Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DTG1

Protein Details
Accession C5DTG1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-119VTAAVQSVRRNRKRSKKRSGGSGSCTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-111RRNRKRSKKRS
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007147  TF_Vhr  
KEGG zro:ZYRO0C08250g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MNNSSHRSMRSTPYRVGKPVGNGTTHKIREQLNFSDEKKWKEFSGRRLELIDKFGLSERKASEQDDNIRQIATILRTEYGYPLSSANEFEKLVTAAVQSVRRNRKRSKKRSGGSGSCTSDEDITRMSSPCQFTVAPPAPPPPSTSAPPSFGGQQLPAPLPVQPAVAPAVKSPIAPPRIPVIQSQQMYDDIVKSIIADLVNNTVPFNQQSQDDGDGPNLTDFALSSNDRNLLSLGLKNRNHANPSPSLPFFLREKTLLQVQRSRSCFDMAFAQGSVDMYSNLEFLGEMTTRSAIVFVVERFFSNLMPSSMEYITSKSSSQESLSNLSIKLFGPASKRNLTQLPAKQVQLKVLFLTMGGLVKDFGFDPCLYPLSEIIHHLVMLQYPLLTSENSLPHNSTYGQRTAVISSLSMKPQAADKDVNKKVFIRFKDREHQFTFHLLSNGPPTVNEVLENCKQLFQIVNQSKPLALYHDQKLMHEDSELARLFSSFTSDTIVLEVRELSSTTIVAPEPSKPSELDGLKMLSAASLQVKRELTTPLPPPSPASSSQTALDNIINRIGSRSPIPQRNQSESPNELPSLPSVVGNSNRNFFQNGNLPQPVFQPLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.64
3 0.64
4 0.58
5 0.55
6 0.59
7 0.55
8 0.5
9 0.46
10 0.49
11 0.54
12 0.52
13 0.47
14 0.43
15 0.44
16 0.46
17 0.5
18 0.49
19 0.45
20 0.5
21 0.5
22 0.55
23 0.55
24 0.54
25 0.52
26 0.49
27 0.47
28 0.51
29 0.56
30 0.55
31 0.62
32 0.59
33 0.57
34 0.58
35 0.6
36 0.53
37 0.5
38 0.42
39 0.31
40 0.29
41 0.31
42 0.32
43 0.28
44 0.3
45 0.28
46 0.32
47 0.34
48 0.35
49 0.37
50 0.39
51 0.46
52 0.48
53 0.49
54 0.44
55 0.41
56 0.38
57 0.33
58 0.3
59 0.24
60 0.19
61 0.17
62 0.17
63 0.18
64 0.19
65 0.2
66 0.18
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.17
73 0.17
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.15
84 0.2
85 0.23
86 0.32
87 0.42
88 0.5
89 0.58
90 0.66
91 0.73
92 0.79
93 0.86
94 0.88
95 0.88
96 0.86
97 0.88
98 0.89
99 0.85
100 0.81
101 0.79
102 0.7
103 0.61
104 0.56
105 0.46
106 0.38
107 0.3
108 0.24
109 0.17
110 0.15
111 0.16
112 0.16
113 0.17
114 0.19
115 0.21
116 0.2
117 0.22
118 0.21
119 0.19
120 0.29
121 0.31
122 0.27
123 0.27
124 0.31
125 0.3
126 0.3
127 0.32
128 0.28
129 0.28
130 0.29
131 0.34
132 0.33
133 0.34
134 0.35
135 0.33
136 0.3
137 0.28
138 0.26
139 0.21
140 0.19
141 0.18
142 0.17
143 0.17
144 0.15
145 0.14
146 0.15
147 0.14
148 0.13
149 0.11
150 0.11
151 0.13
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.15
156 0.14
157 0.15
158 0.16
159 0.2
160 0.23
161 0.23
162 0.24
163 0.25
164 0.28
165 0.29
166 0.29
167 0.29
168 0.32
169 0.32
170 0.32
171 0.29
172 0.26
173 0.26
174 0.24
175 0.18
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.12
196 0.14
197 0.16
198 0.16
199 0.16
200 0.15
201 0.14
202 0.14
203 0.12
204 0.1
205 0.07
206 0.06
207 0.05
208 0.06
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.1
218 0.11
219 0.14
220 0.17
221 0.24
222 0.25
223 0.27
224 0.31
225 0.33
226 0.36
227 0.35
228 0.34
229 0.29
230 0.32
231 0.35
232 0.3
233 0.29
234 0.25
235 0.25
236 0.23
237 0.22
238 0.2
239 0.17
240 0.17
241 0.17
242 0.23
243 0.24
244 0.26
245 0.29
246 0.33
247 0.38
248 0.39
249 0.39
250 0.33
251 0.31
252 0.28
253 0.23
254 0.23
255 0.16
256 0.15
257 0.14
258 0.13
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.04
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.08
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.14
308 0.16
309 0.17
310 0.17
311 0.16
312 0.15
313 0.15
314 0.12
315 0.12
316 0.09
317 0.11
318 0.14
319 0.18
320 0.23
321 0.25
322 0.25
323 0.27
324 0.29
325 0.29
326 0.32
327 0.32
328 0.35
329 0.34
330 0.35
331 0.37
332 0.35
333 0.38
334 0.32
335 0.28
336 0.21
337 0.18
338 0.17
339 0.12
340 0.12
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.1
365 0.1
366 0.08
367 0.07
368 0.06
369 0.05
370 0.04
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.1
376 0.14
377 0.16
378 0.17
379 0.17
380 0.16
381 0.18
382 0.18
383 0.18
384 0.18
385 0.18
386 0.18
387 0.18
388 0.19
389 0.18
390 0.18
391 0.15
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.13
398 0.13
399 0.17
400 0.18
401 0.19
402 0.22
403 0.25
404 0.35
405 0.4
406 0.42
407 0.39
408 0.4
409 0.43
410 0.45
411 0.46
412 0.45
413 0.45
414 0.5
415 0.58
416 0.6
417 0.61
418 0.58
419 0.57
420 0.49
421 0.48
422 0.45
423 0.37
424 0.33
425 0.26
426 0.22
427 0.23
428 0.22
429 0.17
430 0.14
431 0.15
432 0.16
433 0.16
434 0.15
435 0.13
436 0.18
437 0.21
438 0.23
439 0.2
440 0.2
441 0.19
442 0.2
443 0.2
444 0.17
445 0.25
446 0.28
447 0.31
448 0.32
449 0.32
450 0.31
451 0.3
452 0.28
453 0.23
454 0.22
455 0.25
456 0.26
457 0.32
458 0.32
459 0.32
460 0.36
461 0.32
462 0.28
463 0.22
464 0.2
465 0.15
466 0.21
467 0.21
468 0.17
469 0.15
470 0.15
471 0.15
472 0.14
473 0.16
474 0.11
475 0.11
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.15
480 0.16
481 0.12
482 0.12
483 0.12
484 0.09
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.1
493 0.11
494 0.11
495 0.14
496 0.18
497 0.2
498 0.21
499 0.19
500 0.22
501 0.28
502 0.28
503 0.26
504 0.25
505 0.24
506 0.23
507 0.23
508 0.2
509 0.12
510 0.11
511 0.11
512 0.14
513 0.16
514 0.17
515 0.22
516 0.23
517 0.24
518 0.26
519 0.29
520 0.26
521 0.29
522 0.35
523 0.36
524 0.37
525 0.37
526 0.39
527 0.39
528 0.4
529 0.36
530 0.36
531 0.33
532 0.33
533 0.34
534 0.34
535 0.3
536 0.28
537 0.28
538 0.24
539 0.22
540 0.23
541 0.22
542 0.19
543 0.21
544 0.2
545 0.19
546 0.2
547 0.28
548 0.34
549 0.42
550 0.48
551 0.55
552 0.61
553 0.67
554 0.69
555 0.66
556 0.64
557 0.6
558 0.59
559 0.54
560 0.48
561 0.4
562 0.36
563 0.31
564 0.28
565 0.23
566 0.19
567 0.16
568 0.21
569 0.26
570 0.32
571 0.34
572 0.34
573 0.35
574 0.36
575 0.37
576 0.32
577 0.32
578 0.35
579 0.37
580 0.41
581 0.43
582 0.42
583 0.41
584 0.43