Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1Q940

Protein Details
Accession W1Q940    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MNICCFQRHTLKPRATQQIRKMSQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 7, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR002318  Ala-tRNA-lgiase_IIc  
IPR018162  Ala-tRNA-ligase_IIc_anticod-bd  
IPR018165  Ala-tRNA-synth_IIc_core  
IPR018164  Ala-tRNA-synth_IIc_N  
IPR023033  Ala_tRNA_ligase_euk/bac  
IPR003156  DHHA1_dom  
IPR018163  Thr/Ala-tRNA-synth_IIc_edit  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
IPR012947  tRNA_SAD  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0004813  F:alanine-tRNA ligase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0070143  P:mitochondrial alanyl-tRNA aminoacylation  
KEGG opa:HPODL_03186  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02272  DHHA1  
PF01411  tRNA-synt_2c  
PF07973  tRNA_SAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50860  AA_TRNA_LIGASE_II_ALA  
CDD cd00673  AlaRS_core  
Amino Acid Sequences MNICCFQRHTLKPRATQQIRKMSQQWTATKVRNTFLDYFKDRGHTFVSSSSVIPHDDPTLLFANAGMNQYKPIFLGTVDPSSSFASLKRAVNSQKCIRAGGKHNDLEDVGRDSYHHTFFEMLGNWSFGDYFKKEAIQYSWDLLTNVYGLNKDRLYVTYFEGDAANGLEPDLEAKQYWKDVGVADDHILPGNAKDNFWEMGDQGPCGPCSEIHYDRIGGRNAASLVNQDDPDVLEIWNNVFIQFNREQDGSLKPLPAKHVDTGMGFERLVSVLQNVRSNYDTDVFQPLFSKIQEITGVRPYSGKFGKDDLDGIDTAYRVLADHVRTLTFALADGGVPNNEGRGYVLRRILRRGARYVRKYMNYPIGKFFSQLAPTLIEQVKDIFPEVATNTDTIFEILDEEEASFARTLDRGEKLFEQYAIIASKTPEQTLAGRDVWRLYDTYGFPVDLTRLMAEEAGLNIDEEGFEKARLASLEASKAGGSKSGKTLLKLDVHILGALDSNKDIPVTDDSYKYGNQDIKTKIVGIYNGKELLGSTEGTEAGQQLGVLLEKTPFYAEQGGQEYDTGKIVIDGVAEFEVENVQSYAGYVLHTGHVVEGKFSVGDQVIAGYDELRRWPIRNNHTGTHILNLALREILGDGVDQKGSLVAAEKLRFDFSNKAAVTLEQLEKIEAICNKIIKDSMPVYSKPVALNVAKSIYGLRAVFGETYPDPVRVVSIGVPVEELLAKPDNKEWYDYSVEFCGGTHVAKTSDIKELVIVEESGIAKGIRRIVAVTGTEAHEVQRIAKEFDEQLDAIEKMPFGEAKEKKLKETSTKLGQLSISVLQKAQLKDKFAKIDKAVKDEVKARQKADTKKALDAVKEFFAEHEDAPFLVKHIDISANAKIITETINMIKKENKEKSLFLITGQKDDARVAQGVYISDEHLGKVQATEVANVAASYIGGKAGGKGNVCQGMGTEAAQIDKAISAVEKLLESKLIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.8
3 0.8
4 0.82
5 0.83
6 0.79
7 0.77
8 0.74
9 0.68
10 0.67
11 0.66
12 0.61
13 0.57
14 0.61
15 0.6
16 0.62
17 0.6
18 0.56
19 0.52
20 0.53
21 0.51
22 0.48
23 0.51
24 0.48
25 0.48
26 0.47
27 0.48
28 0.43
29 0.39
30 0.38
31 0.31
32 0.28
33 0.28
34 0.29
35 0.25
36 0.25
37 0.25
38 0.23
39 0.23
40 0.22
41 0.21
42 0.18
43 0.18
44 0.17
45 0.19
46 0.2
47 0.18
48 0.17
49 0.15
50 0.16
51 0.17
52 0.2
53 0.17
54 0.14
55 0.17
56 0.18
57 0.18
58 0.16
59 0.14
60 0.12
61 0.12
62 0.17
63 0.18
64 0.21
65 0.21
66 0.21
67 0.22
68 0.23
69 0.23
70 0.19
71 0.16
72 0.18
73 0.24
74 0.27
75 0.28
76 0.33
77 0.41
78 0.48
79 0.56
80 0.58
81 0.6
82 0.58
83 0.59
84 0.56
85 0.55
86 0.57
87 0.58
88 0.59
89 0.54
90 0.54
91 0.51
92 0.48
93 0.41
94 0.35
95 0.29
96 0.21
97 0.17
98 0.17
99 0.2
100 0.24
101 0.24
102 0.22
103 0.19
104 0.19
105 0.2
106 0.25
107 0.22
108 0.2
109 0.19
110 0.19
111 0.18
112 0.17
113 0.17
114 0.12
115 0.16
116 0.15
117 0.17
118 0.18
119 0.21
120 0.21
121 0.25
122 0.27
123 0.25
124 0.26
125 0.26
126 0.26
127 0.24
128 0.24
129 0.2
130 0.18
131 0.14
132 0.13
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.17
137 0.17
138 0.17
139 0.18
140 0.18
141 0.21
142 0.21
143 0.22
144 0.2
145 0.2
146 0.2
147 0.19
148 0.17
149 0.14
150 0.13
151 0.11
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.09
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.16
168 0.16
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.11
176 0.09
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.14
181 0.16
182 0.17
183 0.18
184 0.18
185 0.12
186 0.17
187 0.18
188 0.17
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.17
194 0.11
195 0.15
196 0.23
197 0.23
198 0.25
199 0.27
200 0.27
201 0.29
202 0.33
203 0.3
204 0.23
205 0.21
206 0.21
207 0.2
208 0.19
209 0.17
210 0.14
211 0.15
212 0.17
213 0.16
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.1
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.17
229 0.19
230 0.2
231 0.21
232 0.21
233 0.21
234 0.21
235 0.25
236 0.24
237 0.23
238 0.24
239 0.22
240 0.24
241 0.28
242 0.3
243 0.3
244 0.26
245 0.27
246 0.25
247 0.24
248 0.25
249 0.23
250 0.2
251 0.16
252 0.15
253 0.13
254 0.11
255 0.11
256 0.08
257 0.08
258 0.1
259 0.13
260 0.17
261 0.17
262 0.19
263 0.2
264 0.21
265 0.21
266 0.19
267 0.17
268 0.15
269 0.21
270 0.19
271 0.18
272 0.19
273 0.18
274 0.18
275 0.17
276 0.18
277 0.12
278 0.13
279 0.16
280 0.16
281 0.18
282 0.23
283 0.23
284 0.21
285 0.23
286 0.22
287 0.25
288 0.27
289 0.25
290 0.2
291 0.22
292 0.24
293 0.23
294 0.24
295 0.18
296 0.17
297 0.16
298 0.15
299 0.13
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.07
304 0.05
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.14
313 0.12
314 0.09
315 0.08
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.1
329 0.13
330 0.16
331 0.22
332 0.25
333 0.27
334 0.31
335 0.37
336 0.38
337 0.39
338 0.44
339 0.48
340 0.54
341 0.57
342 0.61
343 0.6
344 0.58
345 0.57
346 0.54
347 0.54
348 0.49
349 0.46
350 0.43
351 0.4
352 0.37
353 0.35
354 0.31
355 0.24
356 0.21
357 0.2
358 0.17
359 0.15
360 0.15
361 0.19
362 0.18
363 0.15
364 0.14
365 0.15
366 0.14
367 0.13
368 0.13
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.07
380 0.07
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.07
395 0.1
396 0.12
397 0.12
398 0.14
399 0.16
400 0.18
401 0.18
402 0.17
403 0.15
404 0.12
405 0.14
406 0.12
407 0.11
408 0.09
409 0.08
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.11
414 0.12
415 0.13
416 0.14
417 0.17
418 0.15
419 0.15
420 0.15
421 0.15
422 0.15
423 0.14
424 0.12
425 0.1
426 0.12
427 0.11
428 0.13
429 0.13
430 0.12
431 0.12
432 0.12
433 0.11
434 0.08
435 0.08
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.03
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.11
463 0.1
464 0.1
465 0.09
466 0.11
467 0.1
468 0.1
469 0.12
470 0.18
471 0.19
472 0.19
473 0.22
474 0.22
475 0.23
476 0.23
477 0.22
478 0.17
479 0.16
480 0.15
481 0.13
482 0.09
483 0.08
484 0.08
485 0.07
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.08
493 0.11
494 0.12
495 0.13
496 0.14
497 0.16
498 0.16
499 0.16
500 0.17
501 0.17
502 0.17
503 0.23
504 0.23
505 0.24
506 0.24
507 0.23
508 0.21
509 0.19
510 0.2
511 0.17
512 0.17
513 0.16
514 0.16
515 0.15
516 0.14
517 0.13
518 0.11
519 0.1
520 0.08
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.05
528 0.05
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.06
539 0.05
540 0.07
541 0.09
542 0.09
543 0.11
544 0.14
545 0.14
546 0.14
547 0.14
548 0.13
549 0.11
550 0.11
551 0.09
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.04
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.06
597 0.07
598 0.09
599 0.1
600 0.11
601 0.19
602 0.27
603 0.35
604 0.43
605 0.46
606 0.45
607 0.48
608 0.5
609 0.44
610 0.37
611 0.3
612 0.22
613 0.19
614 0.17
615 0.14
616 0.1
617 0.09
618 0.07
619 0.06
620 0.06
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.05
631 0.06
632 0.07
633 0.11
634 0.13
635 0.14
636 0.14
637 0.16
638 0.16
639 0.18
640 0.2
641 0.18
642 0.25
643 0.24
644 0.25
645 0.24
646 0.23
647 0.23
648 0.22
649 0.22
650 0.15
651 0.15
652 0.14
653 0.13
654 0.14
655 0.15
656 0.12
657 0.13
658 0.14
659 0.16
660 0.16
661 0.17
662 0.17
663 0.14
664 0.18
665 0.17
666 0.2
667 0.22
668 0.22
669 0.26
670 0.27
671 0.29
672 0.24
673 0.24
674 0.23
675 0.2
676 0.21
677 0.19
678 0.18
679 0.16
680 0.16
681 0.15
682 0.11
683 0.13
684 0.12
685 0.1
686 0.09
687 0.1
688 0.1
689 0.1
690 0.13
691 0.1
692 0.15
693 0.16
694 0.16
695 0.15
696 0.15
697 0.15
698 0.12
699 0.13
700 0.09
701 0.11
702 0.1
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.09
708 0.08
709 0.08
710 0.12
711 0.12
712 0.13
713 0.17
714 0.22
715 0.22
716 0.26
717 0.24
718 0.25
719 0.3
720 0.29
721 0.28
722 0.24
723 0.23
724 0.2
725 0.18
726 0.16
727 0.12
728 0.12
729 0.1
730 0.1
731 0.1
732 0.13
733 0.15
734 0.14
735 0.19
736 0.2
737 0.19
738 0.18
739 0.18
740 0.17
741 0.16
742 0.14
743 0.08
744 0.11
745 0.11
746 0.1
747 0.1
748 0.09
749 0.09
750 0.11
751 0.15
752 0.13
753 0.13
754 0.14
755 0.15
756 0.18
757 0.18
758 0.17
759 0.16
760 0.16
761 0.17
762 0.16
763 0.15
764 0.15
765 0.14
766 0.15
767 0.18
768 0.18
769 0.19
770 0.19
771 0.22
772 0.2
773 0.22
774 0.23
775 0.18
776 0.17
777 0.18
778 0.18
779 0.16
780 0.16
781 0.14
782 0.11
783 0.12
784 0.12
785 0.11
786 0.2
787 0.22
788 0.29
789 0.39
790 0.4
791 0.43
792 0.49
793 0.52
794 0.51
795 0.57
796 0.56
797 0.55
798 0.6
799 0.57
800 0.53
801 0.48
802 0.4
803 0.34
804 0.32
805 0.25
806 0.2
807 0.19
808 0.2
809 0.25
810 0.27
811 0.32
812 0.31
813 0.34
814 0.39
815 0.45
816 0.51
817 0.5
818 0.55
819 0.52
820 0.57
821 0.56
822 0.56
823 0.56
824 0.49
825 0.49
826 0.48
827 0.52
828 0.53
829 0.54
830 0.49
831 0.52
832 0.58
833 0.63
834 0.66
835 0.66
836 0.59
837 0.6
838 0.65
839 0.6
840 0.55
841 0.5
842 0.44
843 0.37
844 0.34
845 0.29
846 0.23
847 0.23
848 0.22
849 0.18
850 0.16
851 0.14
852 0.13
853 0.15
854 0.15
855 0.12
856 0.11
857 0.1
858 0.09
859 0.11
860 0.13
861 0.13
862 0.17
863 0.19
864 0.2
865 0.2
866 0.2
867 0.18
868 0.16
869 0.17
870 0.13
871 0.13
872 0.17
873 0.23
874 0.24
875 0.26
876 0.31
877 0.36
878 0.46
879 0.51
880 0.53
881 0.51
882 0.53
883 0.56
884 0.59
885 0.52
886 0.44
887 0.46
888 0.4
889 0.4
890 0.39
891 0.34
892 0.27
893 0.28
894 0.28
895 0.21
896 0.21
897 0.17
898 0.17
899 0.18
900 0.17
901 0.19
902 0.17
903 0.14
904 0.16
905 0.16
906 0.14
907 0.15
908 0.15
909 0.13
910 0.13
911 0.13
912 0.15
913 0.16
914 0.16
915 0.15
916 0.15
917 0.14
918 0.14
919 0.13
920 0.08
921 0.07
922 0.06
923 0.06
924 0.05
925 0.06
926 0.06
927 0.09
928 0.14
929 0.18
930 0.18
931 0.2
932 0.26
933 0.3
934 0.29
935 0.27
936 0.22
937 0.21
938 0.21
939 0.2
940 0.16
941 0.12
942 0.13
943 0.13
944 0.13
945 0.1
946 0.1
947 0.09
948 0.08
949 0.07
950 0.08
951 0.09
952 0.1
953 0.11
954 0.12
955 0.13