Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5E414

Protein Details
Accession C5E414    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
380-400FNIFHKQKKSQLSPQRRATPSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG zro:ZYRO0E01914g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09194  PLDc_yTdp1_1  
cd09196  PLDc_yTdp1_2  
Amino Acid Sequences MVSDTRKRVAERWSRVDYRSGAIEPAVKKPKSEVIDLTGSDSDNSDNGDQEEQGPPVKPNYPFKLVKSQIFDKNLKNSHHLIDLRDVLHDPSLRKSFLFSFQYELDFLLEQFHPNVQKIVLVAQEGTVLPPTTPKALSWVGKTHLCEFRMPPFTCHHSKLIINVYQDGSLQLFMPSNNFTYAETNYPQQVCWVSPRLSACASPASSSFQSDLLNYLKSYDLREINRYIIPEVEKFNFEPLEGTEFVYSTPSKDYLSGFQLLAQKLRYKKENGDTSIKHHLSHYLCQSSSVGNSLSRKEPCNLLTHMIIPVLEGIIPKDSKKLPSTSQLLEDYRSHHIVPYLLYPTVQEIVDSPVGWLCSGWFNFNYNKDMAHYNMLRDEFNIFHKQKKSQLSPQRRATPSHSKFYMKSTTRNPNEKPFRELDWCLFTSANLSFSAWGKTSAKPRNYEVGILLKSPDLRCQSFVDLIYNTKLQNDSENTNGTTVAVPWTPDLEPYEKIDETFCISKDYSQLSSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.65
3 0.67
4 0.59
5 0.52
6 0.47
7 0.4
8 0.32
9 0.29
10 0.33
11 0.29
12 0.36
13 0.42
14 0.37
15 0.37
16 0.4
17 0.46
18 0.43
19 0.46
20 0.4
21 0.36
22 0.42
23 0.41
24 0.41
25 0.34
26 0.31
27 0.26
28 0.23
29 0.18
30 0.13
31 0.16
32 0.13
33 0.13
34 0.14
35 0.15
36 0.15
37 0.16
38 0.18
39 0.17
40 0.19
41 0.19
42 0.19
43 0.22
44 0.27
45 0.31
46 0.37
47 0.42
48 0.48
49 0.5
50 0.53
51 0.6
52 0.59
53 0.6
54 0.58
55 0.59
56 0.59
57 0.62
58 0.63
59 0.57
60 0.62
61 0.63
62 0.58
63 0.56
64 0.52
65 0.47
66 0.49
67 0.46
68 0.39
69 0.38
70 0.39
71 0.34
72 0.32
73 0.3
74 0.23
75 0.25
76 0.26
77 0.21
78 0.24
79 0.28
80 0.27
81 0.26
82 0.28
83 0.27
84 0.32
85 0.35
86 0.29
87 0.29
88 0.3
89 0.31
90 0.28
91 0.26
92 0.19
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.18
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.15
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.16
123 0.21
124 0.24
125 0.25
126 0.28
127 0.29
128 0.32
129 0.34
130 0.35
131 0.35
132 0.34
133 0.33
134 0.31
135 0.36
136 0.42
137 0.41
138 0.37
139 0.36
140 0.42
141 0.44
142 0.45
143 0.39
144 0.34
145 0.33
146 0.36
147 0.37
148 0.35
149 0.31
150 0.3
151 0.28
152 0.25
153 0.24
154 0.2
155 0.13
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.13
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.17
172 0.19
173 0.19
174 0.18
175 0.17
176 0.17
177 0.14
178 0.17
179 0.2
180 0.18
181 0.2
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.21
186 0.19
187 0.18
188 0.17
189 0.15
190 0.15
191 0.17
192 0.16
193 0.17
194 0.16
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.15
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.15
207 0.18
208 0.19
209 0.23
210 0.23
211 0.24
212 0.25
213 0.24
214 0.2
215 0.18
216 0.17
217 0.16
218 0.17
219 0.16
220 0.16
221 0.15
222 0.17
223 0.15
224 0.13
225 0.12
226 0.09
227 0.12
228 0.11
229 0.12
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.14
243 0.14
244 0.13
245 0.16
246 0.2
247 0.19
248 0.2
249 0.18
250 0.2
251 0.23
252 0.26
253 0.26
254 0.25
255 0.3
256 0.37
257 0.43
258 0.43
259 0.47
260 0.44
261 0.46
262 0.52
263 0.47
264 0.39
265 0.33
266 0.34
267 0.3
268 0.33
269 0.32
270 0.26
271 0.25
272 0.26
273 0.26
274 0.2
275 0.18
276 0.15
277 0.12
278 0.11
279 0.13
280 0.14
281 0.19
282 0.2
283 0.22
284 0.22
285 0.24
286 0.24
287 0.26
288 0.26
289 0.23
290 0.22
291 0.21
292 0.2
293 0.16
294 0.15
295 0.1
296 0.09
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.12
305 0.14
306 0.17
307 0.2
308 0.24
309 0.24
310 0.31
311 0.35
312 0.33
313 0.35
314 0.35
315 0.33
316 0.32
317 0.3
318 0.26
319 0.26
320 0.26
321 0.22
322 0.19
323 0.19
324 0.17
325 0.17
326 0.17
327 0.16
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.14
332 0.14
333 0.13
334 0.1
335 0.08
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.07
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.13
349 0.16
350 0.2
351 0.23
352 0.25
353 0.21
354 0.21
355 0.21
356 0.22
357 0.21
358 0.24
359 0.23
360 0.21
361 0.25
362 0.25
363 0.23
364 0.22
365 0.22
366 0.17
367 0.2
368 0.29
369 0.26
370 0.32
371 0.36
372 0.4
373 0.45
374 0.53
375 0.56
376 0.56
377 0.66
378 0.7
379 0.75
380 0.8
381 0.83
382 0.76
383 0.73
384 0.7
385 0.71
386 0.65
387 0.64
388 0.59
389 0.53
390 0.52
391 0.53
392 0.56
393 0.48
394 0.5
395 0.51
396 0.57
397 0.62
398 0.69
399 0.68
400 0.68
401 0.75
402 0.71
403 0.68
404 0.61
405 0.57
406 0.55
407 0.54
408 0.47
409 0.43
410 0.41
411 0.36
412 0.33
413 0.28
414 0.25
415 0.22
416 0.19
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.14
421 0.17
422 0.14
423 0.18
424 0.19
425 0.23
426 0.33
427 0.4
428 0.45
429 0.47
430 0.5
431 0.55
432 0.54
433 0.51
434 0.45
435 0.44
436 0.39
437 0.35
438 0.32
439 0.25
440 0.28
441 0.27
442 0.3
443 0.28
444 0.29
445 0.31
446 0.34
447 0.36
448 0.35
449 0.35
450 0.32
451 0.28
452 0.29
453 0.29
454 0.28
455 0.24
456 0.23
457 0.23
458 0.2
459 0.26
460 0.28
461 0.28
462 0.3
463 0.34
464 0.32
465 0.31
466 0.3
467 0.24
468 0.2
469 0.17
470 0.16
471 0.13
472 0.13
473 0.14
474 0.17
475 0.16
476 0.17
477 0.21
478 0.2
479 0.22
480 0.25
481 0.3
482 0.27
483 0.28
484 0.27
485 0.24
486 0.27
487 0.29
488 0.25
489 0.24
490 0.24
491 0.26
492 0.3
493 0.33