Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5E4W9

Protein Details
Accession C5E4W9    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-316LIEKQGPKPKKLKPADGSHRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-250RERRPYLHESRHKHAMRRPR
299-315EKQGPKPKKLKPADGSH
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018362  CCAAT-binding_factor_CS  
IPR001289  NFYA  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
KEGG zro:ZYRO0E09372g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02045  CBFB_NFYA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00686  NFYA_HAP2_1  
PS51152  NFYA_HAP2_2  
Amino Acid Sequences MNDQGEEHQPLDIGLLRYSTDEIGMRSAPNTMSDKITKVAKDVLVEQSNPADIYLYDQPQEALRQNAHKRSLETQQSLTSTTSNYGNDKNTTDYTNDTNNRINSNNDSNNDSPHDINYNNSSNNNMDVQSMLTPLKQRDRHDYREDHHKQQNLGPDKGPPITASHESSIPASQEMQSADTLLTRTTFDTRGSNEGNDPTEQPFYVNAKQYYRILKRRYTRAKLEENLRISRERRPYLHESRHKHAMRRPRGQGGRFLTLAEIEAMKLKEGSASSGSSVSSPPSIKSESEHMGPGPRLIEKQGPKPKKLKPADGSHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.14
4 0.16
5 0.17
6 0.15
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.15
11 0.16
12 0.15
13 0.15
14 0.16
15 0.15
16 0.18
17 0.21
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.27
22 0.28
23 0.33
24 0.29
25 0.28
26 0.31
27 0.28
28 0.28
29 0.29
30 0.34
31 0.32
32 0.32
33 0.3
34 0.26
35 0.25
36 0.23
37 0.2
38 0.12
39 0.09
40 0.13
41 0.17
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.18
46 0.18
47 0.22
48 0.2
49 0.19
50 0.21
51 0.29
52 0.36
53 0.43
54 0.47
55 0.46
56 0.47
57 0.48
58 0.53
59 0.52
60 0.49
61 0.44
62 0.42
63 0.4
64 0.39
65 0.35
66 0.27
67 0.19
68 0.18
69 0.18
70 0.16
71 0.18
72 0.19
73 0.21
74 0.23
75 0.23
76 0.25
77 0.24
78 0.24
79 0.23
80 0.22
81 0.22
82 0.28
83 0.29
84 0.29
85 0.32
86 0.32
87 0.33
88 0.32
89 0.32
90 0.29
91 0.34
92 0.35
93 0.32
94 0.35
95 0.33
96 0.34
97 0.34
98 0.31
99 0.24
100 0.2
101 0.21
102 0.16
103 0.18
104 0.2
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.2
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.14
113 0.12
114 0.1
115 0.11
116 0.09
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.11
121 0.13
122 0.21
123 0.25
124 0.27
125 0.36
126 0.43
127 0.48
128 0.53
129 0.55
130 0.5
131 0.57
132 0.59
133 0.56
134 0.54
135 0.51
136 0.45
137 0.43
138 0.49
139 0.43
140 0.39
141 0.32
142 0.29
143 0.28
144 0.27
145 0.24
146 0.16
147 0.13
148 0.14
149 0.16
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.15
156 0.12
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.14
176 0.15
177 0.19
178 0.2
179 0.2
180 0.19
181 0.2
182 0.2
183 0.19
184 0.18
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.13
189 0.14
190 0.17
191 0.2
192 0.24
193 0.25
194 0.26
195 0.29
196 0.32
197 0.38
198 0.42
199 0.46
200 0.46
201 0.52
202 0.58
203 0.66
204 0.72
205 0.7
206 0.71
207 0.71
208 0.74
209 0.72
210 0.71
211 0.68
212 0.63
213 0.59
214 0.53
215 0.5
216 0.43
217 0.45
218 0.47
219 0.45
220 0.42
221 0.46
222 0.52
223 0.58
224 0.66
225 0.68
226 0.66
227 0.67
228 0.75
229 0.71
230 0.68
231 0.65
232 0.65
233 0.66
234 0.69
235 0.69
236 0.69
237 0.73
238 0.69
239 0.71
240 0.66
241 0.61
242 0.51
243 0.45
244 0.36
245 0.28
246 0.26
247 0.18
248 0.12
249 0.08
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.15
258 0.13
259 0.14
260 0.15
261 0.16
262 0.16
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.15
267 0.15
268 0.16
269 0.19
270 0.21
271 0.21
272 0.24
273 0.28
274 0.28
275 0.29
276 0.3
277 0.27
278 0.3
279 0.3
280 0.29
281 0.26
282 0.24
283 0.23
284 0.25
285 0.32
286 0.33
287 0.43
288 0.52
289 0.57
290 0.62
291 0.7
292 0.74
293 0.77
294 0.79
295 0.79
296 0.77