Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DSX4

Protein Details
Accession C5DSX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-249PEKRSHEDHSSEKKKKKKKKDKKKDLNABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-111KPTAAKKKAERDPNAPK
232-246SEKKKKKKKKDKKKD
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 11, cyto 3, mito 2.5, cyto_pero 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG zro:ZYRO0C03718g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MTNDPGLRLKLAKDSLVSSLFELSKCADHTASSLVEFYNAIGDDEEEKIEAFTTLTEALQKLAGASNQINGISGDLINPVEDEKDALIGAPSPGKPTAAKKKAERDPNAPKKPLTVFFAYSAFVRQELRDQRQRAGLPPLSSTEITQEISKKWKELSDAEKEKWKQAYSVELEHYQMEKQKYLEAKKNGTAPSSSDGPSHAPIPIPFNLQHEDIPEPQPPVPEKRSHEDHSSEKKKKKKKKDKKKDLNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.29
4 0.28
5 0.21
6 0.23
7 0.22
8 0.2
9 0.2
10 0.17
11 0.18
12 0.19
13 0.2
14 0.16
15 0.15
16 0.17
17 0.19
18 0.18
19 0.16
20 0.15
21 0.12
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.06
39 0.05
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.09
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.1
58 0.1
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.11
82 0.12
83 0.2
84 0.3
85 0.34
86 0.4
87 0.44
88 0.53
89 0.59
90 0.67
91 0.64
92 0.62
93 0.66
94 0.72
95 0.73
96 0.66
97 0.59
98 0.53
99 0.51
100 0.45
101 0.37
102 0.29
103 0.24
104 0.23
105 0.24
106 0.21
107 0.17
108 0.16
109 0.12
110 0.1
111 0.09
112 0.08
113 0.14
114 0.19
115 0.25
116 0.31
117 0.33
118 0.34
119 0.39
120 0.39
121 0.35
122 0.36
123 0.33
124 0.26
125 0.25
126 0.25
127 0.23
128 0.22
129 0.2
130 0.15
131 0.14
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.19
140 0.2
141 0.22
142 0.26
143 0.3
144 0.34
145 0.39
146 0.4
147 0.47
148 0.46
149 0.47
150 0.45
151 0.4
152 0.31
153 0.27
154 0.33
155 0.28
156 0.3
157 0.29
158 0.26
159 0.27
160 0.26
161 0.26
162 0.2
163 0.21
164 0.2
165 0.19
166 0.19
167 0.22
168 0.28
169 0.33
170 0.4
171 0.41
172 0.44
173 0.46
174 0.51
175 0.48
176 0.43
177 0.38
178 0.32
179 0.3
180 0.28
181 0.25
182 0.2
183 0.2
184 0.21
185 0.22
186 0.2
187 0.17
188 0.15
189 0.16
190 0.2
191 0.2
192 0.21
193 0.21
194 0.23
195 0.25
196 0.25
197 0.25
198 0.23
199 0.25
200 0.24
201 0.26
202 0.25
203 0.25
204 0.25
205 0.29
206 0.3
207 0.34
208 0.36
209 0.41
210 0.44
211 0.49
212 0.56
213 0.56
214 0.59
215 0.57
216 0.62
217 0.65
218 0.7
219 0.72
220 0.73
221 0.78
222 0.82
223 0.86
224 0.88
225 0.89
226 0.89
227 0.92
228 0.95
229 0.96