Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DTE6

Protein Details
Accession C5DTE6    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-101GKSFERRRCNHPPKEAKPPHEBasic
191-228SESQPPAKKRKGPKGPNPLSVRKKQKKPEQQGQGQGQEHydrophilic
235-264SEREHEDAGKKKRRRRRKHKGSHEDGDGQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-218PAKKRKGPKGPNPLSVRKKQKKP
243-255GKKKRRRRRKHKG
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG zro:ZYRO0C07920g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRQKRAKSYKKQMLVYNYAFRFREPYQVLIDDQLVSDCQKSHYDLVGGLKRTLQAEVKPMITQCCMQALYFTKNQDAIELGKSFERRRCNHPPKEAKPPHECIQSVVNVNGSNKHRYVVASQDVTLRRKLRKVPGVPLIHMSRSVMVMEPLSEASSRVNEMSEREKLLKGLNDPKLAGLKTTPSVENELESESQPPAKKRKGPKGPNPLSVRKKQKKPEQQGQGQGQEQEQEHESEREHEDAGKKKRRRRRKHKGSHEDGDGQENSAGEVEAEDRPQEDRPQEDRPQGDQNSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.73
3 0.7
4 0.62
5 0.59
6 0.54
7 0.47
8 0.44
9 0.37
10 0.41
11 0.35
12 0.35
13 0.34
14 0.36
15 0.36
16 0.32
17 0.32
18 0.22
19 0.19
20 0.17
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.12
26 0.14
27 0.17
28 0.19
29 0.2
30 0.2
31 0.21
32 0.28
33 0.32
34 0.32
35 0.29
36 0.28
37 0.27
38 0.27
39 0.28
40 0.23
41 0.19
42 0.23
43 0.25
44 0.25
45 0.25
46 0.25
47 0.25
48 0.23
49 0.22
50 0.17
51 0.18
52 0.17
53 0.16
54 0.19
55 0.21
56 0.24
57 0.26
58 0.27
59 0.25
60 0.26
61 0.26
62 0.23
63 0.2
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.17
69 0.2
70 0.23
71 0.26
72 0.33
73 0.33
74 0.41
75 0.52
76 0.59
77 0.65
78 0.72
79 0.78
80 0.74
81 0.82
82 0.81
83 0.77
84 0.73
85 0.71
86 0.66
87 0.61
88 0.56
89 0.46
90 0.43
91 0.38
92 0.33
93 0.27
94 0.23
95 0.18
96 0.18
97 0.23
98 0.22
99 0.22
100 0.2
101 0.2
102 0.2
103 0.19
104 0.21
105 0.2
106 0.22
107 0.19
108 0.19
109 0.24
110 0.27
111 0.28
112 0.31
113 0.3
114 0.28
115 0.32
116 0.37
117 0.4
118 0.45
119 0.47
120 0.49
121 0.53
122 0.53
123 0.49
124 0.47
125 0.4
126 0.32
127 0.28
128 0.22
129 0.14
130 0.12
131 0.11
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.09
148 0.12
149 0.13
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.26
158 0.29
159 0.29
160 0.28
161 0.29
162 0.29
163 0.27
164 0.23
165 0.15
166 0.13
167 0.13
168 0.15
169 0.15
170 0.13
171 0.17
172 0.16
173 0.16
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.14
178 0.14
179 0.11
180 0.15
181 0.17
182 0.21
183 0.27
184 0.33
185 0.4
186 0.48
187 0.59
188 0.66
189 0.74
190 0.79
191 0.83
192 0.83
193 0.84
194 0.82
195 0.81
196 0.78
197 0.76
198 0.77
199 0.76
200 0.78
201 0.79
202 0.83
203 0.84
204 0.86
205 0.87
206 0.86
207 0.84
208 0.84
209 0.81
210 0.75
211 0.66
212 0.57
213 0.48
214 0.41
215 0.34
216 0.27
217 0.22
218 0.18
219 0.19
220 0.19
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.2
225 0.2
226 0.21
227 0.25
228 0.33
229 0.43
230 0.49
231 0.54
232 0.62
233 0.72
234 0.79
235 0.85
236 0.87
237 0.89
238 0.9
239 0.94
240 0.96
241 0.97
242 0.95
243 0.91
244 0.86
245 0.81
246 0.71
247 0.65
248 0.54
249 0.44
250 0.36
251 0.28
252 0.22
253 0.15
254 0.14
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.13
263 0.16
264 0.22
265 0.23
266 0.29
267 0.34
268 0.42
269 0.48
270 0.54
271 0.55
272 0.54
273 0.59