Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DTR3

Protein Details
Accession C5DTR3    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-67VSGRSSPQKRNWRSSRDSGDGHydrophilic
453-480TVFLSRQRTPGIRKKPKKKTTALTAASSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
462-471PGIRKKPKKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 1, pero 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
KEGG zro:ZYRO0C10626g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MYPFGNSSEDSGQDHNDHGNNDNPNSSPRIFHDPEVYSDRGRMNLGVSGRSSPQKRNWRSSRDSGDGIDSIAKMMAGSGRSESPKSGFFDNAGSIGEAISKLIAASKRQAQRVTPLSLDNAIVNEENLSKQEKILKTLSSYAVRKGLSEKALERWHEIAISFNEFSRNMADSKIWEEYMPNVFNKNTKIIISGQSNGENKCFNLCFPMLCVIWEVLRRCGQESLETKTSRPRAQVLSNGSIIIEDDTCCTGHWKGGSNIERRICTRASLDLNFMVQWLEVRFMDRAADDWYALDEMLRASISNSYMMNKLAQLVELTQMLSGTPQTIPQVLTDGSISSSAASSNETAVEEFHSHMKEFSNLSDTSRHQKARRTFQMTDVMSSLTDLLIYRKEKQIVSPLEALDRYVSNNQTSNSTHLGEMVPANKTAKMENLPYNHGTPSTVGCNSSPENPSTVFLSRQRTPGIRKKPKKKTTALTAASSTSLASLRLTSSRISKDKTGGSNAIPGTKKIRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.26
4 0.26
5 0.26
6 0.31
7 0.32
8 0.33
9 0.33
10 0.3
11 0.3
12 0.34
13 0.32
14 0.29
15 0.29
16 0.36
17 0.37
18 0.38
19 0.42
20 0.39
21 0.43
22 0.46
23 0.44
24 0.36
25 0.37
26 0.36
27 0.3
28 0.29
29 0.24
30 0.2
31 0.22
32 0.22
33 0.21
34 0.21
35 0.22
36 0.24
37 0.31
38 0.34
39 0.37
40 0.45
41 0.53
42 0.6
43 0.68
44 0.74
45 0.76
46 0.8
47 0.82
48 0.8
49 0.75
50 0.69
51 0.6
52 0.54
53 0.45
54 0.38
55 0.3
56 0.22
57 0.16
58 0.14
59 0.12
60 0.08
61 0.08
62 0.1
63 0.08
64 0.09
65 0.11
66 0.15
67 0.18
68 0.19
69 0.2
70 0.2
71 0.24
72 0.26
73 0.27
74 0.24
75 0.22
76 0.24
77 0.23
78 0.21
79 0.17
80 0.14
81 0.12
82 0.11
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.09
90 0.11
91 0.12
92 0.17
93 0.25
94 0.32
95 0.37
96 0.4
97 0.37
98 0.44
99 0.47
100 0.46
101 0.4
102 0.35
103 0.33
104 0.31
105 0.3
106 0.21
107 0.16
108 0.14
109 0.12
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.13
116 0.12
117 0.13
118 0.21
119 0.21
120 0.25
121 0.28
122 0.28
123 0.27
124 0.31
125 0.34
126 0.33
127 0.33
128 0.32
129 0.33
130 0.32
131 0.3
132 0.29
133 0.3
134 0.25
135 0.27
136 0.26
137 0.28
138 0.33
139 0.33
140 0.33
141 0.29
142 0.27
143 0.25
144 0.23
145 0.2
146 0.17
147 0.19
148 0.16
149 0.15
150 0.17
151 0.16
152 0.17
153 0.15
154 0.15
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.15
160 0.16
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.15
165 0.19
166 0.2
167 0.17
168 0.18
169 0.18
170 0.21
171 0.22
172 0.22
173 0.18
174 0.17
175 0.18
176 0.19
177 0.23
178 0.23
179 0.23
180 0.22
181 0.26
182 0.28
183 0.26
184 0.26
185 0.21
186 0.19
187 0.2
188 0.19
189 0.13
190 0.15
191 0.15
192 0.13
193 0.14
194 0.17
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.1
199 0.12
200 0.15
201 0.15
202 0.15
203 0.18
204 0.18
205 0.19
206 0.2
207 0.19
208 0.23
209 0.24
210 0.28
211 0.31
212 0.31
213 0.3
214 0.35
215 0.39
216 0.35
217 0.34
218 0.31
219 0.29
220 0.31
221 0.37
222 0.35
223 0.33
224 0.3
225 0.28
226 0.24
227 0.2
228 0.17
229 0.12
230 0.08
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.12
241 0.13
242 0.21
243 0.27
244 0.29
245 0.34
246 0.35
247 0.35
248 0.33
249 0.35
250 0.27
251 0.23
252 0.21
253 0.2
254 0.21
255 0.21
256 0.21
257 0.18
258 0.18
259 0.17
260 0.15
261 0.11
262 0.07
263 0.07
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.05
282 0.04
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.11
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.16
348 0.17
349 0.21
350 0.23
351 0.27
352 0.33
353 0.38
354 0.37
355 0.45
356 0.52
357 0.58
358 0.66
359 0.67
360 0.61
361 0.62
362 0.67
363 0.6
364 0.53
365 0.43
366 0.33
367 0.25
368 0.24
369 0.18
370 0.08
371 0.08
372 0.06
373 0.07
374 0.12
375 0.15
376 0.18
377 0.22
378 0.26
379 0.27
380 0.29
381 0.37
382 0.36
383 0.38
384 0.38
385 0.34
386 0.34
387 0.33
388 0.3
389 0.23
390 0.19
391 0.17
392 0.18
393 0.2
394 0.19
395 0.22
396 0.23
397 0.25
398 0.26
399 0.28
400 0.26
401 0.26
402 0.23
403 0.22
404 0.21
405 0.19
406 0.2
407 0.18
408 0.16
409 0.17
410 0.18
411 0.18
412 0.18
413 0.18
414 0.21
415 0.22
416 0.26
417 0.31
418 0.33
419 0.37
420 0.39
421 0.4
422 0.36
423 0.32
424 0.27
425 0.22
426 0.22
427 0.21
428 0.2
429 0.2
430 0.19
431 0.23
432 0.24
433 0.29
434 0.28
435 0.24
436 0.26
437 0.25
438 0.27
439 0.26
440 0.26
441 0.25
442 0.29
443 0.35
444 0.35
445 0.38
446 0.42
447 0.45
448 0.52
449 0.57
450 0.63
451 0.67
452 0.74
453 0.81
454 0.87
455 0.91
456 0.91
457 0.91
458 0.89
459 0.89
460 0.89
461 0.82
462 0.76
463 0.68
464 0.6
465 0.51
466 0.41
467 0.3
468 0.21
469 0.16
470 0.12
471 0.11
472 0.1
473 0.12
474 0.14
475 0.16
476 0.17
477 0.23
478 0.31
479 0.37
480 0.4
481 0.43
482 0.47
483 0.53
484 0.56
485 0.56
486 0.52
487 0.48
488 0.5
489 0.46
490 0.48
491 0.42
492 0.39