Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DSW6

Protein Details
Accession C5DSW6    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-147MIPGRHRTAKRNKQQLRNMTFRHydrophilic
387-419DQRIDWIKEMKRKRKDALRQLAKKKSKNGVNILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
396-413MKRKRKDALRQLAKKKSK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG zro:ZYRO0C03542g  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAVQKRIYVGNLNNDLEGCLQALEMRFSKFGKCTSEFEVRGNFAYIDMEFEDDSRFTKLKSSFNHVKFKGNDLIVDAARPRWQWEEQKKKDDEEEPIKRKQIIKRHWEYYKKMENIGMSWEDRIQMIPGRHRTAKRNKQQLRNMTFRVDVNGSLKVYKCYKQKLWGYERDKEAQDLVHKFVNGKWRNGWDHIVDRLNYTRSKGVSAGEPIMKAGQEGEEEEEEEDNGERERTDKVLEDMFKSFDFDKPMVDDEAIPEKSDNELPADEDEHEHEIEVEHESKDEDEPIPVFGEDNQTKTLRNLFDPQENQPFKLITESDDDIDHDKDAEQEEVVAEPELVKQEYSAPRKTAALFFPHFDSPFLSGQTQLNKLPAFQPDWQLWQDQFWDQRIDWIKEMKRKRKDALRQLAKKKSKNGVNILV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.3
4 0.26
5 0.16
6 0.1
7 0.08
8 0.1
9 0.11
10 0.14
11 0.16
12 0.17
13 0.19
14 0.2
15 0.25
16 0.26
17 0.29
18 0.33
19 0.35
20 0.37
21 0.41
22 0.49
23 0.46
24 0.47
25 0.48
26 0.42
27 0.39
28 0.37
29 0.3
30 0.21
31 0.21
32 0.17
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.11
37 0.11
38 0.13
39 0.11
40 0.13
41 0.14
42 0.14
43 0.13
44 0.21
45 0.25
46 0.31
47 0.36
48 0.44
49 0.5
50 0.57
51 0.67
52 0.61
53 0.65
54 0.6
55 0.61
56 0.59
57 0.49
58 0.42
59 0.34
60 0.37
61 0.28
62 0.28
63 0.23
64 0.17
65 0.2
66 0.19
67 0.2
68 0.21
69 0.27
70 0.35
71 0.46
72 0.55
73 0.6
74 0.7
75 0.69
76 0.68
77 0.67
78 0.61
79 0.59
80 0.58
81 0.61
82 0.57
83 0.59
84 0.6
85 0.58
86 0.6
87 0.59
88 0.59
89 0.58
90 0.63
91 0.65
92 0.7
93 0.75
94 0.76
95 0.74
96 0.74
97 0.74
98 0.65
99 0.59
100 0.54
101 0.46
102 0.39
103 0.37
104 0.3
105 0.21
106 0.2
107 0.18
108 0.16
109 0.15
110 0.15
111 0.12
112 0.13
113 0.16
114 0.22
115 0.27
116 0.32
117 0.38
118 0.42
119 0.5
120 0.57
121 0.65
122 0.67
123 0.72
124 0.76
125 0.8
126 0.84
127 0.85
128 0.81
129 0.78
130 0.7
131 0.62
132 0.55
133 0.46
134 0.4
135 0.31
136 0.25
137 0.19
138 0.2
139 0.18
140 0.17
141 0.18
142 0.18
143 0.2
144 0.25
145 0.29
146 0.33
147 0.36
148 0.43
149 0.49
150 0.54
151 0.59
152 0.63
153 0.63
154 0.62
155 0.62
156 0.57
157 0.52
158 0.43
159 0.36
160 0.28
161 0.28
162 0.24
163 0.22
164 0.19
165 0.19
166 0.19
167 0.2
168 0.29
169 0.26
170 0.26
171 0.27
172 0.31
173 0.34
174 0.35
175 0.36
176 0.28
177 0.28
178 0.29
179 0.29
180 0.24
181 0.23
182 0.22
183 0.23
184 0.2
185 0.2
186 0.19
187 0.16
188 0.17
189 0.17
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.15
195 0.14
196 0.13
197 0.12
198 0.11
199 0.09
200 0.07
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.14
223 0.15
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.17
229 0.16
230 0.14
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.14
235 0.16
236 0.15
237 0.14
238 0.12
239 0.11
240 0.17
241 0.17
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.15
246 0.16
247 0.14
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.12
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.17
279 0.16
280 0.18
281 0.2
282 0.2
283 0.21
284 0.22
285 0.27
286 0.21
287 0.23
288 0.27
289 0.28
290 0.35
291 0.37
292 0.41
293 0.45
294 0.45
295 0.43
296 0.39
297 0.36
298 0.28
299 0.29
300 0.24
301 0.16
302 0.19
303 0.2
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.18
308 0.18
309 0.16
310 0.12
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.12
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.08
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.16
329 0.25
330 0.31
331 0.34
332 0.34
333 0.35
334 0.38
335 0.4
336 0.38
337 0.33
338 0.35
339 0.32
340 0.32
341 0.34
342 0.35
343 0.33
344 0.29
345 0.27
346 0.23
347 0.23
348 0.24
349 0.2
350 0.2
351 0.23
352 0.28
353 0.29
354 0.27
355 0.29
356 0.27
357 0.28
358 0.29
359 0.3
360 0.29
361 0.29
362 0.33
363 0.31
364 0.36
365 0.36
366 0.36
367 0.31
368 0.29
369 0.29
370 0.29
371 0.31
372 0.29
373 0.32
374 0.28
375 0.36
376 0.41
377 0.42
378 0.41
379 0.45
380 0.49
381 0.54
382 0.65
383 0.67
384 0.7
385 0.74
386 0.8
387 0.81
388 0.85
389 0.87
390 0.88
391 0.89
392 0.89
393 0.91
394 0.92
395 0.91
396 0.88
397 0.86
398 0.85
399 0.82
400 0.81