Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DNV4

Protein Details
Accession C5DNV4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-204TTIKSKWHVKRVTAREDRKRRKELWYRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
186-198KRVTAREDRKRRK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 13.833, mito 11.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024388  Ribosomal_L20_mt  
KEGG zro:ZYRO0A11792g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12824  MRP-L20  
Amino Acid Sequences MQCFVRRIHNSSFQLKNLSKIINNSKKTPELKGASTIYNAKSSASNYKGYMRAKVPAGLYFNRAPSSPTGSINSETIPSSFLPSNDPRKQLVQEIASKDVLSKPDAPPVLPSRSSLQGKSYHLNPEQIEQIRRLRLEDPAKNTRKSLASQYNVSPLFISMVSEPPKEWKQEMDSRLTTIKSKWHVKRVTAREDRKRRKELWYRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.54
3 0.51
4 0.46
5 0.44
6 0.39
7 0.42
8 0.5
9 0.51
10 0.54
11 0.54
12 0.55
13 0.59
14 0.59
15 0.56
16 0.54
17 0.49
18 0.47
19 0.49
20 0.45
21 0.39
22 0.39
23 0.39
24 0.31
25 0.29
26 0.27
27 0.22
28 0.21
29 0.22
30 0.27
31 0.26
32 0.27
33 0.26
34 0.3
35 0.36
36 0.35
37 0.38
38 0.32
39 0.33
40 0.32
41 0.33
42 0.3
43 0.27
44 0.3
45 0.26
46 0.28
47 0.26
48 0.26
49 0.23
50 0.22
51 0.2
52 0.18
53 0.24
54 0.21
55 0.21
56 0.22
57 0.23
58 0.25
59 0.24
60 0.22
61 0.16
62 0.15
63 0.13
64 0.11
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.15
70 0.2
71 0.29
72 0.31
73 0.34
74 0.32
75 0.34
76 0.35
77 0.33
78 0.32
79 0.27
80 0.27
81 0.27
82 0.28
83 0.25
84 0.24
85 0.21
86 0.19
87 0.16
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.17
92 0.18
93 0.17
94 0.19
95 0.22
96 0.23
97 0.21
98 0.22
99 0.2
100 0.26
101 0.28
102 0.25
103 0.24
104 0.26
105 0.28
106 0.29
107 0.29
108 0.29
109 0.29
110 0.32
111 0.29
112 0.26
113 0.29
114 0.3
115 0.28
116 0.25
117 0.28
118 0.27
119 0.27
120 0.27
121 0.23
122 0.27
123 0.34
124 0.36
125 0.39
126 0.47
127 0.52
128 0.51
129 0.51
130 0.47
131 0.42
132 0.39
133 0.41
134 0.4
135 0.39
136 0.4
137 0.41
138 0.44
139 0.42
140 0.39
141 0.3
142 0.21
143 0.19
144 0.16
145 0.15
146 0.09
147 0.14
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.22
152 0.26
153 0.28
154 0.28
155 0.27
156 0.31
157 0.39
158 0.42
159 0.44
160 0.42
161 0.42
162 0.43
163 0.41
164 0.36
165 0.3
166 0.34
167 0.34
168 0.43
169 0.48
170 0.55
171 0.6
172 0.65
173 0.74
174 0.75
175 0.78
176 0.78
177 0.81
178 0.82
179 0.87
180 0.9
181 0.89
182 0.89
183 0.83
184 0.83