Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DYF0

Protein Details
Accession C5DYF0    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-50LKPIEPGPKSEQKRQRIERRPEPKETKTDNBasic
161-182RENIRLKKLNKHRKFKPLQVSSHydrophilic
235-259TDFQPVKIKKRSKRDVKSRVKLPSKHydrophilic
425-459AYKRLSQRFHGTKSNKRKREKFESKLRARHNGNTNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-41KSEQKRQRIERRP
168-174KLNKHRK
241-255KIKKRSKRDVKSRVK
436-452TKSNKRKREKFESKLRA
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG zro:ZYRO0F12496g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MADEINLSLEETNAIRRQLGLKPIEPGPKSEQKRQRIERRPEPKETKTDNGGFQFMDNDKVSGLRKRLASLRNSPSSSHVQEDDKDWLSKIGTQKRHKPIKVIHEDEPEEELPSLRISHGIDEIDSKNGVVLTLKEQSLNDEDGGDDILENTVLTQSQRDRENIRLKKLNKHRKFKPLQVSSFDLDKDERSKDNDETVVTVGGENKVTESKPAAEGKIKVEFDEQDDEDDNDHPTDFQPVKIKKRSKRDVKSRVKLPSKIQPVALIDEDEDTEEAQEQISVASRPLLKNRIQTPQEIAQQIQREKLERQDRSANLAQVNKNSDLVIDENVQFLESLRVNIVENENKEQEQKEQEGPKPVEVAESSVPATTESQALDFSTGLASTLHFLQKKELLPSSNDVNQDPNAEINLVYRDEMGTPLTTKEAYKRLSQRFHGTKSNKRKREKFESKLRARHNGNTNNSERELEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.2
4 0.24
5 0.28
6 0.36
7 0.36
8 0.34
9 0.38
10 0.44
11 0.51
12 0.47
13 0.47
14 0.47
15 0.51
16 0.55
17 0.61
18 0.64
19 0.66
20 0.76
21 0.81
22 0.84
23 0.85
24 0.89
25 0.89
26 0.91
27 0.88
28 0.88
29 0.87
30 0.83
31 0.83
32 0.79
33 0.75
34 0.72
35 0.7
36 0.65
37 0.59
38 0.53
39 0.43
40 0.37
41 0.35
42 0.27
43 0.28
44 0.22
45 0.2
46 0.18
47 0.21
48 0.24
49 0.25
50 0.28
51 0.28
52 0.29
53 0.32
54 0.4
55 0.44
56 0.48
57 0.51
58 0.56
59 0.59
60 0.59
61 0.56
62 0.53
63 0.54
64 0.49
65 0.43
66 0.38
67 0.33
68 0.33
69 0.35
70 0.35
71 0.31
72 0.29
73 0.26
74 0.24
75 0.22
76 0.25
77 0.31
78 0.34
79 0.41
80 0.48
81 0.58
82 0.67
83 0.76
84 0.74
85 0.74
86 0.72
87 0.74
88 0.76
89 0.71
90 0.67
91 0.64
92 0.63
93 0.56
94 0.52
95 0.41
96 0.32
97 0.27
98 0.21
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.09
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.15
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.18
125 0.2
126 0.2
127 0.16
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.09
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.08
143 0.1
144 0.15
145 0.18
146 0.2
147 0.23
148 0.32
149 0.42
150 0.44
151 0.49
152 0.53
153 0.54
154 0.61
155 0.69
156 0.72
157 0.71
158 0.75
159 0.76
160 0.78
161 0.82
162 0.81
163 0.81
164 0.78
165 0.73
166 0.68
167 0.64
168 0.55
169 0.5
170 0.41
171 0.31
172 0.23
173 0.2
174 0.19
175 0.17
176 0.17
177 0.19
178 0.22
179 0.22
180 0.24
181 0.24
182 0.21
183 0.2
184 0.18
185 0.15
186 0.12
187 0.11
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.13
199 0.15
200 0.16
201 0.17
202 0.19
203 0.21
204 0.26
205 0.24
206 0.21
207 0.21
208 0.2
209 0.19
210 0.21
211 0.19
212 0.14
213 0.15
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.12
218 0.09
219 0.09
220 0.07
221 0.07
222 0.12
223 0.11
224 0.12
225 0.2
226 0.25
227 0.33
228 0.41
229 0.49
230 0.51
231 0.62
232 0.7
233 0.73
234 0.78
235 0.81
236 0.84
237 0.86
238 0.87
239 0.84
240 0.83
241 0.79
242 0.74
243 0.67
244 0.64
245 0.61
246 0.54
247 0.47
248 0.4
249 0.35
250 0.33
251 0.29
252 0.2
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.09
257 0.08
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.08
270 0.1
271 0.11
272 0.16
273 0.21
274 0.23
275 0.29
276 0.33
277 0.4
278 0.39
279 0.39
280 0.4
281 0.41
282 0.43
283 0.38
284 0.34
285 0.3
286 0.34
287 0.33
288 0.32
289 0.28
290 0.25
291 0.26
292 0.34
293 0.39
294 0.35
295 0.39
296 0.43
297 0.42
298 0.47
299 0.49
300 0.43
301 0.38
302 0.42
303 0.39
304 0.35
305 0.38
306 0.31
307 0.28
308 0.25
309 0.21
310 0.17
311 0.16
312 0.14
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.13
327 0.17
328 0.18
329 0.2
330 0.24
331 0.26
332 0.25
333 0.27
334 0.27
335 0.27
336 0.28
337 0.29
338 0.32
339 0.37
340 0.4
341 0.47
342 0.48
343 0.44
344 0.4
345 0.36
346 0.32
347 0.25
348 0.25
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.14
353 0.14
354 0.13
355 0.14
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.11
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.07
371 0.1
372 0.15
373 0.17
374 0.18
375 0.22
376 0.27
377 0.3
378 0.34
379 0.35
380 0.32
381 0.33
382 0.37
383 0.38
384 0.37
385 0.36
386 0.32
387 0.31
388 0.29
389 0.28
390 0.25
391 0.2
392 0.16
393 0.15
394 0.14
395 0.13
396 0.15
397 0.13
398 0.13
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.12
405 0.12
406 0.13
407 0.14
408 0.15
409 0.16
410 0.21
411 0.27
412 0.28
413 0.36
414 0.45
415 0.52
416 0.59
417 0.64
418 0.68
419 0.69
420 0.73
421 0.74
422 0.73
423 0.74
424 0.78
425 0.83
426 0.82
427 0.84
428 0.87
429 0.87
430 0.9
431 0.9
432 0.89
433 0.89
434 0.91
435 0.91
436 0.9
437 0.88
438 0.87
439 0.81
440 0.8
441 0.8
442 0.78
443 0.76
444 0.76
445 0.73
446 0.69
447 0.65