Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DR06

Protein Details
Accession C5DR06    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-117EEKLDKIIKKPKARRSRRDEDDLEBasic
286-308ALDSAKSRKKKSGKKITAQGSTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-111IIKKPKARRSRR
281-300MRKKAALDSAKSRKKKSGKK
372-375GKRS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG zro:ZYRO0B04576g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSSEEPAQVVDSLASPEGPAGVDTNGTAETTTAAETAAAAAADRQRKHIEKSGSDDESDGDADPEAEAAKNARIATNQQLDEIDNTHRNRQELEEKLDKIIKKPKARRSRRDEDDLEQFLDEKILRLKDEMNVAAQIDVDTLNKRLETGDNSLIAMQKVKLLPKVESVLSKAHLADTILDNNLLQSVRIWLEPLPDGSLPSFEIQKSLFAALEKLPIKTEHLKESGLGRVIIFYTKSKRVEPPLARLADRLIAEWTRPIIGASDNYRDKRILQLEFDAEKMRKKAALDSAKSRKKKSGKKITAQGSTSQSLYEQAAARRNRAAAPAPTTTDYKYAPTSNLNPTSGPSKIAGVGSSLNNSEMYKRLTSRLQKGKRSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.1
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.07
16 0.08
17 0.08
18 0.09
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.06
26 0.05
27 0.08
28 0.13
29 0.2
30 0.21
31 0.25
32 0.32
33 0.36
34 0.42
35 0.48
36 0.51
37 0.49
38 0.56
39 0.6
40 0.54
41 0.51
42 0.45
43 0.38
44 0.32
45 0.28
46 0.2
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.09
57 0.11
58 0.12
59 0.13
60 0.14
61 0.17
62 0.25
63 0.31
64 0.3
65 0.28
66 0.28
67 0.28
68 0.28
69 0.26
70 0.23
71 0.23
72 0.25
73 0.3
74 0.32
75 0.32
76 0.32
77 0.35
78 0.39
79 0.38
80 0.43
81 0.44
82 0.42
83 0.44
84 0.48
85 0.43
86 0.41
87 0.44
88 0.45
89 0.48
90 0.57
91 0.64
92 0.7
93 0.8
94 0.84
95 0.85
96 0.87
97 0.84
98 0.84
99 0.78
100 0.71
101 0.69
102 0.6
103 0.51
104 0.41
105 0.34
106 0.25
107 0.22
108 0.17
109 0.1
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.15
115 0.15
116 0.19
117 0.18
118 0.15
119 0.15
120 0.15
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.11
134 0.13
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.19
140 0.19
141 0.17
142 0.14
143 0.1
144 0.1
145 0.12
146 0.13
147 0.16
148 0.16
149 0.17
150 0.19
151 0.21
152 0.19
153 0.19
154 0.19
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.14
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.07
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.14
200 0.15
201 0.14
202 0.15
203 0.15
204 0.18
205 0.24
206 0.26
207 0.24
208 0.25
209 0.25
210 0.25
211 0.27
212 0.26
213 0.2
214 0.18
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.15
222 0.2
223 0.23
224 0.25
225 0.29
226 0.34
227 0.43
228 0.44
229 0.46
230 0.48
231 0.48
232 0.46
233 0.42
234 0.37
235 0.31
236 0.27
237 0.21
238 0.16
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.08
247 0.09
248 0.12
249 0.14
250 0.21
251 0.26
252 0.27
253 0.29
254 0.29
255 0.28
256 0.32
257 0.35
258 0.3
259 0.27
260 0.29
261 0.32
262 0.32
263 0.32
264 0.3
265 0.25
266 0.27
267 0.26
268 0.24
269 0.22
270 0.22
271 0.27
272 0.32
273 0.4
274 0.41
275 0.49
276 0.59
277 0.65
278 0.7
279 0.67
280 0.67
281 0.68
282 0.73
283 0.74
284 0.75
285 0.76
286 0.81
287 0.86
288 0.86
289 0.83
290 0.75
291 0.7
292 0.63
293 0.55
294 0.45
295 0.36
296 0.28
297 0.22
298 0.21
299 0.19
300 0.17
301 0.19
302 0.27
303 0.29
304 0.31
305 0.32
306 0.33
307 0.31
308 0.32
309 0.34
310 0.32
311 0.35
312 0.35
313 0.36
314 0.37
315 0.37
316 0.34
317 0.32
318 0.28
319 0.26
320 0.27
321 0.26
322 0.26
323 0.3
324 0.34
325 0.39
326 0.43
327 0.41
328 0.38
329 0.38
330 0.39
331 0.34
332 0.3
333 0.23
334 0.19
335 0.2
336 0.21
337 0.19
338 0.16
339 0.19
340 0.19
341 0.2
342 0.19
343 0.17
344 0.18
345 0.18
346 0.19
347 0.2
348 0.22
349 0.25
350 0.27
351 0.31
352 0.39
353 0.47
354 0.55
355 0.62
356 0.67