Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DPR4

Protein Details
Accession C5DPR4    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-67VEDKKIRKRFEKGLKFHEKGBasic
187-214KVYLTKSEQKRIRRNRRKLQREEHETRIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-60KIRKRFEKG
196-207KRIRRNRRKLQR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013881  Pre-mRNA_splic_Prp3_dom  
IPR027104  Prp3  
IPR010541  Prp3_C  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG zro:ZYRO0A05456g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06544  DUF1115  
PF08572  PRP3  
Amino Acid Sequences MPAKKDDSAKGRNRGLQTEINPLLLSSNPNLIRRQYRGQNPYLSTYGVEDKKIRKRFEKGLKFHEKGEISANIERERELLKAEKEQELKRREFEAQRREEVRKKVECGELPDTSIGEEKFAPREVPIVEWWDKPFLDDQLNILSKYTADTIAADDEESEDEDDERPSIRYVEHPVPIKADSSRPVAKVYLTKSEQKRIRRNRRKLQREEHETRIKMGLEPKLEPKVSLRNMMSVYENNQNITDPTAWESTVRQQVASRKRKHEEMNAARHEEAQQNKKAKNETITPGDHCKVFRFQNLSNPRIRFKLKTNAQQLSLKGLCLRVGENGSGIIVIVGSEKSCKFYDKLVTRRIHWDETFENKETHETADMSGNHAEKVWEGEWEGPSWGPFFMKICQDRQEMEELLRQRNAEHLITSINGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.63
3 0.6
4 0.54
5 0.55
6 0.49
7 0.43
8 0.39
9 0.34
10 0.3
11 0.23
12 0.23
13 0.15
14 0.22
15 0.25
16 0.28
17 0.31
18 0.36
19 0.42
20 0.45
21 0.52
22 0.53
23 0.59
24 0.64
25 0.67
26 0.69
27 0.65
28 0.64
29 0.57
30 0.48
31 0.39
32 0.34
33 0.36
34 0.3
35 0.3
36 0.31
37 0.38
38 0.47
39 0.55
40 0.58
41 0.58
42 0.64
43 0.71
44 0.76
45 0.78
46 0.76
47 0.79
48 0.83
49 0.77
50 0.71
51 0.69
52 0.59
53 0.49
54 0.47
55 0.4
56 0.34
57 0.35
58 0.36
59 0.3
60 0.3
61 0.28
62 0.25
63 0.22
64 0.18
65 0.18
66 0.21
67 0.21
68 0.27
69 0.31
70 0.35
71 0.4
72 0.45
73 0.5
74 0.52
75 0.53
76 0.49
77 0.49
78 0.5
79 0.53
80 0.57
81 0.58
82 0.57
83 0.61
84 0.63
85 0.66
86 0.67
87 0.66
88 0.65
89 0.6
90 0.58
91 0.56
92 0.57
93 0.53
94 0.52
95 0.5
96 0.42
97 0.38
98 0.35
99 0.29
100 0.23
101 0.23
102 0.16
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.12
110 0.15
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.19
115 0.2
116 0.22
117 0.23
118 0.23
119 0.22
120 0.21
121 0.21
122 0.18
123 0.18
124 0.16
125 0.16
126 0.2
127 0.22
128 0.21
129 0.2
130 0.17
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.16
158 0.2
159 0.23
160 0.25
161 0.25
162 0.26
163 0.26
164 0.25
165 0.2
166 0.18
167 0.17
168 0.2
169 0.23
170 0.21
171 0.22
172 0.22
173 0.22
174 0.24
175 0.23
176 0.26
177 0.25
178 0.32
179 0.33
180 0.42
181 0.46
182 0.51
183 0.59
184 0.63
185 0.72
186 0.76
187 0.83
188 0.85
189 0.9
190 0.91
191 0.9
192 0.89
193 0.88
194 0.86
195 0.81
196 0.79
197 0.76
198 0.65
199 0.57
200 0.49
201 0.39
202 0.32
203 0.3
204 0.26
205 0.2
206 0.21
207 0.23
208 0.25
209 0.25
210 0.23
211 0.21
212 0.26
213 0.25
214 0.29
215 0.26
216 0.25
217 0.26
218 0.27
219 0.26
220 0.19
221 0.2
222 0.2
223 0.2
224 0.18
225 0.17
226 0.17
227 0.15
228 0.16
229 0.14
230 0.09
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.16
237 0.21
238 0.2
239 0.18
240 0.21
241 0.29
242 0.39
243 0.48
244 0.5
245 0.52
246 0.56
247 0.62
248 0.64
249 0.64
250 0.65
251 0.64
252 0.66
253 0.63
254 0.61
255 0.55
256 0.51
257 0.44
258 0.39
259 0.36
260 0.33
261 0.36
262 0.4
263 0.42
264 0.45
265 0.46
266 0.44
267 0.42
268 0.41
269 0.4
270 0.39
271 0.4
272 0.39
273 0.41
274 0.39
275 0.36
276 0.31
277 0.29
278 0.29
279 0.29
280 0.31
281 0.31
282 0.31
283 0.4
284 0.47
285 0.48
286 0.49
287 0.5
288 0.47
289 0.46
290 0.49
291 0.43
292 0.42
293 0.48
294 0.49
295 0.56
296 0.62
297 0.6
298 0.61
299 0.61
300 0.55
301 0.52
302 0.44
303 0.35
304 0.28
305 0.25
306 0.23
307 0.19
308 0.2
309 0.15
310 0.16
311 0.16
312 0.15
313 0.14
314 0.12
315 0.11
316 0.1
317 0.06
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.08
324 0.08
325 0.12
326 0.13
327 0.16
328 0.17
329 0.22
330 0.32
331 0.39
332 0.47
333 0.52
334 0.55
335 0.55
336 0.63
337 0.63
338 0.6
339 0.51
340 0.49
341 0.45
342 0.5
343 0.52
344 0.45
345 0.41
346 0.34
347 0.37
348 0.32
349 0.29
350 0.23
351 0.19
352 0.18
353 0.24
354 0.24
355 0.24
356 0.26
357 0.25
358 0.22
359 0.22
360 0.2
361 0.14
362 0.19
363 0.16
364 0.14
365 0.14
366 0.19
367 0.19
368 0.2
369 0.21
370 0.16
371 0.17
372 0.16
373 0.16
374 0.12
375 0.13
376 0.14
377 0.17
378 0.26
379 0.29
380 0.33
381 0.39
382 0.42
383 0.42
384 0.43
385 0.44
386 0.37
387 0.35
388 0.37
389 0.35
390 0.37
391 0.38
392 0.35
393 0.3
394 0.34
395 0.36
396 0.31
397 0.27
398 0.23
399 0.23