Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QB18

Protein Details
Accession W1QB18    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-73DEIKKELHRTQPKGYKKKLRQLKVKMGHGGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-62PKGYKKKLR
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 12.166, cyto_mito 10.999, nucl 6.5, cyto_nucl 6.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0106029  F:tRNA pseudouridine synthase activity  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG opa:HPODL_03184  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MYRRTLMDGIFAINKPSGVTSSNFLTRVNKIFNESEVFKPALDEIKKELHRTQPKGYKKKLRQLKVKMGHGGTLDPLASGVLIVGVGSGTKKLGGYLNGSVKVYEAEALFGGSTTTGDSEGQLLTISGVDHITKEKVELLKKMFVGHLQQTPPIFSALKMEGMPLYEYARRGLPLPRKIEPREVQVYELDLKDDCLSTDHPYEFLKSEVDEDGTALVDKLSGNPTLNDHKVSFSKEYMELCDHDESLSRECEPLRTVKEFPDGFKAPLLHFTSKVSSGTYIRSLISDMGRAVGSSAYMVKLIRRNQAEWDLEKNVFDIEDFEQDAKIWGPVLGKVFKEGASVNVKEELAALGMDRKLQEHEQESKRVKVED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.17
3 0.18
4 0.16
5 0.14
6 0.16
7 0.17
8 0.21
9 0.25
10 0.26
11 0.26
12 0.29
13 0.31
14 0.35
15 0.37
16 0.34
17 0.35
18 0.36
19 0.37
20 0.38
21 0.37
22 0.34
23 0.33
24 0.32
25 0.27
26 0.26
27 0.25
28 0.27
29 0.25
30 0.24
31 0.24
32 0.33
33 0.36
34 0.39
35 0.43
36 0.45
37 0.53
38 0.57
39 0.63
40 0.63
41 0.71
42 0.77
43 0.82
44 0.83
45 0.83
46 0.87
47 0.87
48 0.87
49 0.87
50 0.87
51 0.88
52 0.86
53 0.83
54 0.8
55 0.71
56 0.64
57 0.54
58 0.45
59 0.34
60 0.26
61 0.19
62 0.12
63 0.11
64 0.08
65 0.07
66 0.05
67 0.04
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.02
72 0.02
73 0.03
74 0.03
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.07
80 0.09
81 0.11
82 0.14
83 0.2
84 0.24
85 0.26
86 0.26
87 0.24
88 0.22
89 0.21
90 0.17
91 0.13
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.12
123 0.16
124 0.18
125 0.22
126 0.24
127 0.27
128 0.28
129 0.28
130 0.25
131 0.23
132 0.24
133 0.23
134 0.24
135 0.21
136 0.22
137 0.21
138 0.22
139 0.2
140 0.18
141 0.15
142 0.1
143 0.13
144 0.12
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.18
160 0.24
161 0.29
162 0.33
163 0.36
164 0.42
165 0.44
166 0.51
167 0.46
168 0.44
169 0.44
170 0.4
171 0.36
172 0.3
173 0.3
174 0.23
175 0.21
176 0.16
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.1
185 0.13
186 0.12
187 0.13
188 0.13
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.11
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.12
212 0.17
213 0.18
214 0.2
215 0.18
216 0.2
217 0.21
218 0.25
219 0.24
220 0.2
221 0.21
222 0.21
223 0.22
224 0.22
225 0.22
226 0.19
227 0.19
228 0.2
229 0.17
230 0.15
231 0.16
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.16
239 0.15
240 0.19
241 0.21
242 0.24
243 0.25
244 0.26
245 0.34
246 0.33
247 0.33
248 0.35
249 0.33
250 0.3
251 0.31
252 0.3
253 0.23
254 0.29
255 0.32
256 0.26
257 0.25
258 0.26
259 0.26
260 0.26
261 0.26
262 0.2
263 0.18
264 0.18
265 0.2
266 0.2
267 0.18
268 0.17
269 0.17
270 0.17
271 0.17
272 0.16
273 0.15
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.06
284 0.08
285 0.08
286 0.12
287 0.19
288 0.24
289 0.31
290 0.34
291 0.35
292 0.39
293 0.47
294 0.47
295 0.44
296 0.45
297 0.41
298 0.38
299 0.37
300 0.32
301 0.24
302 0.19
303 0.16
304 0.13
305 0.11
306 0.13
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.16
312 0.13
313 0.12
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.13
318 0.18
319 0.21
320 0.2
321 0.23
322 0.24
323 0.22
324 0.23
325 0.21
326 0.22
327 0.25
328 0.26
329 0.25
330 0.27
331 0.27
332 0.25
333 0.25
334 0.19
335 0.13
336 0.12
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.14
341 0.14
342 0.15
343 0.19
344 0.22
345 0.28
346 0.3
347 0.4
348 0.43
349 0.53
350 0.57
351 0.58