Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QVT4

Protein Details
Accession C4QVT4    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MPVPVNSSLKKRKSERKAEAVRPSKIFHydrophilic
235-255VLYNIKKGKRFRKIRTGIISKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-18KKRKSERKA
241-247KGKRFRK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 6.5, cyto_mito 5.5, plas 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR007319  SSU_processome_Utp21  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ppa:PAS_chr1-1_0004  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04192  Utp21  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MPVPVNSSLKKRKSERKAEAVRPSKIFSPFRVLGKVSNEIPFAIGTLGHTFYIVTSVDRAFQIYDANTLHLLFVSNTQTPSKINALAAHFHYVYAAWDNKIGIYRRGILEHVLSCETENFIQQILVFGDFVICTTFTSNEIFVFKKKDSKDSYATEFYTRLSVNSLQGKIVGIVHPATYLNKIVVATTNSLLVFNIKTGKLLFTSSDFNEFNITSIETVPVLDLIAFGTSDGQVVLYNIKKGKRFRKIRTGIISKVTSVSFRTDGAPHFVASFVNGDLFFYDLEHKARVHILQTVHKEDHGGVSKAAFLNGQPIFVTNGGDNMLKEYAFDPNLSTTNSSIVPAPHYLRSRGGHSAPPTTVQFADPNSHFMLSASKDRSLWMFSLRKDAQAQEMSQRPPKKSANNKRIGVIPSMKDKLPEIVCLAQSNSKEGDWENTITGHAGETIARTWDTYNRRLGRWDLPTTDGGQVKSVAISACGNFGFVGSSSGGIGVYNMQSGIQRKLYRLHKKAVTGVAVDSMNRKMVSCGLDGIVGFYDFNESKYLGKLQLDAPITQLVYHHSSDLVALVLDDLSIVVVDSVTQKVVRVLLGHTNRITALDFTPNGRWIISSALDNTIRTWDLPTGSCIDGIFVPSTVTSLKMSPTGDTLATTHVNSVGIALWTNRAMFHAVSSRHVEESEFSKIMLPNTTNDTQTTIIEGAFDENTVDDNEITGVYNTVDQINEKLVTLGIGPRSKFNTLLHLDVIKQRNKPTEAPKKPENVPFFLELKGEKVGDRAIESEGKLDPNGTATQESGTEAQSQLNSLRGDNRMTFENEFTKNLRLSSETKEYAEFLKYVHSLSPSQVDLEIRSLDITESVKEVSCFIEALTQGLENNDNFDLIQAYMSMLMKCHGDIIFDSSDEELKTALRGWESINESKKANMDSLVKYCSGVINFFHTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.85
3 0.86
4 0.89
5 0.89
6 0.9
7 0.88
8 0.84
9 0.76
10 0.7
11 0.65
12 0.63
13 0.57
14 0.5
15 0.51
16 0.49
17 0.5
18 0.51
19 0.47
20 0.43
21 0.45
22 0.46
23 0.4
24 0.38
25 0.35
26 0.3
27 0.29
28 0.24
29 0.19
30 0.14
31 0.11
32 0.1
33 0.12
34 0.13
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.11
39 0.13
40 0.12
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.14
45 0.15
46 0.16
47 0.14
48 0.14
49 0.17
50 0.15
51 0.19
52 0.17
53 0.18
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.13
58 0.14
59 0.1
60 0.13
61 0.16
62 0.18
63 0.2
64 0.21
65 0.22
66 0.22
67 0.26
68 0.26
69 0.24
70 0.23
71 0.27
72 0.28
73 0.32
74 0.33
75 0.33
76 0.29
77 0.27
78 0.25
79 0.2
80 0.19
81 0.2
82 0.2
83 0.15
84 0.17
85 0.17
86 0.19
87 0.25
88 0.25
89 0.23
90 0.25
91 0.28
92 0.29
93 0.31
94 0.3
95 0.26
96 0.28
97 0.27
98 0.26
99 0.23
100 0.21
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.16
105 0.15
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.13
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.16
128 0.17
129 0.19
130 0.23
131 0.24
132 0.3
133 0.32
134 0.39
135 0.44
136 0.49
137 0.53
138 0.53
139 0.58
140 0.55
141 0.54
142 0.47
143 0.41
144 0.35
145 0.31
146 0.26
147 0.2
148 0.19
149 0.19
150 0.22
151 0.29
152 0.29
153 0.25
154 0.25
155 0.25
156 0.22
157 0.22
158 0.17
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.14
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.17
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.13
180 0.11
181 0.11
182 0.14
183 0.12
184 0.14
185 0.14
186 0.16
187 0.15
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.18
192 0.18
193 0.23
194 0.22
195 0.21
196 0.23
197 0.21
198 0.19
199 0.17
200 0.16
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.1
223 0.1
224 0.14
225 0.18
226 0.22
227 0.28
228 0.36
229 0.46
230 0.53
231 0.61
232 0.66
233 0.74
234 0.77
235 0.8
236 0.82
237 0.78
238 0.71
239 0.68
240 0.6
241 0.49
242 0.45
243 0.36
244 0.27
245 0.22
246 0.21
247 0.16
248 0.16
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.22
253 0.22
254 0.18
255 0.17
256 0.17
257 0.15
258 0.13
259 0.13
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.15
275 0.16
276 0.14
277 0.17
278 0.19
279 0.24
280 0.29
281 0.33
282 0.31
283 0.3
284 0.3
285 0.26
286 0.28
287 0.26
288 0.22
289 0.17
290 0.17
291 0.19
292 0.19
293 0.18
294 0.13
295 0.08
296 0.14
297 0.14
298 0.14
299 0.12
300 0.12
301 0.14
302 0.14
303 0.15
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.1
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.11
327 0.1
328 0.12
329 0.14
330 0.15
331 0.19
332 0.2
333 0.21
334 0.25
335 0.26
336 0.28
337 0.29
338 0.29
339 0.29
340 0.29
341 0.31
342 0.27
343 0.27
344 0.25
345 0.22
346 0.2
347 0.17
348 0.16
349 0.14
350 0.18
351 0.15
352 0.17
353 0.16
354 0.16
355 0.15
356 0.14
357 0.16
358 0.14
359 0.19
360 0.19
361 0.19
362 0.19
363 0.19
364 0.2
365 0.19
366 0.17
367 0.18
368 0.2
369 0.2
370 0.29
371 0.29
372 0.3
373 0.3
374 0.3
375 0.28
376 0.26
377 0.26
378 0.22
379 0.27
380 0.27
381 0.32
382 0.36
383 0.32
384 0.37
385 0.41
386 0.45
387 0.51
388 0.6
389 0.64
390 0.69
391 0.69
392 0.64
393 0.64
394 0.56
395 0.49
396 0.42
397 0.33
398 0.3
399 0.31
400 0.29
401 0.25
402 0.23
403 0.24
404 0.2
405 0.19
406 0.16
407 0.16
408 0.17
409 0.17
410 0.17
411 0.15
412 0.15
413 0.15
414 0.14
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.13
419 0.12
420 0.13
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.1
426 0.07
427 0.05
428 0.05
429 0.04
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.13
437 0.17
438 0.2
439 0.28
440 0.29
441 0.3
442 0.32
443 0.34
444 0.34
445 0.35
446 0.34
447 0.28
448 0.28
449 0.28
450 0.27
451 0.28
452 0.23
453 0.18
454 0.16
455 0.15
456 0.13
457 0.12
458 0.11
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.06
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.06
484 0.08
485 0.11
486 0.15
487 0.16
488 0.17
489 0.25
490 0.34
491 0.43
492 0.45
493 0.49
494 0.48
495 0.49
496 0.52
497 0.47
498 0.39
499 0.3
500 0.25
501 0.21
502 0.18
503 0.16
504 0.13
505 0.11
506 0.11
507 0.1
508 0.1
509 0.08
510 0.11
511 0.13
512 0.12
513 0.12
514 0.1
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.08
519 0.06
520 0.05
521 0.05
522 0.07
523 0.07
524 0.08
525 0.08
526 0.09
527 0.09
528 0.11
529 0.13
530 0.11
531 0.12
532 0.13
533 0.13
534 0.18
535 0.19
536 0.17
537 0.17
538 0.16
539 0.16
540 0.14
541 0.13
542 0.11
543 0.12
544 0.13
545 0.12
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.08
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.02
558 0.02
559 0.02
560 0.02
561 0.02
562 0.02
563 0.03
564 0.04
565 0.04
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.07
570 0.07
571 0.08
572 0.07
573 0.09
574 0.16
575 0.19
576 0.21
577 0.21
578 0.21
579 0.2
580 0.2
581 0.19
582 0.12
583 0.11
584 0.12
585 0.13
586 0.14
587 0.16
588 0.17
589 0.16
590 0.15
591 0.14
592 0.11
593 0.13
594 0.12
595 0.11
596 0.11
597 0.14
598 0.15
599 0.15
600 0.15
601 0.14
602 0.14
603 0.13
604 0.13
605 0.11
606 0.12
607 0.12
608 0.13
609 0.15
610 0.15
611 0.15
612 0.13
613 0.12
614 0.11
615 0.12
616 0.1
617 0.07
618 0.07
619 0.06
620 0.08
621 0.07
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.09
626 0.11
627 0.12
628 0.12
629 0.13
630 0.13
631 0.13
632 0.13
633 0.12
634 0.13
635 0.13
636 0.13
637 0.12
638 0.11
639 0.11
640 0.1
641 0.1
642 0.08
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.09
652 0.09
653 0.11
654 0.16
655 0.16
656 0.19
657 0.23
658 0.24
659 0.23
660 0.23
661 0.21
662 0.17
663 0.2
664 0.22
665 0.18
666 0.16
667 0.19
668 0.2
669 0.21
670 0.23
671 0.2
672 0.17
673 0.23
674 0.25
675 0.22
676 0.21
677 0.23
678 0.2
679 0.19
680 0.2
681 0.14
682 0.12
683 0.11
684 0.11
685 0.1
686 0.09
687 0.09
688 0.06
689 0.06
690 0.07
691 0.07
692 0.08
693 0.06
694 0.06
695 0.07
696 0.07
697 0.07
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.07
702 0.07
703 0.08
704 0.08
705 0.08
706 0.09
707 0.11
708 0.11
709 0.11
710 0.11
711 0.1
712 0.1
713 0.1
714 0.12
715 0.14
716 0.18
717 0.18
718 0.21
719 0.25
720 0.26
721 0.28
722 0.26
723 0.3
724 0.29
725 0.31
726 0.29
727 0.27
728 0.27
729 0.32
730 0.38
731 0.35
732 0.36
733 0.39
734 0.44
735 0.47
736 0.52
737 0.56
738 0.6
739 0.64
740 0.67
741 0.69
742 0.68
743 0.7
744 0.72
745 0.66
746 0.59
747 0.53
748 0.5
749 0.44
750 0.39
751 0.34
752 0.26
753 0.24
754 0.22
755 0.19
756 0.15
757 0.15
758 0.15
759 0.15
760 0.15
761 0.14
762 0.15
763 0.17
764 0.17
765 0.18
766 0.18
767 0.18
768 0.17
769 0.16
770 0.13
771 0.13
772 0.14
773 0.14
774 0.13
775 0.13
776 0.13
777 0.13
778 0.15
779 0.13
780 0.13
781 0.14
782 0.13
783 0.15
784 0.14
785 0.15
786 0.14
787 0.18
788 0.18
789 0.17
790 0.21
791 0.22
792 0.25
793 0.26
794 0.27
795 0.26
796 0.29
797 0.3
798 0.29
799 0.33
800 0.31
801 0.32
802 0.32
803 0.33
804 0.31
805 0.3
806 0.28
807 0.26
808 0.27
809 0.31
810 0.37
811 0.35
812 0.34
813 0.35
814 0.35
815 0.33
816 0.32
817 0.25
818 0.17
819 0.2
820 0.19
821 0.19
822 0.2
823 0.2
824 0.19
825 0.21
826 0.25
827 0.21
828 0.21
829 0.22
830 0.21
831 0.19
832 0.21
833 0.19
834 0.15
835 0.15
836 0.14
837 0.12
838 0.13
839 0.13
840 0.11
841 0.12
842 0.13
843 0.14
844 0.14
845 0.14
846 0.13
847 0.13
848 0.12
849 0.1
850 0.14
851 0.13
852 0.14
853 0.14
854 0.13
855 0.13
856 0.14
857 0.17
858 0.12
859 0.15
860 0.14
861 0.14
862 0.13
863 0.13
864 0.13
865 0.1
866 0.11
867 0.07
868 0.08
869 0.1
870 0.12
871 0.12
872 0.11
873 0.12
874 0.12
875 0.12
876 0.15
877 0.12
878 0.12
879 0.13
880 0.18
881 0.19
882 0.18
883 0.19
884 0.17
885 0.19
886 0.17
887 0.16
888 0.11
889 0.1
890 0.11
891 0.13
892 0.15
893 0.14
894 0.15
895 0.17
896 0.24
897 0.3
898 0.36
899 0.4
900 0.4
901 0.39
902 0.41
903 0.44
904 0.38
905 0.34
906 0.32
907 0.32
908 0.35
909 0.39
910 0.39
911 0.35
912 0.33
913 0.32
914 0.31
915 0.27
916 0.23
917 0.2