEPESMGAGFQPLYTRLKYLRLQKVMLWPRFHVDITNSLKSRKVENKVTEINVQMTDYMLKIQTGLLACMEACINELKRHNPEIASEYWTIENALDDEFVRNIRATLDPYWHRVSSTTKQVLYDFATLRELLGRLFTWDSVQFYQELSSIVEANKPSVTNNNKTMAPWLLLDEAMTVISCSKARVFDKVRDDNDAEATYLLEELPKWEQLAMILDDINEEKQHGDHSEDGPVLIMCTTAHCYSQLRNFLMSYKEYRAGNRTGFSARKLMVRILKQHLAWKKGTGSRTVKIQKELNRVSNQARSDMDDDVAVSRTFVRRKAVPNKRRRARGGAVMTSYNRMLSKTEDDDTVDDAVHEAMVDMLENEVGADLSDDEIKEEDIGSVPPEEFEEFMDHLEQTPDFEEVRSHGITFEYVDRTDQIIIEKFDAKASNYLLEEVMPSYIILYEPNLAFIRRVELFQSLRHTNPARCYFMYYGDSIEEQGYLNSIKREKDAFTRLIREKSMLPKTFITDEDESARFLPTVAQSTRIAGGNPLDTKNKVVVDVREFRSQLPFLCYLAAMEVIPCMLTVGDYVLSPKICIERKSIPDLVSSLKSGRLYQQCEQMFRYYELPALLIEFEEGKSFSLEPFTGYRDGRPLGTGPGSTAFQQDLQLKLMMLLIAFPSLKILWTSSPFETARLFRELKLNQDEPDVDKAINAGLNPLFDKDTYFNDMAIDLIQNIPGISSVNVHLIINKVRNIRELAQMSEAELAPLVGQEAAGKIVRFFERSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.13
4 0.12
5 0.15
6 0.14
7 0.16
8 0.18
9 0.17
10 0.18
11 0.23
12 0.23
13 0.23
14 0.24
15 0.23
16 0.22
17 0.22
18 0.2
19 0.15
20 0.14
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.11
26 0.16
27 0.19
28 0.24
29 0.27
30 0.29
31 0.33
32 0.33
33 0.34
34 0.31
35 0.28
36 0.25
37 0.26
38 0.28
39 0.25
40 0.29
41 0.36
42 0.35
43 0.38
44 0.38
45 0.36
46 0.36
47 0.39
48 0.34
49 0.26
50 0.26
51 0.23
52 0.24
53 0.27
54 0.23
55 0.19
56 0.2
57 0.2
58 0.21
59 0.22
60 0.19
61 0.16
62 0.18
63 0.18
64 0.18
65 0.16
66 0.14
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.07
71 0.05
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.04
77 0.03
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.09
102 0.11
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.07
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.16
124 0.15
125 0.17
126 0.17
127 0.18
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.14
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.16
136 0.17
137 0.21
138 0.21
139 0.21
140 0.21
141 0.28
142 0.36
143 0.41
144 0.48
145 0.53
146 0.56
147 0.64
148 0.69
149 0.68
150 0.66
151 0.66
152 0.63
153 0.58
154 0.54
155 0.45
156 0.39
157 0.35
158 0.27
159 0.19
160 0.12
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.16
189 0.16
190 0.17
191 0.21
192 0.21
193 0.24
194 0.25
195 0.24
196 0.23
197 0.24
198 0.3
199 0.36
200 0.36
201 0.39
202 0.47
203 0.48
204 0.57
205 0.62
206 0.62
207 0.63
208 0.64
209 0.64
210 0.62
211 0.67
212 0.6
213 0.58
214 0.53
215 0.45
216 0.37
217 0.31
218 0.25
219 0.18
220 0.16
221 0.11
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.07
227 0.09
228 0.12
229 0.13
230 0.15
231 0.16
232 0.23
233 0.28
234 0.37
235 0.43
236 0.45
237 0.46
238 0.47
239 0.55
240 0.59
241 0.59
242 0.52
243 0.43
244 0.42
245 0.43
246 0.39
247 0.31
248 0.24
249 0.27
250 0.31
251 0.36
252 0.34
253 0.33
254 0.37
255 0.37
256 0.43
257 0.42
258 0.43
259 0.45
260 0.49
261 0.55
262 0.56
263 0.58
264 0.52
265 0.46
266 0.4
267 0.32
268 0.27
269 0.19
270 0.15
271 0.13
272 0.1
273 0.1
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.1
279 0.09
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.05
287 0.06
288 0.08
289 0.1
290 0.14
291 0.17
292 0.21
293 0.25
294 0.28
295 0.29
296 0.26
297 0.27
298 0.27
299 0.26
300 0.27
301 0.23
302 0.22
303 0.2
304 0.19
305 0.17
306 0.13
307 0.12
308 0.08
309 0.07
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.12
321 0.13
322 0.19
323 0.2
324 0.25
325 0.29
326 0.27
327 0.26
328 0.25
329 0.3
330 0.29
331 0.37
332 0.36
333 0.34
334 0.35
335 0.35
336 0.35
337 0.31
338 0.3
339 0.21
340 0.18
341 0.18
342 0.17
343 0.16
344 0.15
345 0.12
346 0.08
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.13
355 0.13
356 0.13
357 0.12
358 0.11
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.08
366 0.11
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.18
373 0.23
374 0.25
375 0.29
376 0.31
377 0.31
378 0.31
379 0.33
380 0.26
381 0.22
382 0.17
383 0.14
384 0.12
385 0.11
386 0.11
387 0.08
388 0.07
389 0.06
390 0.05
391 0.04
392 0.03
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.11
398 0.12
399 0.2
400 0.24
401 0.3
402 0.38
403 0.45
404 0.45
405 0.44
406 0.44
407 0.38
408 0.36
409 0.29
410 0.21
411 0.14
412 0.12
413 0.08
414 0.08
415 0.06
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.1
426 0.09
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.07
439 0.08
440 0.1
441 0.11
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.11
446 0.1
447 0.09
448 0.06
449 0.05
450 0.03
451 0.04
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.08
456 0.1
457 0.12
458 0.17
459 0.21
460 0.2
461 0.2
462 0.2
463 0.21
464 0.22
465 0.22
466 0.2
467 0.17
468 0.2
469 0.2
470 0.21
471 0.23
472 0.24
473 0.23
474 0.21
475 0.21
476 0.2
477 0.21
478 0.21
479 0.2
480 0.18
481 0.19
482 0.19
483 0.2
484 0.22
485 0.23
486 0.27
487 0.29
488 0.31
489 0.29
490 0.34
491 0.36
492 0.34
493 0.32
494 0.29
495 0.29
496 0.31
497 0.31
498 0.33
499 0.33
500 0.3
501 0.38
502 0.43
503 0.41
504 0.4
505 0.44
506 0.43
507 0.48
508 0.51
509 0.48
510 0.44
511 0.45
512 0.44
513 0.43
514 0.37
515 0.3
516 0.27
517 0.23
518 0.23
519 0.2
520 0.17
521 0.12
522 0.12
523 0.1
524 0.11
525 0.08
526 0.07
527 0.07
528 0.1
529 0.12
530 0.14
531 0.16
532 0.19
533 0.28
534 0.39
535 0.49
536 0.55
537 0.64
538 0.73
539 0.77
540 0.81
541 0.77
542 0.74
543 0.67
544 0.66
545 0.61
546 0.53
547 0.47
548 0.42
549 0.38
550 0.31
551 0.27
552 0.19
553 0.14
554 0.12
555 0.11
556 0.11
557 0.15
558 0.16
559 0.17
560 0.16
561 0.17
562 0.17
563 0.18
564 0.16
565 0.12
566 0.09
567 0.08
568 0.07
569 0.06
570 0.05
571 0.03
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.02
581 0.02
582 0.02
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.04
587 0.04
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.07
604 0.09
605 0.09
606 0.09
607 0.1
608 0.09
609 0.09
610 0.1
611 0.09
612 0.07
613 0.08
614 0.09
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.09
619 0.13
620 0.12
621 0.11
622 0.11
623 0.11
624 0.11
625 0.12
626 0.13
627 0.11
628 0.11
629 0.12
630 0.12
631 0.13
632 0.13
633 0.12
634 0.12
635 0.13
636 0.14
637 0.15
638 0.16
639 0.15
640 0.16
641 0.17
642 0.16
643 0.15
644 0.15
645 0.16
646 0.15
647 0.15
648 0.13
649 0.12
650 0.12
651 0.09
652 0.09
653 0.06
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.08
661 0.07
662 0.1
663 0.11
664 0.11
665 0.11
666 0.11
667 0.14
668 0.12
669 0.13
670 0.12
671 0.17
672 0.18
673 0.2
674 0.26
675 0.25
676 0.25
677 0.31
678 0.33
679 0.31
680 0.38
681 0.41
682 0.4
683 0.38
684 0.42
685 0.37
686 0.37
687 0.36
688 0.28
689 0.23
690 0.19
691 0.19
692 0.15
693 0.14
694 0.1
695 0.08
696 0.08
697 0.08
698 0.08
699 0.09
700 0.12
701 0.14
702 0.15
703 0.17
704 0.2
705 0.21
706 0.27
707 0.32
708 0.35
709 0.36
710 0.44
711 0.46
712 0.47
713 0.46
714 0.41
715 0.39
716 0.43
717 0.48
718 0.42
719 0.41
720 0.38
721 0.4
722 0.41
723 0.37
724 0.34
725 0.26
726 0.25
727 0.26
728 0.25
729 0.23
730 0.21
731 0.21
732 0.15
733 0.13
734 0.14
735 0.11
736 0.17
737 0.16
738 0.19
739 0.19
740 0.21
741 0.23
742 0.21
743 0.19
744 0.15
745 0.16
746 0.17
747 0.19
748 0.2
749 0.21
750 0.21
751 0.23
752 0.25
753 0.24
754 0.22
755 0.23
756 0.24
757 0.29
758 0.36
759 0.39
760 0.41
761 0.41
762 0.39
763 0.41
764 0.38
765 0.33
766 0.29
767 0.27
768 0.22
769 0.22
770 0.21
771 0.15
772 0.15
773 0.13
774 0.08
775 0.07
776 0.06
777 0.05
778 0.05
779 0.05
780 0.04
781 0.03
782 0.04
783 0.04
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.07
788 0.09
789 0.1
790 0.1
791 0.11
792 0.17
793 0.2
794 0.23
795 0.27
796 0.33
797 0.38
798 0.45
799 0.47
800 0.41
801 0.39
802 0.39
803 0.37
804 0.31
805 0.28
806 0.22
807 0.22
808 0.22
809 0.22
810 0.28
811 0.31
812 0.35
813 0.37
814 0.45
815 0.45
816 0.47
817 0.48
818 0.45
819 0.4
820 0.37
821 0.35
822 0.27
823 0.26
824 0.23
825 0.21
826 0.16
827 0.14
828 0.11
829 0.09
830 0.09
831 0.08
832 0.08
833 0.09
834 0.09
835 0.09
836 0.1
837 0.1
838 0.1
839 0.12
840 0.12
841 0.13
842 0.15
843 0.18
844 0.21
845 0.22
846 0.23
847 0.25
848 0.26
849 0.24
850 0.24
851 0.22
852 0.22
853 0.23
854 0.22
855 0.18
856 0.19
857 0.2
858 0.19
859 0.19
860 0.16
861 0.15
862 0.19
863 0.21
864 0.2
865 0.21
866 0.21
867 0.19
868 0.19
869 0.18
870 0.14
871 0.1
872 0.09
873 0.07
874 0.09
875 0.09
876 0.08
877 0.09
878 0.09
879 0.1
880 0.1
881 0.12
882 0.14
883 0.18
884 0.23
885 0.22
886 0.28
887 0.28
888 0.29
889 0.31
890 0.3
891 0.29
892 0.32
893 0.32
894 0.28
895 0.37
896 0.37
897 0.41
898 0.46
899 0.45
900 0.39
901 0.42
902 0.42
903 0.37
904 0.4
905 0.34
906 0.25
907 0.23
908 0.22
909 0.19
910 0.19
911 0.15
912 0.13
913 0.12
914 0.14
915 0.15
916 0.16
917 0.16
918 0.15
919 0.18
920 0.17
921 0.21
922 0.26
923 0.26
924 0.24
925 0.23
926 0.23
927 0.2
928 0.18
929 0.15
930 0.09
931 0.09
932 0.09
933 0.09
934 0.08
935 0.08
936 0.07
937 0.08
938 0.08
939 0.09
940 0.1
941 0.13
942 0.14
943 0.14
944 0.15
945 0.18
946 0.24
947 0.27
948 0.31
949 0.33
950 0.34
951 0.38
952 0.42
953 0.41
954 0.44
955 0.43
956 0.4
957 0.39
958 0.37
959 0.34
960 0.32
961 0.29
962 0.2
963 0.17
964 0.14
965 0.1
966 0.1
967 0.09
968 0.05
969 0.05
970 0.06
971 0.07
972 0.09
973 0.11
974 0.11
975 0.11
976 0.17
977 0.2