Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DRL4

Protein Details
Accession C5DRL4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-233ALPPRNVGPPDKKRKRRANVSTVAIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
208-224ALPPRNVGPPDKKRKRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028651  ING_fam  
IPR024610  ING_N_histone-binding  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
KEGG zro:ZYRO0B09416g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12998  ING  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15505  PHD_ING  
Amino Acid Sequences MSVPANLYAGLNDIVDVLEEFPVESSRYLTLLHEIDAKCVHSTPQLNKEIDRFISKSNVSNASQNLANINQLFQELMPSLEEKMHVSSIMLESLQHLTSRLELDYEIAIKNQEIPSKLRVGVDNHPAMHLHYELMSKIDAKNHHAQGANNGGNGNGSRSSQALKSESRREAMVANKKPLPIQDTPLMATTPDEDFKDDPNTKKRANIALPPRNVGPPDKKRKRRANVSTVAIPSTSPPVSSVDPGNPKINEFGEPLYCYCNQVAYGEMVGCDGASCELEWFHLPCIHLDHLPKGKWYCDDCKRKKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.07
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.08
10 0.09
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.17
18 0.16
19 0.17
20 0.23
21 0.22
22 0.24
23 0.25
24 0.25
25 0.21
26 0.21
27 0.21
28 0.2
29 0.27
30 0.32
31 0.39
32 0.45
33 0.46
34 0.47
35 0.49
36 0.47
37 0.43
38 0.41
39 0.33
40 0.28
41 0.34
42 0.33
43 0.34
44 0.34
45 0.37
46 0.33
47 0.36
48 0.34
49 0.31
50 0.3
51 0.26
52 0.23
53 0.18
54 0.2
55 0.15
56 0.15
57 0.12
58 0.11
59 0.11
60 0.09
61 0.1
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.08
80 0.1
81 0.11
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.12
87 0.1
88 0.09
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.11
98 0.12
99 0.14
100 0.15
101 0.17
102 0.19
103 0.22
104 0.23
105 0.21
106 0.22
107 0.24
108 0.27
109 0.31
110 0.3
111 0.27
112 0.26
113 0.25
114 0.23
115 0.2
116 0.15
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.12
126 0.13
127 0.17
128 0.24
129 0.24
130 0.28
131 0.28
132 0.28
133 0.28
134 0.34
135 0.29
136 0.23
137 0.21
138 0.18
139 0.16
140 0.16
141 0.13
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.09
147 0.1
148 0.12
149 0.13
150 0.17
151 0.21
152 0.27
153 0.29
154 0.28
155 0.27
156 0.26
157 0.26
158 0.3
159 0.35
160 0.32
161 0.35
162 0.36
163 0.36
164 0.36
165 0.34
166 0.32
167 0.24
168 0.24
169 0.23
170 0.23
171 0.23
172 0.23
173 0.22
174 0.16
175 0.15
176 0.12
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.14
183 0.21
184 0.24
185 0.27
186 0.34
187 0.39
188 0.38
189 0.41
190 0.43
191 0.44
192 0.44
193 0.47
194 0.5
195 0.53
196 0.54
197 0.52
198 0.49
199 0.43
200 0.41
201 0.38
202 0.38
203 0.4
204 0.5
205 0.58
206 0.67
207 0.75
208 0.84
209 0.89
210 0.9
211 0.89
212 0.88
213 0.85
214 0.81
215 0.76
216 0.67
217 0.57
218 0.46
219 0.36
220 0.27
221 0.24
222 0.18
223 0.12
224 0.12
225 0.15
226 0.16
227 0.18
228 0.19
229 0.21
230 0.27
231 0.3
232 0.35
233 0.32
234 0.31
235 0.32
236 0.31
237 0.27
238 0.23
239 0.23
240 0.2
241 0.22
242 0.21
243 0.22
244 0.21
245 0.21
246 0.19
247 0.18
248 0.16
249 0.15
250 0.15
251 0.13
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.09
266 0.11
267 0.12
268 0.14
269 0.17
270 0.17
271 0.18
272 0.23
273 0.24
274 0.26
275 0.28
276 0.33
277 0.38
278 0.39
279 0.44
280 0.42
281 0.43
282 0.46
283 0.49
284 0.51
285 0.54
286 0.64