Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DTI2

Protein Details
Accession C5DTI2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-72KSSKELKRLDAKKRLEIKKTQKRAYPRQKAITLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-64ELKRLDAKKRLEIKKTQKRAY
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 13.5, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG zro:ZYRO0C08778g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
Amino Acid Sequences MLGIRYQILSRNFQLYSRVQGSSLKEKLNNLQQRQTVLNKSSKELKRLDAKKRLEIKKTQKRAYPRQKAITLLQKQNKNLDQELKAAAIGPTSDSDLKYLLKTRDKRLIYTILGITGEQLRDSVLIDKDVKKFLKRGLIEKAVILTRLAKNRGSAGMNSIMKYFFHESQAPQSAVDMYNWRKKWGIPPNEFTNTILFDGLARQKNPIKKANASLVLKAVDRLIENNKLTQIEFNAALGALSNCNDITHAFELFERKNKGVEKDSISYLWILRACKRVESDSLFQEVIISIMEDIPARLIDAPLLFEFCKTLHSRDDNVALQKMAVLALKEYFEIDYDTDLWPKLLGSFQLLPLSHWSIDRRFPLNAPVVGLFLDNCLKSKQYSLGLQFFEYLKANKTEILDLGMYHKYMELQLKGNPLDCGDKCLEVFNEVESNPNFISFKHSLILLYKAFERQALKKANNIDKVKINEFLSKCLDVIKKNEGIYSKEFNTRLYPKKTWQFIFAIVKAANTNEALSSRMFTTIIDEYLRSFIHGEFSPSSISPTNRESRETLRFVELECIRLLNQLASRMSIPGIEEVDTSKPSLERNIFLQRRQLRQFKKMLLEHVDALQSEHPNVEDLNELDVKLKEKASKILDDHKTNEYMNYVLVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.34
3 0.38
4 0.37
5 0.35
6 0.31
7 0.35
8 0.4
9 0.44
10 0.46
11 0.43
12 0.42
13 0.46
14 0.53
15 0.58
16 0.61
17 0.57
18 0.6
19 0.58
20 0.58
21 0.6
22 0.59
23 0.56
24 0.53
25 0.54
26 0.49
27 0.5
28 0.56
29 0.56
30 0.56
31 0.53
32 0.54
33 0.57
34 0.64
35 0.7
36 0.7
37 0.71
38 0.73
39 0.8
40 0.81
41 0.78
42 0.8
43 0.8
44 0.81
45 0.86
46 0.83
47 0.8
48 0.82
49 0.85
50 0.86
51 0.86
52 0.84
53 0.83
54 0.79
55 0.77
56 0.74
57 0.73
58 0.71
59 0.7
60 0.68
61 0.66
62 0.66
63 0.7
64 0.67
65 0.62
66 0.58
67 0.56
68 0.5
69 0.47
70 0.45
71 0.37
72 0.32
73 0.27
74 0.22
75 0.15
76 0.13
77 0.1
78 0.09
79 0.12
80 0.14
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.17
85 0.18
86 0.24
87 0.28
88 0.35
89 0.41
90 0.47
91 0.55
92 0.56
93 0.56
94 0.55
95 0.54
96 0.46
97 0.45
98 0.39
99 0.31
100 0.29
101 0.26
102 0.22
103 0.18
104 0.16
105 0.11
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.11
110 0.14
111 0.12
112 0.15
113 0.19
114 0.24
115 0.27
116 0.34
117 0.36
118 0.34
119 0.37
120 0.39
121 0.44
122 0.42
123 0.45
124 0.47
125 0.5
126 0.47
127 0.44
128 0.42
129 0.34
130 0.31
131 0.26
132 0.23
133 0.22
134 0.27
135 0.3
136 0.28
137 0.28
138 0.3
139 0.34
140 0.3
141 0.26
142 0.23
143 0.29
144 0.29
145 0.28
146 0.26
147 0.23
148 0.2
149 0.24
150 0.24
151 0.18
152 0.2
153 0.23
154 0.23
155 0.3
156 0.35
157 0.31
158 0.27
159 0.26
160 0.24
161 0.22
162 0.22
163 0.21
164 0.21
165 0.29
166 0.3
167 0.31
168 0.3
169 0.32
170 0.4
171 0.44
172 0.49
173 0.47
174 0.53
175 0.58
176 0.61
177 0.6
178 0.51
179 0.43
180 0.34
181 0.28
182 0.21
183 0.14
184 0.1
185 0.13
186 0.19
187 0.21
188 0.19
189 0.23
190 0.28
191 0.34
192 0.4
193 0.44
194 0.43
195 0.43
196 0.47
197 0.51
198 0.53
199 0.49
200 0.44
201 0.39
202 0.35
203 0.31
204 0.27
205 0.2
206 0.13
207 0.11
208 0.13
209 0.15
210 0.19
211 0.2
212 0.21
213 0.22
214 0.22
215 0.22
216 0.2
217 0.17
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.11
238 0.15
239 0.16
240 0.22
241 0.21
242 0.21
243 0.24
244 0.27
245 0.3
246 0.31
247 0.34
248 0.33
249 0.33
250 0.34
251 0.3
252 0.28
253 0.24
254 0.2
255 0.17
256 0.15
257 0.14
258 0.16
259 0.21
260 0.21
261 0.23
262 0.24
263 0.24
264 0.25
265 0.29
266 0.29
267 0.25
268 0.27
269 0.24
270 0.22
271 0.2
272 0.16
273 0.11
274 0.08
275 0.06
276 0.03
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.06
295 0.1
296 0.1
297 0.12
298 0.16
299 0.19
300 0.21
301 0.22
302 0.26
303 0.24
304 0.25
305 0.23
306 0.19
307 0.16
308 0.14
309 0.12
310 0.09
311 0.07
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.12
337 0.13
338 0.12
339 0.14
340 0.16
341 0.14
342 0.14
343 0.15
344 0.15
345 0.19
346 0.22
347 0.22
348 0.21
349 0.21
350 0.24
351 0.26
352 0.24
353 0.21
354 0.18
355 0.16
356 0.15
357 0.15
358 0.1
359 0.07
360 0.08
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.1
366 0.11
367 0.14
368 0.15
369 0.19
370 0.22
371 0.27
372 0.27
373 0.26
374 0.26
375 0.23
376 0.22
377 0.19
378 0.16
379 0.13
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.15
384 0.15
385 0.13
386 0.14
387 0.12
388 0.11
389 0.14
390 0.12
391 0.11
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.11
396 0.14
397 0.13
398 0.14
399 0.17
400 0.21
401 0.21
402 0.22
403 0.2
404 0.18
405 0.21
406 0.19
407 0.21
408 0.18
409 0.18
410 0.18
411 0.19
412 0.18
413 0.14
414 0.14
415 0.11
416 0.12
417 0.11
418 0.15
419 0.13
420 0.16
421 0.14
422 0.15
423 0.14
424 0.12
425 0.2
426 0.17
427 0.18
428 0.16
429 0.17
430 0.16
431 0.18
432 0.22
433 0.15
434 0.15
435 0.15
436 0.16
437 0.16
438 0.18
439 0.2
440 0.2
441 0.27
442 0.34
443 0.34
444 0.37
445 0.45
446 0.5
447 0.56
448 0.55
449 0.5
450 0.49
451 0.52
452 0.5
453 0.46
454 0.4
455 0.39
456 0.37
457 0.37
458 0.34
459 0.3
460 0.28
461 0.29
462 0.3
463 0.26
464 0.29
465 0.31
466 0.32
467 0.32
468 0.35
469 0.31
470 0.32
471 0.34
472 0.35
473 0.32
474 0.34
475 0.34
476 0.33
477 0.38
478 0.42
479 0.46
480 0.48
481 0.49
482 0.51
483 0.59
484 0.65
485 0.59
486 0.56
487 0.5
488 0.49
489 0.52
490 0.44
491 0.4
492 0.33
493 0.32
494 0.28
495 0.26
496 0.2
497 0.14
498 0.13
499 0.1
500 0.1
501 0.11
502 0.1
503 0.12
504 0.11
505 0.11
506 0.11
507 0.1
508 0.13
509 0.13
510 0.15
511 0.14
512 0.14
513 0.14
514 0.16
515 0.16
516 0.13
517 0.13
518 0.11
519 0.15
520 0.15
521 0.18
522 0.17
523 0.18
524 0.2
525 0.18
526 0.22
527 0.21
528 0.22
529 0.22
530 0.27
531 0.34
532 0.33
533 0.37
534 0.37
535 0.4
536 0.47
537 0.46
538 0.43
539 0.39
540 0.38
541 0.36
542 0.41
543 0.35
544 0.29
545 0.26
546 0.24
547 0.2
548 0.21
549 0.21
550 0.16
551 0.17
552 0.2
553 0.21
554 0.21
555 0.22
556 0.2
557 0.2
558 0.17
559 0.16
560 0.13
561 0.14
562 0.13
563 0.12
564 0.14
565 0.16
566 0.16
567 0.16
568 0.15
569 0.15
570 0.16
571 0.24
572 0.25
573 0.24
574 0.3
575 0.4
576 0.43
577 0.45
578 0.53
579 0.53
580 0.58
581 0.65
582 0.69
583 0.65
584 0.7
585 0.76
586 0.73
587 0.75
588 0.7
589 0.69
590 0.66
591 0.61
592 0.54
593 0.48
594 0.43
595 0.34
596 0.31
597 0.28
598 0.23
599 0.2
600 0.19
601 0.17
602 0.16
603 0.16
604 0.15
605 0.14
606 0.13
607 0.17
608 0.17
609 0.17
610 0.19
611 0.21
612 0.22
613 0.22
614 0.25
615 0.26
616 0.28
617 0.36
618 0.38
619 0.44
620 0.46
621 0.53
622 0.58
623 0.59
624 0.6
625 0.57
626 0.55
627 0.49
628 0.45
629 0.37
630 0.29