Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DPG4

Protein Details
Accession C5DPG4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
305-339DSSKGPGVKQPGKKTKKVKRVKKVMRPVQKPAERPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-336LPKPPPSSGAKDSSKGPGVKQPGKKTKKVKRVKKVMRPVQKPA
Subcellular Location(s) plas 24, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001425  Arc/bac/fun_rhodopsins  
IPR043476  Yro2-like_7TM  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG zro:ZYRO0A03168g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01036  Bac_rhodopsin  
CDD cd15239  7tm_YRO2_fungal-like  
Amino Acid Sequences MNQFIDIHKRGGNQAVTINKPYNVDIHITKNGSSWFWAAFCIFTALAMLVIILMFRKPANERLFYYTGFAPVMFMALNYFTLASNLGWIPVKVKYKHATTASEHGHLGTRQVFYSRYIGWFMAFPWPIIQASLLGNTPLWQIAFNIGLTEIYVVVMLFGAVVHTTYKWGYFVIAIAAGIITCISVMTTTRNLVRNISPIVLKCFRIYFYIVMLFWFLYPISFALSEGGNVMQPDSEGAFYGILDVLFLGFLPVLFIPVASYIGFDKLGLNKTVNHYGQDSSPAENAVSRPPAPLPKPPPSSGAKDSSKGPGVKQPGKKTKKVKRVKKVMRPVQKPAERPPSEEHVGEKMSEPAEGTSEPTEKVSEPAEKGTPDKSEEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.38
3 0.4
4 0.43
5 0.42
6 0.37
7 0.37
8 0.36
9 0.33
10 0.28
11 0.28
12 0.26
13 0.29
14 0.34
15 0.34
16 0.33
17 0.33
18 0.33
19 0.29
20 0.28
21 0.23
22 0.18
23 0.17
24 0.18
25 0.15
26 0.14
27 0.13
28 0.14
29 0.12
30 0.1
31 0.1
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.04
40 0.04
41 0.05
42 0.05
43 0.09
44 0.12
45 0.21
46 0.26
47 0.31
48 0.34
49 0.41
50 0.43
51 0.41
52 0.41
53 0.33
54 0.29
55 0.25
56 0.21
57 0.14
58 0.11
59 0.12
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.06
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.07
71 0.09
72 0.08
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.12
77 0.16
78 0.24
79 0.23
80 0.3
81 0.34
82 0.37
83 0.43
84 0.45
85 0.44
86 0.41
87 0.48
88 0.44
89 0.41
90 0.38
91 0.31
92 0.3
93 0.25
94 0.24
95 0.19
96 0.17
97 0.15
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.2
102 0.18
103 0.16
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.17
110 0.16
111 0.15
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.04
138 0.03
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.02
171 0.02
172 0.03
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.11
177 0.14
178 0.15
179 0.17
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.17
185 0.14
186 0.2
187 0.2
188 0.19
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.18
194 0.13
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.02
237 0.02
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.09
253 0.12
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.18
258 0.22
259 0.3
260 0.29
261 0.26
262 0.26
263 0.25
264 0.25
265 0.29
266 0.26
267 0.2
268 0.2
269 0.19
270 0.17
271 0.17
272 0.18
273 0.16
274 0.18
275 0.16
276 0.17
277 0.2
278 0.27
279 0.28
280 0.36
281 0.4
282 0.46
283 0.51
284 0.51
285 0.54
286 0.51
287 0.55
288 0.51
289 0.52
290 0.46
291 0.43
292 0.44
293 0.44
294 0.45
295 0.4
296 0.37
297 0.36
298 0.41
299 0.48
300 0.54
301 0.59
302 0.64
303 0.7
304 0.77
305 0.8
306 0.81
307 0.84
308 0.86
309 0.86
310 0.86
311 0.9
312 0.92
313 0.92
314 0.93
315 0.93
316 0.93
317 0.89
318 0.87
319 0.86
320 0.83
321 0.78
322 0.76
323 0.77
324 0.68
325 0.66
326 0.62
327 0.59
328 0.55
329 0.51
330 0.44
331 0.38
332 0.38
333 0.34
334 0.29
335 0.25
336 0.22
337 0.21
338 0.19
339 0.14
340 0.16
341 0.15
342 0.17
343 0.17
344 0.18
345 0.18
346 0.19
347 0.2
348 0.18
349 0.2
350 0.22
351 0.24
352 0.25
353 0.29
354 0.31
355 0.31
356 0.33
357 0.35
358 0.35