FuNGI

C5DXW4

Protein Details

Accession

C5DXW4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
539-560	EEIEHQKKKDKKHGVVKQAKVI	Basic
630-657	IENASVLKRRRERVKQAREPSNKRDEKG	Hydrophilic
695-714	LSDDTKRLIGIKRKKRHNKK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
545-552	KKKDKKHG
637-652	KRRRERVKQAREPSNK
702-714	LIGIKRKKRHNKK

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034809 Nop4_RRM4 IPR034808 Nop4p_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	zro:ZYRO0F08294g -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12676 RRM3_Nop4p cd12677 RRM4_Nop4p

Amino Acid Sequences

MSSEAEAGVNKKTNGVVAAQDGDVDMKTLFVRSIPPNTTDEDLSVFFSNFAPIKHAVLVKDKNQKSRGFGFVSFAVEDDTMEALKQARRTKLNGHQVRVDLAKRRHRSGKNDEGAQHQQQAAEVHIARHNEGDHEDDDEDALLKGKPKIIIRNMPWSCRDPEKLKSIFGKYGLVVEATIPRKPNGQLRGFAFVTMKKISNCKKAIEDSKNLKIDGRPVAVDFAVQKNFWEDFKNKQEEAEDEQESEAESEESGESESEEQNENSDDKSDNAEVELSSDEEVNEEEEEEEEEEEEEAKTPRKPLNRTEEYSVFVKNVPYDATEESLAEHFEKFGPVKYALPVIDRETGLARGTAFIAFRNKQSYDYCLKNAPAAGATSLLIGDDVLPEYVYEGRVLSILPTLKREQADFMAEKNANKRKEALGKAPGEKDRRSLYLLNEGKVLEGSKLAALLSEKDMEVRNASYNLRVEQLKKNPSLHLSLTRLAIRNLPRSMNDKALKALARKAVVQFAAEVKSGVRHPLSKEEIVRSTKEKYRHMTDEEIEHQKKKDKKHGVVKQAKVINEVKGSSKGRSRGYGFVEFKDHKHALMGLRWMNVHQVTKGEILEGLNEEERKYADLDQKASRRLCVEFAIENASVLKRRRERVKQAREPSNKRDEKGNLIKDTNSNQDTSSTQDTKSSNDDNKSSQKRNRTDSGLSDDTKRLIGIKRKKRHNKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.23
3	0.2
4	0.19
5	0.21
6	0.19
7	0.18
8	0.16
9	0.16
10	0.14
11	0.12
12	0.09
13	0.08
14	0.08
15	0.09
16	0.09
17	0.09
18	0.15
19	0.19
20	0.27
21	0.29
22	0.32
23	0.33
24	0.36
25	0.38
26	0.33
27	0.29
28	0.24
29	0.22
30	0.22
31	0.21
32	0.18
33	0.16
34	0.16
35	0.19
36	0.17
37	0.16
38	0.18
39	0.18
40	0.2
41	0.23
42	0.25
43	0.24
44	0.32
45	0.38
46	0.42
47	0.51
48	0.55
49	0.59
50	0.63
51	0.65
52	0.62
53	0.62
54	0.6
55	0.54
56	0.5
57	0.45
58	0.41
59	0.39
60	0.33
61	0.27
62	0.22
63	0.17
64	0.16
65	0.13
66	0.11
67	0.08
68	0.08
69	0.09
70	0.11
71	0.14
72	0.2
73	0.26
74	0.32
75	0.37
76	0.41
77	0.49
78	0.56
79	0.64
80	0.65
81	0.63
82	0.61
83	0.58
84	0.58
85	0.54
86	0.49
87	0.47
88	0.48
89	0.54
90	0.54
91	0.6
92	0.66
93	0.69
94	0.74
95	0.74
96	0.77
97	0.74
98	0.75
99	0.7
100	0.67
101	0.67
102	0.6
103	0.54
104	0.44
105	0.37
106	0.32
107	0.31
108	0.24
109	0.23
110	0.2
111	0.19
112	0.21
113	0.22
114	0.21
115	0.21
116	0.21
117	0.17
118	0.18
119	0.19
120	0.16
121	0.18
122	0.17
123	0.16
124	0.15
125	0.13
126	0.13
127	0.09
128	0.1
129	0.08
130	0.11
131	0.13
132	0.16
133	0.2
134	0.24
135	0.32
136	0.39
137	0.47
138	0.48
139	0.58
140	0.58
141	0.57
142	0.57
143	0.53
144	0.48
145	0.45
146	0.48
147	0.41
148	0.44
149	0.49
150	0.47
151	0.48
152	0.5
153	0.48
154	0.45
155	0.42
156	0.38
157	0.29
158	0.29
159	0.25
160	0.19
161	0.14
162	0.12
163	0.17
164	0.17
165	0.19
166	0.18
167	0.19
168	0.22
169	0.25
170	0.31
171	0.33
172	0.36
173	0.38
174	0.4
175	0.46
176	0.42
177	0.4
178	0.35
179	0.28
180	0.27
181	0.25
182	0.25
183	0.2
184	0.28
185	0.34
186	0.41
187	0.42
188	0.41
189	0.44
190	0.49
191	0.57
192	0.55
193	0.57
194	0.55
195	0.6
196	0.6
197	0.55
198	0.5
199	0.41
200	0.4
201	0.36
202	0.31
203	0.23
204	0.21
205	0.22
206	0.2
207	0.2
208	0.16
209	0.15
210	0.15
211	0.14
212	0.14
213	0.16
214	0.17
215	0.17
216	0.2
217	0.18
218	0.24
219	0.33
220	0.39
221	0.35
222	0.35
223	0.36
224	0.34
225	0.39
226	0.36
227	0.28
228	0.23
229	0.23
230	0.21
231	0.2
232	0.17
233	0.11
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.05
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.12
249	0.12
250	0.1
251	0.12
252	0.1
253	0.1
254	0.13
255	0.12
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.09
260	0.1
261	0.09
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.06
278	0.05
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.09
284	0.1
285	0.13
286	0.18
287	0.24
288	0.28
289	0.35
290	0.44
291	0.49
292	0.51
293	0.53
294	0.5
295	0.46
296	0.43
297	0.36
298	0.26
299	0.2
300	0.18
301	0.13
302	0.12
303	0.09
304	0.09
305	0.1
306	0.1
307	0.11
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.08
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.11
321	0.11
322	0.12
323	0.12
324	0.14
325	0.13
326	0.14
327	0.14
328	0.14
329	0.15
330	0.14
331	0.14
332	0.13
333	0.13
334	0.12
335	0.11
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.12
343	0.13
344	0.14
345	0.17
346	0.17
347	0.19
348	0.2
349	0.23
350	0.24
351	0.26
352	0.26
353	0.25
354	0.25
355	0.23
356	0.22
357	0.17
358	0.13
359	0.1
360	0.09
361	0.07
362	0.07
363	0.06
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.04
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.07
384	0.09
385	0.09
386	0.12
387	0.13
388	0.16
389	0.17
390	0.17
391	0.17
392	0.16
393	0.2
394	0.18
395	0.17
396	0.2
397	0.21
398	0.21
399	0.27
400	0.33
401	0.3
402	0.3
403	0.32
404	0.31
405	0.38
406	0.41
407	0.4
408	0.41
409	0.43
410	0.46
411	0.48
412	0.49
413	0.45
414	0.42
415	0.4
416	0.34
417	0.32
418	0.32
419	0.3
420	0.27
421	0.33
422	0.34
423	0.31
424	0.29
425	0.27
426	0.24
427	0.21
428	0.2
429	0.09
430	0.07
431	0.07
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.08
439	0.09
440	0.08
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.12
445	0.11
446	0.12
447	0.13
448	0.14
449	0.16
450	0.16
451	0.17
452	0.18
453	0.19
454	0.21
455	0.27
456	0.35
457	0.38
458	0.41
459	0.42
460	0.41
461	0.42
462	0.42
463	0.37
464	0.35
465	0.32
466	0.3
467	0.31
468	0.31
469	0.3
470	0.27
471	0.29
472	0.27
473	0.3
474	0.31
475	0.3
476	0.29
477	0.33
478	0.35
479	0.38
480	0.37
481	0.31
482	0.3
483	0.33
484	0.33
485	0.31
486	0.33
487	0.28
488	0.27
489	0.28
490	0.28
491	0.27
492	0.25
493	0.23
494	0.19
495	0.17
496	0.18
497	0.16
498	0.14
499	0.11
500	0.13
501	0.13
502	0.15
503	0.15
504	0.16
505	0.19
506	0.26
507	0.31
508	0.32
509	0.35
510	0.36
511	0.41
512	0.41
513	0.41
514	0.37
515	0.38
516	0.39
517	0.43
518	0.45
519	0.45
520	0.49
521	0.52
522	0.53
523	0.52
524	0.49
525	0.48
526	0.48
527	0.51
528	0.46
529	0.44
530	0.42
531	0.44
532	0.48
533	0.5
534	0.55
535	0.56
536	0.63
537	0.71
538	0.77
539	0.81
540	0.85
541	0.81
542	0.78
543	0.72
544	0.64
545	0.58
546	0.52
547	0.44
548	0.37
549	0.34
550	0.29
551	0.32
552	0.34
553	0.32
554	0.35
555	0.37
556	0.38
557	0.43
558	0.44
559	0.43
560	0.46
561	0.52
562	0.48
563	0.44
564	0.49
565	0.45
566	0.42
567	0.45
568	0.39
569	0.29
570	0.29
571	0.3
572	0.26
573	0.28
574	0.33
575	0.27
576	0.29
577	0.29
578	0.28
579	0.29
580	0.28
581	0.26
582	0.2
583	0.19
584	0.2
585	0.22
586	0.21
587	0.17
588	0.15
589	0.14
590	0.14
591	0.14
592	0.14
593	0.15
594	0.15
595	0.15
596	0.15
597	0.15
598	0.15
599	0.16
600	0.19
601	0.24
602	0.28
603	0.32
604	0.39
605	0.45
606	0.51
607	0.5
608	0.47
609	0.42
610	0.39
611	0.37
612	0.32
613	0.3
614	0.24
615	0.25
616	0.27
617	0.24
618	0.22
619	0.21
620	0.2
621	0.22
622	0.24
623	0.32
624	0.34
625	0.43
626	0.53
627	0.62
628	0.71
629	0.77
630	0.85
631	0.86
632	0.89
633	0.92
634	0.92
635	0.9
636	0.88
637	0.88
638	0.82
639	0.73
640	0.72
641	0.66
642	0.66
643	0.68
644	0.67
645	0.63
646	0.59
647	0.6
648	0.56
649	0.57
650	0.55
651	0.46
652	0.39
653	0.33
654	0.33
655	0.31
656	0.32
657	0.35
658	0.29
659	0.28
660	0.32
661	0.33
662	0.34
663	0.39
664	0.42
665	0.4
666	0.44
667	0.47
668	0.48
669	0.58
670	0.63
671	0.67
672	0.66
673	0.7
674	0.72
675	0.76
676	0.77
677	0.73
678	0.7
679	0.67
680	0.68
681	0.64
682	0.58
683	0.55
684	0.49
685	0.44
686	0.39
687	0.32
688	0.28
689	0.3
690	0.38
691	0.44
692	0.53
693	0.61
694	0.72

C5DXW4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer