Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DZU6

Protein Details
Accession C5DZU6    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MASTSKASKKELKQKELKQKEEAKAAKHydrophilic
97-117SEEEKSKKKTSKKEESSSESDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-52ASKKELKQKELKQKEEAKAAKAAKASKPSKSAKAAKTSKSTKSAKA
424-443RGAPRGGARGGGNRGGFRTG
451-456LGKGKN
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034276  Gar2_RRM2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG zro:ZYRO0G07326g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
cd12448  RRM2_gar2  
Amino Acid Sequences MASTSKASKKELKQKELKQKEEAKAAKAAKASKPSKSAKAAKTSKSTKSAKAAKVESESSDSSSGSDSDSESSSDDEDDKKSSSSSSSDESSSDDESEEEKSKKKTSKKEESSSESDSDSDSESSSDESEEDKKESKKESSSDESSSDESEEDKKESKKESSSDESSSDEEEDKKDSKKDSSSDESSSESSSDEEDSKSSSSSSSEEASKPSKRKAEVDEEQEESSKKAKLSGEPATIFVGRLSWNIDDQWLKNEFEHIGGVQSARVIYERGSTRSRGYGYVDFTDKSYAEKAVKEMHGKELDGRPINCDMSTSKPTVNPREDRAKRFGDMPSEPSDTLFLGNLSFNADRDQIYELFSPHGEVISVRIPTHPETEQPKGFGYVQYASVDSAQKALETLQGEYIDNRPVRLDFSTPKTGNGGGNRGAPRGGARGGGNRGGFRTGSGANSAPLGKGKNSAPFKGSKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.89
3 0.9
4 0.86
5 0.85
6 0.84
7 0.8
8 0.8
9 0.74
10 0.67
11 0.65
12 0.61
13 0.56
14 0.51
15 0.51
16 0.47
17 0.53
18 0.54
19 0.52
20 0.58
21 0.61
22 0.64
23 0.67
24 0.7
25 0.67
26 0.73
27 0.75
28 0.73
29 0.76
30 0.75
31 0.73
32 0.73
33 0.71
34 0.67
35 0.69
36 0.71
37 0.67
38 0.69
39 0.65
40 0.6
41 0.6
42 0.55
43 0.48
44 0.43
45 0.38
46 0.33
47 0.3
48 0.25
49 0.2
50 0.19
51 0.17
52 0.13
53 0.13
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.13
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.16
66 0.17
67 0.17
68 0.16
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.19
73 0.2
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.18
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.17
85 0.2
86 0.2
87 0.23
88 0.26
89 0.33
90 0.4
91 0.48
92 0.55
93 0.61
94 0.7
95 0.75
96 0.8
97 0.8
98 0.8
99 0.78
100 0.71
101 0.62
102 0.51
103 0.42
104 0.34
105 0.27
106 0.21
107 0.15
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.1
116 0.13
117 0.15
118 0.17
119 0.21
120 0.23
121 0.27
122 0.31
123 0.34
124 0.35
125 0.36
126 0.41
127 0.43
128 0.44
129 0.42
130 0.39
131 0.37
132 0.33
133 0.3
134 0.24
135 0.17
136 0.14
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.2
141 0.23
142 0.26
143 0.31
144 0.34
145 0.35
146 0.36
147 0.41
148 0.43
149 0.44
150 0.42
151 0.39
152 0.37
153 0.32
154 0.3
155 0.24
156 0.18
157 0.15
158 0.14
159 0.16
160 0.17
161 0.18
162 0.2
163 0.22
164 0.24
165 0.27
166 0.29
167 0.32
168 0.36
169 0.38
170 0.36
171 0.35
172 0.34
173 0.3
174 0.28
175 0.21
176 0.15
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.13
193 0.13
194 0.16
195 0.21
196 0.25
197 0.27
198 0.31
199 0.34
200 0.34
201 0.37
202 0.4
203 0.44
204 0.44
205 0.47
206 0.45
207 0.42
208 0.4
209 0.36
210 0.31
211 0.23
212 0.2
213 0.16
214 0.13
215 0.15
216 0.16
217 0.18
218 0.23
219 0.26
220 0.28
221 0.27
222 0.27
223 0.25
224 0.23
225 0.21
226 0.15
227 0.11
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.15
238 0.16
239 0.16
240 0.15
241 0.17
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.1
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.1
257 0.12
258 0.16
259 0.18
260 0.2
261 0.21
262 0.24
263 0.25
264 0.21
265 0.23
266 0.23
267 0.24
268 0.24
269 0.24
270 0.21
271 0.21
272 0.21
273 0.17
274 0.15
275 0.13
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.19
281 0.22
282 0.24
283 0.24
284 0.28
285 0.27
286 0.27
287 0.3
288 0.28
289 0.31
290 0.32
291 0.31
292 0.28
293 0.29
294 0.29
295 0.25
296 0.22
297 0.18
298 0.2
299 0.23
300 0.22
301 0.21
302 0.25
303 0.31
304 0.38
305 0.43
306 0.41
307 0.43
308 0.53
309 0.57
310 0.58
311 0.59
312 0.54
313 0.48
314 0.48
315 0.45
316 0.4
317 0.36
318 0.34
319 0.33
320 0.33
321 0.31
322 0.28
323 0.26
324 0.2
325 0.18
326 0.15
327 0.1
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.12
335 0.13
336 0.12
337 0.13
338 0.16
339 0.13
340 0.16
341 0.17
342 0.15
343 0.16
344 0.16
345 0.16
346 0.13
347 0.12
348 0.09
349 0.08
350 0.1
351 0.13
352 0.14
353 0.13
354 0.14
355 0.17
356 0.19
357 0.23
358 0.21
359 0.23
360 0.28
361 0.35
362 0.36
363 0.35
364 0.34
365 0.33
366 0.34
367 0.29
368 0.26
369 0.21
370 0.21
371 0.21
372 0.2
373 0.17
374 0.19
375 0.19
376 0.16
377 0.15
378 0.13
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.13
383 0.13
384 0.14
385 0.15
386 0.16
387 0.17
388 0.18
389 0.2
390 0.23
391 0.22
392 0.21
393 0.2
394 0.19
395 0.22
396 0.22
397 0.26
398 0.25
399 0.32
400 0.41
401 0.4
402 0.41
403 0.41
404 0.41
405 0.41
406 0.39
407 0.37
408 0.3
409 0.37
410 0.37
411 0.36
412 0.33
413 0.29
414 0.26
415 0.25
416 0.23
417 0.19
418 0.2
419 0.26
420 0.3
421 0.34
422 0.34
423 0.32
424 0.32
425 0.32
426 0.29
427 0.23
428 0.24
429 0.2
430 0.19
431 0.21
432 0.2
433 0.18
434 0.21
435 0.2
436 0.17
437 0.19
438 0.2
439 0.18
440 0.23
441 0.26
442 0.33
443 0.38
444 0.4
445 0.41
446 0.47
447 0.51
448 0.57