Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DQR1

Protein Details
Accession C5DQR1    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-44GSGKKQARGRINKRSGGPKKAPKQIRRPAGVBasic
187-214KRAAILKKARAKQQPKERQPKKSLEDLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-50GKKQARGRINKRSGGPKKAPKQIRRPAGVGKKVRA
172-208NRPSAAAAAAKKGPNKRAAILKKARAKQQPKERQPKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG zro:ZYRO0B02310g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSANLDKSLDEIIGSGKKQARGRINKRSGGPKKAPKQIRRPAGVGKKVRAPADGASVARMAKLLDTSREAKVNVEGLPRDIKQDAVKEFFSSQVGGVSRVLLSYNERGQSTGMANITFRNGEMAKKAVAKFNGAPIDGGRSRLRLNLIIDPNQQPSKSLSERIKAVPVTNKNRPSAAAAAAKKGPNKRAAILKKARAKQQPKERQPKKSLEDLDKEMTDYFEEKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.21
3 0.24
4 0.31
5 0.35
6 0.43
7 0.49
8 0.56
9 0.65
10 0.7
11 0.75
12 0.75
13 0.77
14 0.8
15 0.78
16 0.77
17 0.77
18 0.76
19 0.77
20 0.8
21 0.84
22 0.82
23 0.84
24 0.84
25 0.84
26 0.78
27 0.73
28 0.74
29 0.73
30 0.73
31 0.69
32 0.63
33 0.61
34 0.6
35 0.57
36 0.48
37 0.4
38 0.33
39 0.32
40 0.31
41 0.24
42 0.21
43 0.2
44 0.19
45 0.17
46 0.15
47 0.09
48 0.07
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.15
53 0.18
54 0.19
55 0.22
56 0.21
57 0.2
58 0.2
59 0.2
60 0.18
61 0.18
62 0.17
63 0.16
64 0.2
65 0.19
66 0.19
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.21
71 0.22
72 0.21
73 0.22
74 0.21
75 0.21
76 0.2
77 0.18
78 0.14
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.09
88 0.06
89 0.08
90 0.1
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.13
96 0.14
97 0.13
98 0.12
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.15
113 0.16
114 0.17
115 0.17
116 0.2
117 0.19
118 0.23
119 0.23
120 0.2
121 0.19
122 0.16
123 0.21
124 0.18
125 0.21
126 0.17
127 0.16
128 0.17
129 0.19
130 0.2
131 0.18
132 0.2
133 0.24
134 0.27
135 0.29
136 0.31
137 0.31
138 0.34
139 0.33
140 0.3
141 0.24
142 0.23
143 0.27
144 0.26
145 0.31
146 0.31
147 0.33
148 0.36
149 0.37
150 0.39
151 0.33
152 0.34
153 0.36
154 0.4
155 0.45
156 0.5
157 0.53
158 0.51
159 0.51
160 0.48
161 0.44
162 0.37
163 0.35
164 0.34
165 0.3
166 0.32
167 0.35
168 0.37
169 0.38
170 0.42
171 0.42
172 0.41
173 0.43
174 0.44
175 0.5
176 0.54
177 0.59
178 0.62
179 0.66
180 0.68
181 0.71
182 0.75
183 0.75
184 0.77
185 0.77
186 0.79
187 0.82
188 0.83
189 0.89
190 0.89
191 0.89
192 0.89
193 0.88
194 0.82
195 0.81
196 0.79
197 0.76
198 0.74
199 0.69
200 0.66
201 0.57
202 0.52
203 0.43
204 0.36
205 0.29