Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DQX1

Protein Details
Accession C5DQX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-182VSSKRVEKQKHYKKRVLREERQYEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-171KQKHYKK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.833, cyto_mito 7.333, cyto 7, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
Gene Ontology GO:0031326  P:regulation of cellular biosynthetic process  
KEGG zro:ZYRO0B03674g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MKESQGSKQRLNAYIYDFLVKSALHGSAGTFFEEAGLREDSDNGNSNSSVKRGVVVVDSPQGYLYEWWKIFWDLCTVRSKRGGGGTTGLPAMQAYYKLWSEKNAQENALMTQEINAASLQQTSEDAGEYRNEEVDASRLSLVVSSVPLQPSLRKVPPVSSKRVEKQKHYKKRVLREERQYEQNLFMRRSNVSTDRTAHVNTVPHHAGTRASLPSQELPAFDLQSFEYDPDFLLFTSPETAPLPVDFPPTHGEDTSFLDNSSERSFNFLNGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.4
4 0.33
5 0.28
6 0.26
7 0.22
8 0.18
9 0.15
10 0.14
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.13
18 0.12
19 0.13
20 0.14
21 0.14
22 0.12
23 0.13
24 0.12
25 0.13
26 0.15
27 0.15
28 0.17
29 0.21
30 0.18
31 0.19
32 0.18
33 0.21
34 0.2
35 0.2
36 0.19
37 0.15
38 0.15
39 0.13
40 0.14
41 0.14
42 0.14
43 0.15
44 0.17
45 0.18
46 0.17
47 0.16
48 0.16
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.17
53 0.16
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.19
58 0.18
59 0.24
60 0.18
61 0.22
62 0.3
63 0.3
64 0.32
65 0.36
66 0.36
67 0.31
68 0.35
69 0.32
70 0.25
71 0.26
72 0.24
73 0.2
74 0.19
75 0.17
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.09
83 0.1
84 0.12
85 0.12
86 0.15
87 0.19
88 0.24
89 0.3
90 0.29
91 0.29
92 0.28
93 0.28
94 0.26
95 0.22
96 0.16
97 0.1
98 0.08
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.13
138 0.18
139 0.18
140 0.2
141 0.2
142 0.26
143 0.35
144 0.39
145 0.42
146 0.42
147 0.47
148 0.52
149 0.61
150 0.59
151 0.59
152 0.66
153 0.7
154 0.75
155 0.77
156 0.78
157 0.76
158 0.82
159 0.84
160 0.83
161 0.81
162 0.8
163 0.8
164 0.78
165 0.76
166 0.69
167 0.59
168 0.54
169 0.5
170 0.44
171 0.38
172 0.35
173 0.3
174 0.28
175 0.29
176 0.29
177 0.29
178 0.28
179 0.29
180 0.3
181 0.29
182 0.31
183 0.3
184 0.26
185 0.24
186 0.26
187 0.23
188 0.27
189 0.26
190 0.24
191 0.23
192 0.23
193 0.21
194 0.18
195 0.21
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.18
200 0.2
201 0.22
202 0.21
203 0.17
204 0.17
205 0.19
206 0.19
207 0.16
208 0.16
209 0.12
210 0.14
211 0.14
212 0.13
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.08
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.15
229 0.16
230 0.13
231 0.19
232 0.17
233 0.18
234 0.21
235 0.23
236 0.25
237 0.23
238 0.24
239 0.21
240 0.26
241 0.28
242 0.25
243 0.22
244 0.21
245 0.21
246 0.23
247 0.25
248 0.22
249 0.17
250 0.23
251 0.23