Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DPA9

Protein Details
Accession C5DPA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-376VVEEPKETKHSKKKHSKSKKSNKQRFKPYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-375TKHSKKKHSKSKKSNKQRFKP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.333, cyto 7, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR039328  WDR89  
KEGG zro:ZYRO0A01804g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSYSLVNSESFGNNNWCLNLQPAYQHSLLASLSNGQVHQLDWQTGKSIAHIKTGEVAVNKLKLINNDHENESTYATATMGAVKIWDIRSNNCLATISNDKNAPFLSLDSRHNMLACGTELSGSDAELHIYDVRKWDSPLRSLVDSHHDDITDIAFHPSDPNVLMSGSTDGYTNIYDLRQAEEEDALHQVINFASIHSCGWLAPRRIFTLSHMETFSIHELNDKSDEAKEPRPVEFNDVRESWGCDYVVDIHPGYVACGNSQEGIGKLRILPFQGEQVDTNNAIDINAAHGDEVVRDVFVPARNSKLLYSCGEDGSVKTWENKSGPLNVTDEFWDYSQLLNVLDEQPVVVEEPKETKHSKKKHSKSKKSNKQRFKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.22
4 0.22
5 0.24
6 0.24
7 0.2
8 0.23
9 0.24
10 0.28
11 0.28
12 0.27
13 0.23
14 0.22
15 0.21
16 0.17
17 0.15
18 0.12
19 0.13
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.17
26 0.17
27 0.18
28 0.18
29 0.19
30 0.2
31 0.22
32 0.21
33 0.2
34 0.26
35 0.24
36 0.29
37 0.29
38 0.27
39 0.29
40 0.3
41 0.3
42 0.23
43 0.25
44 0.22
45 0.23
46 0.23
47 0.22
48 0.23
49 0.24
50 0.29
51 0.33
52 0.36
53 0.37
54 0.4
55 0.38
56 0.39
57 0.35
58 0.31
59 0.24
60 0.19
61 0.15
62 0.12
63 0.12
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.11
71 0.11
72 0.16
73 0.16
74 0.18
75 0.22
76 0.24
77 0.24
78 0.21
79 0.21
80 0.17
81 0.2
82 0.25
83 0.25
84 0.25
85 0.27
86 0.26
87 0.27
88 0.27
89 0.23
90 0.16
91 0.15
92 0.17
93 0.19
94 0.21
95 0.23
96 0.24
97 0.23
98 0.23
99 0.22
100 0.17
101 0.14
102 0.13
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.1
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.12
119 0.14
120 0.15
121 0.17
122 0.23
123 0.24
124 0.25
125 0.29
126 0.28
127 0.28
128 0.27
129 0.27
130 0.28
131 0.28
132 0.27
133 0.23
134 0.2
135 0.19
136 0.19
137 0.17
138 0.11
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.09
187 0.14
188 0.16
189 0.18
190 0.2
191 0.22
192 0.23
193 0.23
194 0.22
195 0.26
196 0.25
197 0.25
198 0.23
199 0.22
200 0.21
201 0.22
202 0.21
203 0.12
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.13
212 0.17
213 0.18
214 0.21
215 0.26
216 0.26
217 0.27
218 0.3
219 0.29
220 0.33
221 0.33
222 0.32
223 0.3
224 0.29
225 0.29
226 0.26
227 0.28
228 0.22
229 0.19
230 0.17
231 0.12
232 0.13
233 0.15
234 0.16
235 0.16
236 0.14
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.11
242 0.1
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.08
250 0.1
251 0.11
252 0.1
253 0.11
254 0.13
255 0.14
256 0.14
257 0.16
258 0.14
259 0.19
260 0.19
261 0.19
262 0.18
263 0.19
264 0.2
265 0.19
266 0.18
267 0.14
268 0.12
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.09
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.1
285 0.13
286 0.17
287 0.18
288 0.22
289 0.23
290 0.24
291 0.25
292 0.26
293 0.26
294 0.24
295 0.27
296 0.25
297 0.24
298 0.24
299 0.23
300 0.21
301 0.2
302 0.21
303 0.17
304 0.2
305 0.21
306 0.25
307 0.26
308 0.3
309 0.3
310 0.35
311 0.36
312 0.34
313 0.35
314 0.3
315 0.3
316 0.27
317 0.26
318 0.2
319 0.18
320 0.18
321 0.15
322 0.15
323 0.16
324 0.15
325 0.13
326 0.12
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.12
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.16
339 0.18
340 0.24
341 0.28
342 0.36
343 0.45
344 0.54
345 0.63
346 0.7
347 0.79
348 0.84
349 0.92
350 0.93
351 0.95
352 0.96
353 0.96
354 0.97
355 0.97
356 0.97