Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QJG3

Protein Details
Accession W1QJG3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-161DCWSKAKSVRRLIKNDEPSKHydrophilic
1018-1038KNKIEQFIKERRRHRDSQGDVBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
KEGG opa:HPODL_04776  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSDPEEIRAKRLARLAALSNEPSQPKPKKIASPVTPSPVASSVVKPFDKSVSSTREPSISGSSSPERRQTESIEDWINTKLEFILQATLSKQKALKYTYLESMAQELQTFNTDSIDSILLDILTERGIDSTKYETPFEYLSDCWSKAKSVRRLIKNDEPSKETKLHLIDEVIRLTSSYSLLLFQVPDMYVDEVKLDVIVRQLWSSINKYDTFLMDIISRSIDNDSVLDFLNVFLPHLSQQLLSLNYSTDTDYSKILTVYQILVSNKTIASQLYLVDGFHPEGLKANEFELKTILGPVLRVSPLLPEVAVSNYPEGLTKIQIKNVHESLHSEQVVLINRLFGICDKIVRSGEACRTAFLKLLAEIVNKNHLRRGEHANPKKLASDSFMFCITMVLVKLSQPFLSDGIKIDKISMDYLSRRNKLLDLKEETKINSTIQEYEEHYPEDSLSDEPLNFISECFFLMLSYLQYGFGGMIINSERLSNHVKQLTQELAKLEEMLQKTSTDNANPLAKMLADTRLKPLKKELQKLKSMKLSIDMCSLNRELQLEIFDVINGAIKFFIRLIEPTHSYPNIALKIPFNKFDDDVDKFDDFEYLRSIAPVPFKYYPEIFIEGIVNYCHYIAKFSNNPMLQNEKQLNQFIEFAIIILRCPELVNNPHLKARLTEVLFFGSLPMANNMDGYMVHIFNNNDLVKENLLISLLDFYVMVEKTGASSQFYDKFNARCHISMILEQLWKFDFYRADLRRISKNQKFFVRLIARMLNDTTYLLDESLNHLHTIGTCQREIASRKKGNSPATEESDEDLNKKLQESERMAKSLVQLSNKTIQLFDLFTKEIPSAFYIVEIVDRLAGMLNYNLVALVGPRCNELRVQDPETYHFNPSELLLHICSIFINLSNGQEFVEAVARDSRSFSPACFKRAIQILNKVGKIDVEFSTKLNSFVEQAEKVKVEDEEEELELGEIPDEFLDPLMFTLMKDPVKLPQSKVSMDRSVLKAHLMNDPTDPFNRTPLKLEDVAEDTELKNKIEQFIKERRRHRDSQGDVNME
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.4
4 0.43
5 0.41
6 0.38
7 0.4
8 0.39
9 0.38
10 0.43
11 0.45
12 0.47
13 0.52
14 0.57
15 0.61
16 0.68
17 0.74
18 0.73
19 0.75
20 0.75
21 0.73
22 0.67
23 0.58
24 0.52
25 0.44
26 0.39
27 0.32
28 0.29
29 0.28
30 0.34
31 0.35
32 0.33
33 0.33
34 0.34
35 0.34
36 0.34
37 0.36
38 0.37
39 0.41
40 0.43
41 0.43
42 0.41
43 0.4
44 0.39
45 0.37
46 0.31
47 0.27
48 0.29
49 0.34
50 0.39
51 0.42
52 0.47
53 0.46
54 0.48
55 0.5
56 0.49
57 0.5
58 0.47
59 0.48
60 0.44
61 0.41
62 0.37
63 0.37
64 0.33
65 0.24
66 0.2
67 0.15
68 0.12
69 0.13
70 0.12
71 0.14
72 0.14
73 0.16
74 0.17
75 0.24
76 0.23
77 0.26
78 0.27
79 0.27
80 0.33
81 0.35
82 0.39
83 0.39
84 0.42
85 0.43
86 0.45
87 0.42
88 0.36
89 0.36
90 0.32
91 0.26
92 0.23
93 0.18
94 0.15
95 0.17
96 0.17
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.06
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.14
118 0.19
119 0.21
120 0.22
121 0.22
122 0.24
123 0.25
124 0.24
125 0.21
126 0.17
127 0.21
128 0.24
129 0.24
130 0.24
131 0.24
132 0.26
133 0.3
134 0.39
135 0.43
136 0.49
137 0.57
138 0.65
139 0.71
140 0.76
141 0.79
142 0.8
143 0.79
144 0.73
145 0.68
146 0.63
147 0.61
148 0.56
149 0.47
150 0.42
151 0.38
152 0.35
153 0.32
154 0.31
155 0.29
156 0.29
157 0.29
158 0.23
159 0.2
160 0.18
161 0.17
162 0.15
163 0.12
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.06
184 0.08
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.13
190 0.16
191 0.19
192 0.21
193 0.23
194 0.23
195 0.24
196 0.25
197 0.23
198 0.23
199 0.19
200 0.17
201 0.15
202 0.14
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.1
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.11
224 0.12
225 0.08
226 0.1
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.14
234 0.13
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.16
248 0.15
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.1
256 0.12
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.08
268 0.11
269 0.13
270 0.14
271 0.13
272 0.14
273 0.18
274 0.18
275 0.18
276 0.15
277 0.14
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.09
303 0.12
304 0.19
305 0.2
306 0.24
307 0.28
308 0.3
309 0.35
310 0.36
311 0.34
312 0.27
313 0.31
314 0.3
315 0.32
316 0.3
317 0.24
318 0.22
319 0.24
320 0.26
321 0.23
322 0.19
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.09
328 0.1
329 0.09
330 0.11
331 0.12
332 0.15
333 0.15
334 0.16
335 0.17
336 0.17
337 0.21
338 0.26
339 0.25
340 0.23
341 0.24
342 0.24
343 0.24
344 0.2
345 0.17
346 0.1
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.14
351 0.13
352 0.21
353 0.22
354 0.22
355 0.23
356 0.24
357 0.26
358 0.29
359 0.37
360 0.38
361 0.48
362 0.55
363 0.59
364 0.58
365 0.57
366 0.55
367 0.46
368 0.37
369 0.3
370 0.27
371 0.21
372 0.2
373 0.2
374 0.17
375 0.16
376 0.15
377 0.11
378 0.09
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.12
390 0.11
391 0.11
392 0.14
393 0.15
394 0.15
395 0.14
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.12
401 0.14
402 0.21
403 0.28
404 0.28
405 0.29
406 0.29
407 0.31
408 0.35
409 0.37
410 0.37
411 0.37
412 0.39
413 0.4
414 0.41
415 0.38
416 0.34
417 0.31
418 0.24
419 0.19
420 0.17
421 0.16
422 0.16
423 0.17
424 0.17
425 0.18
426 0.19
427 0.17
428 0.16
429 0.14
430 0.13
431 0.11
432 0.09
433 0.08
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.09
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.08
467 0.13
468 0.13
469 0.17
470 0.19
471 0.2
472 0.2
473 0.23
474 0.24
475 0.2
476 0.21
477 0.17
478 0.16
479 0.15
480 0.15
481 0.13
482 0.13
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.12
487 0.12
488 0.14
489 0.14
490 0.1
491 0.11
492 0.13
493 0.14
494 0.13
495 0.13
496 0.11
497 0.1
498 0.11
499 0.1
500 0.14
501 0.13
502 0.14
503 0.19
504 0.26
505 0.26
506 0.26
507 0.31
508 0.34
509 0.39
510 0.47
511 0.52
512 0.52
513 0.6
514 0.63
515 0.61
516 0.58
517 0.52
518 0.43
519 0.4
520 0.34
521 0.27
522 0.27
523 0.23
524 0.18
525 0.2
526 0.2
527 0.15
528 0.14
529 0.13
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.08
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.07
547 0.05
548 0.06
549 0.09
550 0.12
551 0.14
552 0.16
553 0.19
554 0.18
555 0.18
556 0.18
557 0.19
558 0.18
559 0.16
560 0.15
561 0.15
562 0.21
563 0.22
564 0.25
565 0.23
566 0.22
567 0.22
568 0.23
569 0.25
570 0.22
571 0.22
572 0.23
573 0.21
574 0.2
575 0.19
576 0.19
577 0.14
578 0.12
579 0.12
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.15
586 0.15
587 0.18
588 0.19
589 0.2
590 0.22
591 0.22
592 0.22
593 0.21
594 0.23
595 0.18
596 0.16
597 0.16
598 0.14
599 0.14
600 0.11
601 0.09
602 0.06
603 0.07
604 0.07
605 0.06
606 0.08
607 0.08
608 0.14
609 0.16
610 0.18
611 0.25
612 0.25
613 0.26
614 0.26
615 0.32
616 0.28
617 0.31
618 0.32
619 0.28
620 0.29
621 0.3
622 0.29
623 0.23
624 0.23
625 0.17
626 0.16
627 0.13
628 0.1
629 0.1
630 0.09
631 0.07
632 0.07
633 0.07
634 0.06
635 0.06
636 0.07
637 0.09
638 0.12
639 0.18
640 0.23
641 0.24
642 0.26
643 0.27
644 0.27
645 0.24
646 0.25
647 0.26
648 0.22
649 0.22
650 0.21
651 0.21
652 0.2
653 0.19
654 0.15
655 0.09
656 0.08
657 0.07
658 0.08
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.06
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.11
670 0.11
671 0.11
672 0.17
673 0.15
674 0.14
675 0.14
676 0.15
677 0.13
678 0.14
679 0.13
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.07
684 0.07
685 0.06
686 0.06
687 0.05
688 0.05
689 0.08
690 0.08
691 0.08
692 0.07
693 0.07
694 0.08
695 0.1
696 0.1
697 0.08
698 0.1
699 0.13
700 0.19
701 0.21
702 0.22
703 0.24
704 0.27
705 0.31
706 0.33
707 0.33
708 0.27
709 0.28
710 0.28
711 0.26
712 0.24
713 0.23
714 0.22
715 0.22
716 0.21
717 0.2
718 0.18
719 0.18
720 0.17
721 0.17
722 0.14
723 0.15
724 0.26
725 0.27
726 0.32
727 0.35
728 0.38
729 0.43
730 0.5
731 0.57
732 0.54
733 0.59
734 0.6
735 0.63
736 0.64
737 0.56
738 0.58
739 0.54
740 0.48
741 0.45
742 0.42
743 0.36
744 0.33
745 0.33
746 0.23
747 0.18
748 0.17
749 0.14
750 0.11
751 0.1
752 0.09
753 0.08
754 0.08
755 0.12
756 0.14
757 0.14
758 0.13
759 0.13
760 0.13
761 0.13
762 0.18
763 0.19
764 0.19
765 0.18
766 0.18
767 0.19
768 0.25
769 0.3
770 0.33
771 0.38
772 0.41
773 0.45
774 0.52
775 0.58
776 0.59
777 0.6
778 0.59
779 0.54
780 0.55
781 0.54
782 0.47
783 0.41
784 0.38
785 0.33
786 0.27
787 0.23
788 0.19
789 0.18
790 0.18
791 0.21
792 0.2
793 0.28
794 0.34
795 0.39
796 0.41
797 0.42
798 0.42
799 0.39
800 0.39
801 0.38
802 0.35
803 0.31
804 0.29
805 0.31
806 0.37
807 0.37
808 0.35
809 0.27
810 0.24
811 0.22
812 0.22
813 0.2
814 0.17
815 0.16
816 0.15
817 0.17
818 0.16
819 0.15
820 0.14
821 0.14
822 0.12
823 0.11
824 0.11
825 0.1
826 0.1
827 0.1
828 0.09
829 0.08
830 0.06
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.06
835 0.06
836 0.06
837 0.06
838 0.06
839 0.06
840 0.06
841 0.05
842 0.05
843 0.06
844 0.08
845 0.1
846 0.1
847 0.13
848 0.14
849 0.15
850 0.17
851 0.18
852 0.23
853 0.28
854 0.31
855 0.33
856 0.34
857 0.36
858 0.41
859 0.41
860 0.36
861 0.3
862 0.26
863 0.23
864 0.22
865 0.21
866 0.16
867 0.16
868 0.14
869 0.15
870 0.14
871 0.14
872 0.12
873 0.11
874 0.09
875 0.08
876 0.1
877 0.11
878 0.13
879 0.13
880 0.14
881 0.13
882 0.13
883 0.12
884 0.1
885 0.14
886 0.12
887 0.12
888 0.17
889 0.17
890 0.18
891 0.21
892 0.21
893 0.2
894 0.21
895 0.21
896 0.27
897 0.3
898 0.34
899 0.34
900 0.33
901 0.36
902 0.42
903 0.47
904 0.43
905 0.48
906 0.52
907 0.56
908 0.57
909 0.51
910 0.44
911 0.4
912 0.35
913 0.29
914 0.23
915 0.21
916 0.21
917 0.22
918 0.27
919 0.26
920 0.25
921 0.23
922 0.21
923 0.18
924 0.2
925 0.24
926 0.22
927 0.24
928 0.27
929 0.27
930 0.26
931 0.27
932 0.24
933 0.21
934 0.19
935 0.2
936 0.18
937 0.18
938 0.18
939 0.15
940 0.15
941 0.13
942 0.12
943 0.09
944 0.06
945 0.06
946 0.06
947 0.06
948 0.06
949 0.06
950 0.06
951 0.06
952 0.06
953 0.08
954 0.08
955 0.08
956 0.11
957 0.17
958 0.17
959 0.19
960 0.2
961 0.25
962 0.33
963 0.37
964 0.37
965 0.4
966 0.44
967 0.47
968 0.52
969 0.51
970 0.49
971 0.48
972 0.51
973 0.45
974 0.44
975 0.4
976 0.38
977 0.35
978 0.32
979 0.36
980 0.31
981 0.3
982 0.3
983 0.32
984 0.32
985 0.32
986 0.34
987 0.27
988 0.34
989 0.38
990 0.36
991 0.39
992 0.4
993 0.43
994 0.42
995 0.43
996 0.39
997 0.36
998 0.36
999 0.32
1000 0.29
1001 0.23
1002 0.26
1003 0.26
1004 0.23
1005 0.23
1006 0.24
1007 0.29
1008 0.33
1009 0.38
1010 0.4
1011 0.5
1012 0.59
1013 0.65
1014 0.72
1015 0.76
1016 0.77
1017 0.79
1018 0.81
1019 0.81
1020 0.77
1021 0.79