FuNGI

C5DSC0

Protein Details

Accession

C5DSC0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-123	GVAPRAKMNQQRARRFRSAKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
511-519	KKLVAKKRR
537-540	RKKK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, mito_nucl 10.5, cyto 6, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	zro:ZYRO0B15642g -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPSFFRWLSRKYPKIISPVIEEQPQVVDGVTLPIDYTAPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPPPETEDEMLLAVFEYTNRVLNMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSAKDAQIENENRERIMQEREQLGEIIDGAVKTKKTWDSNAITPGTPFMDKLAAALRYWCSFKLATDPGWKNLQVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRADAQYNPNTTHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKVLREDVFAQGNNKRHNLKDSLNMSEEEKQMIAKQDSEKPFLWLHISVLREYLSAELWVPRMPFPFDLERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPCLDVRENSIDILLDIWKVVLPTMKTYITCDGELNLESVEKLLSQLGSREADIFKTRHIQEVRKQENFERKKAQRNVSKGQDRHPTKPNEQLQLYDTNGNLSKSSWNLTTHDMVNLKKEIMLANEGDANAIATVKAQSDKNDQLMNELMNEQMDKAVDEANKTNFTAAEVMKKKLVAKKRRLEAEEEEQRQEEQKEESRKKKKTEEEATKEEPNLDDQIKAELEEERIEEEEEEEEGQDQEEEQGEKPPDWVPEVSNGGITSGIVDTDQAVKLHEPGYHERYYTEKFHISPNHIDALRKDLVKCYIEGVSWVLLYYYQGCASWTWYYPYHYAPLAADFFGFSDIKVEFPPGKPFLPYEQLMSVLPAASGHTLPPIFRPLMSSPDSEIIDFYPTEFPVDMNGKKMPWQGIALLPFIDEKRLLQVVRAQYSKLTEEEKSRNVVRNPILLISNKNANYEKFLKKLYPTDVPPQPELYFQHFRSGLSGVVSTDHEGYRPNSKLSCPIQTGSLPELSTNLFLKLDYKLVPLPSKNKSIILNGFIASEPVLSPYDLDAVMYKYNNGPPRRWNFENDMRNNVVPVGPCGVTQYKPRVGGYRSFFFFSNMQQQPPTPMQYQMSGPPINNRYNGGGNGGGSRYSGSSRYGDPPNNYRNQNNAPGMSRYQTGRFPQRSGTMRRH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.64
3	0.68
4	0.69
5	0.62
6	0.59
7	0.59
8	0.57
9	0.52
10	0.46
11	0.38
12	0.34
13	0.3
14	0.23
15	0.15
16	0.11
17	0.09
18	0.11
19	0.1
20	0.08
21	0.08
22	0.08
23	0.09
24	0.09
25	0.11
26	0.16
27	0.18
28	0.18
29	0.19
30	0.21
31	0.22
32	0.23
33	0.23
34	0.17
35	0.17
36	0.17
37	0.17
38	0.14
39	0.13
40	0.12
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.19
49	0.24
50	0.27
51	0.36
52	0.46
53	0.52
54	0.58
55	0.58
56	0.58
57	0.59
58	0.59
59	0.51
60	0.43
61	0.37
62	0.31
63	0.27
64	0.21
65	0.15
66	0.1
67	0.09
68	0.06
69	0.08
70	0.09
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.2
76	0.31
77	0.37
78	0.4
79	0.4
80	0.42
81	0.44
82	0.45
83	0.42
84	0.33
85	0.3
86	0.26
87	0.25
88	0.24
89	0.21
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.26
97	0.36
98	0.45
99	0.54
100	0.65
101	0.74
102	0.79
103	0.82
104	0.8
105	0.76
106	0.77
107	0.75
108	0.72
109	0.7
110	0.66
111	0.58
112	0.62
113	0.6
114	0.55
115	0.54
116	0.47
117	0.4
118	0.37
119	0.36
120	0.29
121	0.32
122	0.3
123	0.29
124	0.31
125	0.33
126	0.33
127	0.31
128	0.29
129	0.22
130	0.18
131	0.13
132	0.1
133	0.09
134	0.09
135	0.12
136	0.12
137	0.12
138	0.18
139	0.24
140	0.27
141	0.32
142	0.39
143	0.42
144	0.47
145	0.53
146	0.5
147	0.43
148	0.39
149	0.36
150	0.3
151	0.24
152	0.19
153	0.14
154	0.13
155	0.12
156	0.13
157	0.17
158	0.15
159	0.15
160	0.18
161	0.19
162	0.19
163	0.21
164	0.21
165	0.19
166	0.18
167	0.19
168	0.24
169	0.25
170	0.27
171	0.35
172	0.38
173	0.38
174	0.42
175	0.41
176	0.35
177	0.33
178	0.31
179	0.21
180	0.21
181	0.19
182	0.15
183	0.15
184	0.14
185	0.12
186	0.1
187	0.1
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.1
193	0.09
194	0.13
195	0.14
196	0.16
197	0.18
198	0.21
199	0.28
200	0.29
201	0.32
202	0.35
203	0.39
204	0.4
205	0.41
206	0.47
207	0.45
208	0.47
209	0.46
210	0.4
211	0.38
212	0.35
213	0.33
214	0.23
215	0.19
216	0.16
217	0.16
218	0.16
219	0.13
220	0.12
221	0.1
222	0.1
223	0.08
224	0.07
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.08
232	0.09
233	0.12
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.21
238	0.23
239	0.25
240	0.26
241	0.26
242	0.27
243	0.28
244	0.28
245	0.29
246	0.33
247	0.33
248	0.36
249	0.37
250	0.36
251	0.4
252	0.42
253	0.4
254	0.43
255	0.42
256	0.42
257	0.4
258	0.39
259	0.36
260	0.35
261	0.33
262	0.24
263	0.21
264	0.17
265	0.17
266	0.22
267	0.2
268	0.19
269	0.22
270	0.29
271	0.33
272	0.37
273	0.35
274	0.33
275	0.32
276	0.3
277	0.29
278	0.21
279	0.2
280	0.19
281	0.2
282	0.17
283	0.17
284	0.16
285	0.13
286	0.13
287	0.12
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.11
294	0.11
295	0.12
296	0.13
297	0.15
298	0.15
299	0.18
300	0.21
301	0.21
302	0.22
303	0.22
304	0.21
305	0.2
306	0.2
307	0.16
308	0.12
309	0.11
310	0.09
311	0.08
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.11
321	0.11
322	0.13
323	0.13
324	0.13
325	0.12
326	0.12
327	0.16
328	0.18
329	0.17
330	0.17
331	0.2
332	0.2
333	0.19
334	0.19
335	0.14
336	0.1
337	0.1
338	0.09
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.1
348	0.13
349	0.14
350	0.14
351	0.16
352	0.21
353	0.2
354	0.2
355	0.18
356	0.16
357	0.16
358	0.16
359	0.14
360	0.1
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.07
371	0.09
372	0.1
373	0.1
374	0.12
375	0.11
376	0.13
377	0.16
378	0.16
379	0.15
380	0.21
381	0.21
382	0.26
383	0.3
384	0.33
385	0.37
386	0.48
387	0.53
388	0.49
389	0.51
390	0.49
391	0.56
392	0.56
393	0.55
394	0.54
395	0.52
396	0.59
397	0.65
398	0.68
399	0.65
400	0.67
401	0.69
402	0.69
403	0.72
404	0.64
405	0.63
406	0.64
407	0.61
408	0.59
409	0.6
410	0.56
411	0.51
412	0.59
413	0.57
414	0.53
415	0.49
416	0.45
417	0.39
418	0.37
419	0.34
420	0.27
421	0.21
422	0.17
423	0.18
424	0.17
425	0.14
426	0.11
427	0.12
428	0.11
429	0.13
430	0.13
431	0.13
432	0.15
433	0.17
434	0.19
435	0.18
436	0.2
437	0.21
438	0.19
439	0.2
440	0.19
441	0.16
442	0.15
443	0.15
444	0.12
445	0.11
446	0.12
447	0.09
448	0.09
449	0.1
450	0.09
451	0.09
452	0.08
453	0.07
454	0.05
455	0.05
456	0.04
457	0.03
458	0.04
459	0.04
460	0.07
461	0.07
462	0.09
463	0.15
464	0.17
465	0.19
466	0.2
467	0.2
468	0.19
469	0.2
470	0.18
471	0.13
472	0.12
473	0.09
474	0.07
475	0.08
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.05
481	0.07
482	0.08
483	0.09
484	0.11
485	0.13
486	0.14
487	0.14
488	0.13
489	0.1
490	0.11
491	0.12
492	0.11
493	0.17
494	0.18
495	0.19
496	0.2
497	0.21
498	0.24
499	0.26
500	0.35
501	0.37
502	0.44
503	0.51
504	0.56
505	0.62
506	0.6
507	0.59
508	0.55
509	0.55
510	0.53
511	0.48
512	0.43
513	0.37
514	0.36
515	0.33
516	0.28
517	0.2
518	0.14
519	0.18
520	0.27
521	0.34
522	0.44
523	0.52
524	0.58
525	0.62
526	0.67
527	0.69
528	0.7
529	0.73
530	0.73
531	0.71
532	0.72
533	0.7
534	0.63
535	0.56
536	0.46
537	0.36
538	0.27
539	0.22
540	0.16
541	0.12
542	0.11
543	0.12
544	0.12
545	0.12
546	0.11
547	0.09
548	0.09
549	0.09
550	0.09
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.06
559	0.06
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.04
565	0.05
566	0.06
567	0.07
568	0.07
569	0.11
570	0.12
571	0.12
572	0.13
573	0.15
574	0.14
575	0.15
576	0.16
577	0.12
578	0.15
579	0.17
580	0.16
581	0.14
582	0.13
583	0.12
584	0.11
585	0.1
586	0.07
587	0.05
588	0.04
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.06
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.08
597	0.09
598	0.11
599	0.12
600	0.14
601	0.18
602	0.24
603	0.24
604	0.24
605	0.24
606	0.26
607	0.28
608	0.28
609	0.26
610	0.23
611	0.23
612	0.29
613	0.32
614	0.33
615	0.33
616	0.31
617	0.33
618	0.31
619	0.31
620	0.25
621	0.27
622	0.26
623	0.24
624	0.22
625	0.2
626	0.24
627	0.24
628	0.24
629	0.19
630	0.17
631	0.16
632	0.16
633	0.14
634	0.1
635	0.09
636	0.09
637	0.07
638	0.06
639	0.06
640	0.07
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.07
645	0.08
646	0.1
647	0.12
648	0.12
649	0.14
650	0.15
651	0.18
652	0.2
653	0.21
654	0.2
655	0.18
656	0.18
657	0.16
658	0.17
659	0.15
660	0.13
661	0.11
662	0.09
663	0.09
664	0.1
665	0.1
666	0.07
667	0.08
668	0.08
669	0.09
670	0.09
671	0.11
672	0.11
673	0.13
674	0.19
675	0.2
676	0.2
677	0.2
678	0.22
679	0.24
680	0.27
681	0.25
682	0.23
683	0.2
684	0.21
685	0.2
686	0.19
687	0.15
688	0.1
689	0.09
690	0.07
691	0.07
692	0.07
693	0.07
694	0.06
695	0.08
696	0.09
697	0.09
698	0.11
699	0.14
700	0.13
701	0.13
702	0.17
703	0.17
704	0.22
705	0.24
706	0.23
707	0.21
708	0.25
709	0.25
710	0.21
711	0.2
712	0.15
713	0.14
714	0.13
715	0.13
716	0.11
717	0.1
718	0.12
719	0.11
720	0.11
721	0.13
722	0.19
723	0.18
724	0.19
725	0.21
726	0.2
727	0.23
728	0.26
729	0.24
730	0.21
731	0.21
732	0.2
733	0.22
734	0.24
735	0.21
736	0.17
737	0.15
738	0.15
739	0.14
740	0.14
741	0.1
742	0.09
743	0.12
744	0.15
745	0.15
746	0.15
747	0.21
748	0.26
749	0.31
750	0.31
751	0.28
752	0.26
753	0.29
754	0.29
755	0.26
756	0.23
757	0.2
758	0.26
759	0.32
760	0.33
761	0.35
762	0.38
763	0.42
764	0.41
765	0.46
766	0.42
767	0.4
768	0.39
769	0.36
770	0.35
771	0.29
772	0.3
773	0.26
774	0.3
775	0.27
776	0.29
777	0.3
778	0.28
779	0.32
780	0.37
781	0.38
782	0.35
783	0.37
784	0.36
785	0.38
786	0.43
787	0.42
788	0.41
789	0.4
790	0.46
791	0.49
792	0.5
793	0.47
794	0.45
795	0.41
796	0.37
797	0.36
798	0.36
799	0.37
800	0.34
801	0.39
802	0.36
803	0.36
804	0.34
805	0.32
806	0.25
807	0.19
808	0.19
809	0.12
810	0.13
811	0.13
812	0.13
813	0.14
814	0.13
815	0.12
816	0.14
817	0.16
818	0.22
819	0.24
820	0.26
821	0.26
822	0.27
823	0.35
824	0.37
825	0.42
826	0.37
827	0.35
828	0.36
829	0.35
830	0.37
831	0.31
832	0.29
833	0.22
834	0.19
835	0.2
836	0.17
837	0.18
838	0.16
839	0.14
840	0.12
841	0.12
842	0.13
843	0.14
844	0.16
845	0.14
846	0.16
847	0.18
848	0.22
849	0.27
850	0.31
851	0.37
852	0.39
853	0.44
854	0.44
855	0.44
856	0.43
857	0.44
858	0.44
859	0.4
860	0.37
861	0.31
862	0.3
863	0.26
864	0.24
865	0.17
866	0.13
867	0.09
868	0.09
869	0.1
870	0.09
871	0.09
872	0.1
873	0.11
874	0.11
875	0.11
876	0.1
877	0.12
878	0.15
879	0.14
880	0.15
881	0.17
882	0.23
883	0.31
884	0.33
885	0.35
886	0.42
887	0.51
888	0.58
889	0.57
890	0.57
891	0.59
892	0.65
893	0.71
894	0.66
895	0.64
896	0.6
897	0.57
898	0.51
899	0.43
900	0.35
901	0.26
902	0.23
903	0.2
904	0.16
905	0.16
906	0.2
907	0.22
908	0.23
909	0.28
910	0.34
911	0.36
912	0.4
913	0.42
914	0.44
915	0.45
916	0.5
917	0.5
918	0.5
919	0.47
920	0.45
921	0.43
922	0.4
923	0.38
924	0.35
925	0.38
926	0.34
927	0.34
928	0.34
929	0.34
930	0.38
931	0.4
932	0.4
933	0.32
934	0.33
935	0.33
936	0.34
937	0.36
938	0.34
939	0.36
940	0.34
941	0.33
942	0.37
943	0.41
944	0.42
945	0.42
946	0.39
947	0.37
948	0.38
949	0.38
950	0.33
951	0.28
952	0.25
953	0.26
954	0.23
955	0.19
956	0.16
957	0.16
958	0.14
959	0.15
960	0.16
961	0.16
962	0.19
963	0.22
964	0.29
965	0.36
966	0.41
967	0.45
968	0.52
969	0.58
970	0.63
971	0.65
972	0.62
973	0.63
974	0.63
975	0.66
976	0.62
977	0.58
978	0.53
979	0.53
980	0.52
981	0.46
982	0.42
983	0.36
984	0.35
985	0.38
986	0.42
987	0.48
988	0.5
989	0.5
990	0.52
991	0.58
992	0.62

C5DSC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer