FuNGI

C5DX14

Protein Details

Accession

C5DX14

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-31	TEDPVPKSSKKGRKHDVFESQDI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043954 Snu56_snRNP
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	zro:ZYRO0F01430g -
Pfam	View protein in Pfam PF19097 Snu56_snRNP

Amino Acid Sequences

MAPKKRVATEDPVPKSSKKGRKHDVFESQDIWKNLDRIRTQNAKAGSIIPNSYLFVPIFSDPGDYELCINALHEFVDSGKLKLQSCDDCVIPGYVCLQDFSLMDCSLVLSILFGYKNKKWISPNNSKDFFTIPKGLNVSGTFYLPSSCTGYNVRTVPTLRESQFQTHYNFKEYYISSTSLSQIVQSLVTFFHSIKFGKSSKVTSSCFSKALNQIYQTMDLGVKELPFLGEALYNPTNLTKINLPSIEKSKNNLQSYAQKLIKYNAALEPSSSSSSKNEKQTTSTHSTTRQNTPSRTNSGTGSSVNTTTHGSRPNFMTQDQIKQHCVATIKASQEVVKAKSPYQILKTYVKCPRQGYIDKVYQNLNDLRAQTNCNIVVLNLNNLHESRPWFDSLNVSNFTTYAQQPHPSTVRVVSIGGIGEHVQKALELIYKILLQENVHV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.58
3	0.6
4	0.61
5	0.6
6	0.65
7	0.71
8	0.77
9	0.83
10	0.84
11	0.84
12	0.82
13	0.77
14	0.7
15	0.65
16	0.61
17	0.55
18	0.49
19	0.41
20	0.39
21	0.37
22	0.42
23	0.4
24	0.39
25	0.47
26	0.52
27	0.51
28	0.53
29	0.52
30	0.46
31	0.43
32	0.42
33	0.38
34	0.32
35	0.31
36	0.26
37	0.25
38	0.24
39	0.23
40	0.21
41	0.16
42	0.13
43	0.15
44	0.14
45	0.14
46	0.13
47	0.13
48	0.11
49	0.14
50	0.14
51	0.12
52	0.12
53	0.11
54	0.11
55	0.1
56	0.1
57	0.08
58	0.08
59	0.08
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.14
64	0.15
65	0.15
66	0.19
67	0.23
68	0.24
69	0.26
70	0.31
71	0.27
72	0.29
73	0.31
74	0.27
75	0.24
76	0.24
77	0.23
78	0.17
79	0.14
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.11
84	0.1
85	0.11
86	0.11
87	0.13
88	0.14
89	0.12
90	0.12
91	0.11
92	0.11
93	0.1
94	0.1
95	0.07
96	0.04
97	0.04
98	0.06
99	0.07
100	0.09
101	0.14
102	0.16
103	0.24
104	0.25
105	0.3
106	0.34
107	0.44
108	0.51
109	0.57
110	0.65
111	0.67
112	0.68
113	0.64
114	0.59
115	0.52
116	0.46
117	0.39
118	0.36
119	0.28
120	0.28
121	0.29
122	0.28
123	0.26
124	0.24
125	0.23
126	0.17
127	0.17
128	0.14
129	0.12
130	0.13
131	0.11
132	0.12
133	0.12
134	0.11
135	0.13
136	0.15
137	0.16
138	0.2
139	0.21
140	0.2
141	0.2
142	0.2
143	0.21
144	0.22
145	0.27
146	0.23
147	0.26
148	0.28
149	0.29
150	0.33
151	0.34
152	0.33
153	0.35
154	0.35
155	0.35
156	0.33
157	0.29
158	0.3
159	0.27
160	0.27
161	0.23
162	0.23
163	0.2
164	0.21
165	0.21
166	0.17
167	0.16
168	0.12
169	0.1
170	0.09
171	0.08
172	0.07
173	0.07
174	0.06
175	0.07
176	0.08
177	0.07
178	0.08
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.15
183	0.15
184	0.17
185	0.2
186	0.21
187	0.24
188	0.29
189	0.3
190	0.28
191	0.32
192	0.31
193	0.3
194	0.28
195	0.27
196	0.27
197	0.29
198	0.29
199	0.25
200	0.25
201	0.25
202	0.25
203	0.2
204	0.16
205	0.12
206	0.1
207	0.1
208	0.07
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.04
217	0.05
218	0.1
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.11
224	0.1
225	0.11
226	0.09
227	0.1
228	0.13
229	0.15
230	0.16
231	0.18
232	0.24
233	0.27
234	0.26
235	0.28
236	0.33
237	0.39
238	0.39
239	0.38
240	0.36
241	0.38
242	0.42
243	0.47
244	0.42
245	0.35
246	0.35
247	0.35
248	0.35
249	0.28
250	0.25
251	0.2
252	0.19
253	0.18
254	0.17
255	0.17
256	0.16
257	0.18
258	0.16
259	0.14
260	0.16
261	0.23
262	0.28
263	0.34
264	0.36
265	0.35
266	0.38
267	0.41
268	0.45
269	0.46
270	0.43
271	0.38
272	0.4
273	0.45
274	0.47
275	0.5
276	0.5
277	0.49
278	0.5
279	0.55
280	0.54
281	0.53
282	0.51
283	0.45
284	0.39
285	0.36
286	0.34
287	0.27
288	0.24
289	0.2
290	0.18
291	0.17
292	0.16
293	0.16
294	0.16
295	0.18
296	0.23
297	0.23
298	0.25
299	0.28
300	0.33
301	0.33
302	0.31
303	0.35
304	0.31
305	0.38
306	0.42
307	0.41
308	0.38
309	0.37
310	0.37
311	0.32
312	0.31
313	0.24
314	0.22
315	0.24
316	0.23
317	0.24
318	0.24
319	0.22
320	0.25
321	0.28
322	0.27
323	0.28
324	0.28
325	0.27
326	0.31
327	0.34
328	0.34
329	0.35
330	0.37
331	0.36
332	0.43
333	0.45
334	0.49
335	0.54
336	0.55
337	0.56
338	0.53
339	0.53
340	0.53
341	0.55
342	0.53
343	0.53
344	0.55
345	0.51
346	0.51
347	0.49
348	0.41
349	0.41
350	0.37
351	0.31
352	0.27
353	0.27
354	0.28
355	0.27
356	0.29
357	0.25
358	0.28
359	0.25
360	0.22
361	0.2
362	0.18
363	0.21
364	0.19
365	0.23
366	0.2
367	0.2
368	0.22
369	0.22
370	0.23
371	0.21
372	0.23
373	0.22
374	0.22
375	0.24
376	0.24
377	0.25
378	0.3
379	0.32
380	0.35
381	0.34
382	0.32
383	0.29
384	0.28
385	0.28
386	0.25
387	0.22
388	0.22
389	0.23
390	0.29
391	0.3
392	0.37
393	0.39
394	0.36
395	0.37
396	0.34
397	0.33
398	0.28
399	0.27
400	0.21
401	0.19
402	0.18
403	0.15
404	0.13
405	0.11
406	0.14
407	0.13
408	0.13
409	0.11
410	0.1
411	0.11
412	0.12
413	0.15
414	0.12
415	0.13
416	0.15
417	0.16
418	0.17
419	0.2
420	0.21

C5DX14

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer