Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DTR0

Protein Details
Accession C5DTR0    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-250QVPVARKLKKNPPKAVPKGKQLIHydrophilic
726-750AISWSLKKILRHQRKPYTMRRYDSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-246RKLKKNPPKAVPKG
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 1, E.R. 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040458  Vid27  
IPR013863  VID27_C  
IPR040979  Vid27_N  
IPR040768  Vid27_PH  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
KEGG zro:ZYRO0C10560g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08553  VID27  
PF17748  VID27_N  
PF17747  VID27_PH  
Amino Acid Sequences MNIIRKFMDSGSKQEVVMIPSGEFDLLRSRKSPKAALECIYNDSTLSIRKTAQYSYELVVCKVADDTEVSTGDDNEEYSDDSVSATSAQSKKDDEWTFKLGFLGFYKKWNDQGDLTFIWNNTIGDEEDEMVQFVVSPEVSLKDVAQFTKTVYRCEYEARFKKPGISANEKEINAVAAESEALAREQCDDLAERLQNLKMEEPQPTPASTAEDEEEVEEENFEDAREVQVPVARKLKKNPPKAVPKGKQLILLKASLLVFDPMEEKFMSQEQDVDVLVIETGDYEYWLAVQGEPTKLGTDLSPSINPTFDFVESGFIFNYTFNQITLSFMLKFTDVGACTQFQSCISKCLWMSLNKRPWGEVPGDQKQFILNFSAAVEKDLNKILDEDEREARIKEEEEERHEREQEEEEEESDSEDEDHSRRIISSESFENDSFQRPLSSGNKSLTVAYKNDRSYVVRDNKIGVFKTDRDGMDFVAALKNISDLEGKRINPDDPMLYMEDRNLILRDEKDKNKLFKMDLERGKVVEEWGTGEKDVVQYGPAKKFDQLTAEQTVLGVSPRGLFKIDPRINTKNKVVQDESKDYATNTKFSSLGTTEDGYIAVGSEKGDVRLYDRLGIRAKTAIPSLGQPIRHVTVSANGKWLLCTCDSSLLLMDLTVKTGKNAGTLGFTKSFPASENIKTYVLKISPEHASYISTSTKKPINFSKAYFNTGINQEEQTIVTSSGPFAISWSLKKILRHQRKPYTMRRYDSNIIEDNFQFGTDRNVIVALKDNVSMSKTKSFKVPDKQVLLPDVSLFYNDDDDDYN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.39
3 0.32
4 0.32
5 0.26
6 0.19
7 0.18
8 0.19
9 0.16
10 0.13
11 0.12
12 0.19
13 0.2
14 0.22
15 0.25
16 0.3
17 0.35
18 0.41
19 0.47
20 0.46
21 0.53
22 0.57
23 0.56
24 0.58
25 0.55
26 0.54
27 0.49
28 0.4
29 0.3
30 0.26
31 0.24
32 0.22
33 0.23
34 0.2
35 0.21
36 0.25
37 0.27
38 0.29
39 0.31
40 0.3
41 0.3
42 0.3
43 0.33
44 0.3
45 0.28
46 0.28
47 0.23
48 0.2
49 0.18
50 0.16
51 0.11
52 0.11
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.14
61 0.12
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.15
74 0.17
75 0.19
76 0.22
77 0.24
78 0.26
79 0.35
80 0.4
81 0.39
82 0.41
83 0.45
84 0.43
85 0.41
86 0.41
87 0.32
88 0.29
89 0.25
90 0.27
91 0.23
92 0.28
93 0.32
94 0.33
95 0.39
96 0.4
97 0.41
98 0.36
99 0.38
100 0.38
101 0.34
102 0.35
103 0.3
104 0.27
105 0.25
106 0.23
107 0.2
108 0.15
109 0.15
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.09
118 0.09
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.13
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.16
134 0.18
135 0.26
136 0.27
137 0.26
138 0.26
139 0.27
140 0.27
141 0.33
142 0.37
143 0.39
144 0.46
145 0.5
146 0.52
147 0.5
148 0.55
149 0.53
150 0.54
151 0.51
152 0.52
153 0.48
154 0.51
155 0.58
156 0.52
157 0.48
158 0.4
159 0.33
160 0.23
161 0.21
162 0.12
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.16
178 0.17
179 0.16
180 0.18
181 0.2
182 0.2
183 0.2
184 0.21
185 0.21
186 0.22
187 0.25
188 0.25
189 0.28
190 0.27
191 0.26
192 0.26
193 0.21
194 0.23
195 0.19
196 0.19
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.12
216 0.14
217 0.18
218 0.26
219 0.29
220 0.31
221 0.39
222 0.49
223 0.56
224 0.64
225 0.68
226 0.69
227 0.76
228 0.82
229 0.85
230 0.81
231 0.81
232 0.77
233 0.7
234 0.68
235 0.59
236 0.55
237 0.46
238 0.4
239 0.31
240 0.27
241 0.25
242 0.18
243 0.16
244 0.11
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.07
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.08
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.04
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.07
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.09
285 0.09
286 0.11
287 0.12
288 0.13
289 0.14
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.13
294 0.13
295 0.11
296 0.11
297 0.09
298 0.13
299 0.12
300 0.13
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.1
310 0.09
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.1
315 0.1
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.09
329 0.13
330 0.12
331 0.14
332 0.14
333 0.16
334 0.16
335 0.19
336 0.22
337 0.25
338 0.3
339 0.36
340 0.43
341 0.44
342 0.45
343 0.42
344 0.4
345 0.35
346 0.33
347 0.29
348 0.29
349 0.32
350 0.34
351 0.33
352 0.31
353 0.3
354 0.27
355 0.22
356 0.17
357 0.09
358 0.08
359 0.08
360 0.1
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.1
366 0.12
367 0.12
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.12
372 0.13
373 0.14
374 0.14
375 0.15
376 0.16
377 0.16
378 0.15
379 0.13
380 0.13
381 0.12
382 0.16
383 0.17
384 0.23
385 0.28
386 0.31
387 0.31
388 0.32
389 0.3
390 0.26
391 0.26
392 0.22
393 0.19
394 0.16
395 0.15
396 0.14
397 0.14
398 0.12
399 0.1
400 0.08
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.09
411 0.09
412 0.11
413 0.12
414 0.14
415 0.16
416 0.16
417 0.17
418 0.16
419 0.18
420 0.16
421 0.14
422 0.12
423 0.1
424 0.15
425 0.17
426 0.2
427 0.21
428 0.22
429 0.23
430 0.23
431 0.24
432 0.22
433 0.21
434 0.19
435 0.19
436 0.24
437 0.22
438 0.23
439 0.24
440 0.23
441 0.24
442 0.31
443 0.36
444 0.33
445 0.33
446 0.34
447 0.35
448 0.36
449 0.33
450 0.26
451 0.22
452 0.2
453 0.22
454 0.24
455 0.22
456 0.21
457 0.21
458 0.19
459 0.16
460 0.15
461 0.13
462 0.1
463 0.1
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.06
468 0.07
469 0.09
470 0.07
471 0.13
472 0.17
473 0.18
474 0.2
475 0.22
476 0.21
477 0.2
478 0.21
479 0.17
480 0.13
481 0.14
482 0.14
483 0.13
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.11
488 0.12
489 0.1
490 0.09
491 0.11
492 0.12
493 0.19
494 0.24
495 0.27
496 0.35
497 0.4
498 0.43
499 0.45
500 0.47
501 0.42
502 0.43
503 0.47
504 0.48
505 0.47
506 0.47
507 0.44
508 0.41
509 0.41
510 0.34
511 0.26
512 0.18
513 0.14
514 0.12
515 0.13
516 0.13
517 0.12
518 0.12
519 0.12
520 0.11
521 0.11
522 0.08
523 0.08
524 0.12
525 0.17
526 0.21
527 0.23
528 0.23
529 0.25
530 0.27
531 0.27
532 0.27
533 0.25
534 0.25
535 0.25
536 0.24
537 0.22
538 0.2
539 0.19
540 0.14
541 0.11
542 0.07
543 0.05
544 0.07
545 0.07
546 0.08
547 0.09
548 0.09
549 0.13
550 0.24
551 0.28
552 0.3
553 0.37
554 0.45
555 0.49
556 0.54
557 0.55
558 0.51
559 0.51
560 0.52
561 0.5
562 0.48
563 0.5
564 0.51
565 0.47
566 0.42
567 0.39
568 0.33
569 0.36
570 0.31
571 0.27
572 0.22
573 0.21
574 0.2
575 0.2
576 0.23
577 0.17
578 0.18
579 0.17
580 0.17
581 0.16
582 0.16
583 0.16
584 0.12
585 0.1
586 0.08
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.07
591 0.08
592 0.09
593 0.1
594 0.1
595 0.13
596 0.17
597 0.17
598 0.21
599 0.21
600 0.25
601 0.28
602 0.29
603 0.27
604 0.26
605 0.26
606 0.23
607 0.23
608 0.19
609 0.16
610 0.17
611 0.22
612 0.23
613 0.22
614 0.21
615 0.25
616 0.26
617 0.25
618 0.24
619 0.18
620 0.22
621 0.28
622 0.27
623 0.27
624 0.26
625 0.25
626 0.26
627 0.26
628 0.22
629 0.17
630 0.18
631 0.16
632 0.2
633 0.2
634 0.2
635 0.19
636 0.16
637 0.15
638 0.13
639 0.14
640 0.08
641 0.1
642 0.11
643 0.11
644 0.1
645 0.13
646 0.14
647 0.14
648 0.14
649 0.13
650 0.16
651 0.18
652 0.22
653 0.22
654 0.21
655 0.21
656 0.21
657 0.21
658 0.18
659 0.21
660 0.21
661 0.23
662 0.27
663 0.28
664 0.3
665 0.3
666 0.3
667 0.32
668 0.29
669 0.27
670 0.24
671 0.25
672 0.27
673 0.28
674 0.28
675 0.22
676 0.22
677 0.21
678 0.23
679 0.26
680 0.24
681 0.24
682 0.27
683 0.31
684 0.32
685 0.36
686 0.42
687 0.44
688 0.47
689 0.49
690 0.55
691 0.53
692 0.57
693 0.53
694 0.45
695 0.41
696 0.39
697 0.39
698 0.3
699 0.27
700 0.23
701 0.22
702 0.21
703 0.18
704 0.15
705 0.14
706 0.13
707 0.13
708 0.12
709 0.13
710 0.13
711 0.11
712 0.1
713 0.14
714 0.16
715 0.18
716 0.22
717 0.26
718 0.29
719 0.33
720 0.42
721 0.48
722 0.57
723 0.65
724 0.72
725 0.77
726 0.84
727 0.9
728 0.9
729 0.9
730 0.87
731 0.82
732 0.78
733 0.75
734 0.72
735 0.68
736 0.63
737 0.58
738 0.51
739 0.5
740 0.43
741 0.38
742 0.31
743 0.26
744 0.2
745 0.15
746 0.19
747 0.18
748 0.18
749 0.15
750 0.17
751 0.17
752 0.18
753 0.25
754 0.21
755 0.2
756 0.21
757 0.21
758 0.21
759 0.23
760 0.25
761 0.22
762 0.28
763 0.3
764 0.3
765 0.37
766 0.44
767 0.51
768 0.59
769 0.65
770 0.65
771 0.69
772 0.71
773 0.68
774 0.64
775 0.57
776 0.47
777 0.38
778 0.31
779 0.25
780 0.22
781 0.18
782 0.15
783 0.15
784 0.15