Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DT50

Protein Details
Accession C5DT50    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-247LLDKVRTVRQRRREEENREKDDQBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046962  Atg3  
IPR007135  Atg3/Atg10  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0019776  F:Atg8 ligase activity  
GO:0006914  P:autophagy  
KEGG zro:ZYRO0C05500g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03987  Autophagy_act_C  
Amino Acid Sequences MIRSTLSSWREYLTPVSHKSTFLTTGNVTPDEFRKAGDYLCHMFPTWKWNEPSKDISYRDFLPQDKQFLVSRKVPSNERAQELVSVSQNEPEVDEDGWLVEGQSVEKSAKQHPKSESAIEVDDIDEMMKDMEIQGNDDIVDMPVNQGERYYDLYITYSTSYRVPKMYIVGFSSAGVPLTPQEMFEDIAPDYRTKTATIEKLPFYKHSVLSVSIHPCKHANVMKTLLDKVRTVRQRRREEENREKDDQDDWEDVQEDLDDALRVDQYLVVFLKFITSVTPSIEHDYTMEGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.35
3 0.4
4 0.4
5 0.4
6 0.4
7 0.39
8 0.36
9 0.3
10 0.3
11 0.26
12 0.28
13 0.3
14 0.29
15 0.26
16 0.24
17 0.25
18 0.27
19 0.25
20 0.22
21 0.21
22 0.21
23 0.22
24 0.23
25 0.26
26 0.24
27 0.26
28 0.26
29 0.24
30 0.24
31 0.24
32 0.29
33 0.29
34 0.31
35 0.33
36 0.4
37 0.45
38 0.49
39 0.55
40 0.52
41 0.55
42 0.5
43 0.5
44 0.45
45 0.42
46 0.42
47 0.39
48 0.35
49 0.35
50 0.36
51 0.37
52 0.33
53 0.34
54 0.33
55 0.35
56 0.38
57 0.37
58 0.39
59 0.41
60 0.44
61 0.45
62 0.45
63 0.49
64 0.49
65 0.46
66 0.42
67 0.36
68 0.34
69 0.32
70 0.31
71 0.23
72 0.21
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.16
77 0.15
78 0.13
79 0.13
80 0.1
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.07
92 0.07
93 0.09
94 0.11
95 0.18
96 0.28
97 0.3
98 0.36
99 0.38
100 0.44
101 0.44
102 0.44
103 0.38
104 0.31
105 0.29
106 0.23
107 0.2
108 0.14
109 0.11
110 0.09
111 0.07
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.05
119 0.05
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.08
145 0.08
146 0.11
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.16
153 0.17
154 0.15
155 0.15
156 0.15
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.1
161 0.09
162 0.07
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.08
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.12
181 0.15
182 0.18
183 0.22
184 0.27
185 0.3
186 0.32
187 0.34
188 0.36
189 0.35
190 0.34
191 0.33
192 0.29
193 0.27
194 0.26
195 0.25
196 0.26
197 0.29
198 0.3
199 0.31
200 0.3
201 0.3
202 0.29
203 0.28
204 0.33
205 0.33
206 0.29
207 0.29
208 0.33
209 0.35
210 0.36
211 0.38
212 0.34
213 0.32
214 0.31
215 0.29
216 0.34
217 0.39
218 0.46
219 0.52
220 0.59
221 0.68
222 0.72
223 0.79
224 0.79
225 0.81
226 0.83
227 0.84
228 0.81
229 0.75
230 0.7
231 0.62
232 0.55
233 0.48
234 0.41
235 0.33
236 0.27
237 0.24
238 0.24
239 0.23
240 0.2
241 0.16
242 0.12
243 0.09
244 0.09
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.08
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.09
262 0.11
263 0.12
264 0.15
265 0.17
266 0.18
267 0.24
268 0.24
269 0.23
270 0.21