Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QJW1

Protein Details
Accession W1QJW1    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-88GFFEEPSKKNHTQKKKKNKHAPSETSAKKHydrophilic
190-211IKDYKKKTGKEFVKRSDKRKLVBasic
217-247QNMKGKQREKVMERKRKRRLGKEMRQFEQNYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-89KKNHTQKKKKNKHAPSETSAKKP
194-238KKKTGKEFVKRSDKRKLVQVARFQNMKGKQREKVMERKRKRRLGK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
KEGG opa:HPODL_02298  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MSRRPQFSRHDLDSEDEDAYSSEASNDSLSSLSFGALSAAQKKLDEEDRNSEAESDSEGGFFEEPSKKNHTQKKKKNKHAPSETSAKKPVSKVREIPGLLDGTKYAKTKYHDIRFDSAFGKVNESEVRRNYKFLDEYRQKELEQVQSVLKDPKKRNKLSEKELQDLDYIAKSTKSRLDALKNKDLEREVIKDYKKKTGKEFVKRSDKRKLVQVARFQNMKGKQREKVMERKRKRRLGKEMRQFEQNYGDASR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.37
3 0.28
4 0.23
5 0.18
6 0.17
7 0.13
8 0.09
9 0.08
10 0.07
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.09
18 0.08
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.09
24 0.11
25 0.13
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.16
30 0.2
31 0.26
32 0.3
33 0.31
34 0.36
35 0.38
36 0.39
37 0.38
38 0.35
39 0.27
40 0.22
41 0.19
42 0.13
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.11
50 0.16
51 0.17
52 0.21
53 0.29
54 0.34
55 0.42
56 0.52
57 0.59
58 0.64
59 0.74
60 0.82
61 0.85
62 0.9
63 0.93
64 0.93
65 0.93
66 0.92
67 0.88
68 0.82
69 0.81
70 0.74
71 0.68
72 0.64
73 0.55
74 0.47
75 0.44
76 0.46
77 0.42
78 0.44
79 0.43
80 0.42
81 0.47
82 0.44
83 0.41
84 0.36
85 0.31
86 0.25
87 0.21
88 0.17
89 0.12
90 0.14
91 0.14
92 0.12
93 0.15
94 0.18
95 0.26
96 0.35
97 0.41
98 0.43
99 0.46
100 0.48
101 0.45
102 0.45
103 0.37
104 0.3
105 0.26
106 0.21
107 0.2
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.19
112 0.21
113 0.2
114 0.27
115 0.25
116 0.27
117 0.27
118 0.27
119 0.29
120 0.27
121 0.34
122 0.34
123 0.37
124 0.41
125 0.42
126 0.38
127 0.37
128 0.38
129 0.33
130 0.28
131 0.26
132 0.21
133 0.2
134 0.22
135 0.25
136 0.25
137 0.29
138 0.34
139 0.42
140 0.51
141 0.54
142 0.62
143 0.67
144 0.72
145 0.7
146 0.73
147 0.68
148 0.63
149 0.59
150 0.51
151 0.41
152 0.33
153 0.27
154 0.18
155 0.14
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.12
160 0.16
161 0.18
162 0.21
163 0.25
164 0.35
165 0.41
166 0.48
167 0.54
168 0.54
169 0.52
170 0.52
171 0.48
172 0.41
173 0.37
174 0.33
175 0.29
176 0.32
177 0.36
178 0.38
179 0.4
180 0.47
181 0.49
182 0.5
183 0.53
184 0.57
185 0.63
186 0.68
187 0.74
188 0.74
189 0.8
190 0.82
191 0.81
192 0.81
193 0.78
194 0.71
195 0.7
196 0.7
197 0.68
198 0.69
199 0.72
200 0.7
201 0.7
202 0.69
203 0.6
204 0.58
205 0.57
206 0.58
207 0.58
208 0.56
209 0.55
210 0.62
211 0.7
212 0.69
213 0.72
214 0.74
215 0.75
216 0.8
217 0.85
218 0.87
219 0.88
220 0.91
221 0.91
222 0.91
223 0.92
224 0.92
225 0.92
226 0.91
227 0.85
228 0.83
229 0.74
230 0.66
231 0.62
232 0.52