Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DVC8

Protein Details
Accession C5DVC8    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-109PEPLPESKPKSQSKKRHSDEDEGBasic
334-361LESNGKSRKLRVTRCRNLKKSSNKNGAQHydrophilic
406-441ASKADSKPSAILKKRKKRSQSGRVTKRSQAHKKNNKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
408-441KADSKPSAILKKRKKRSQSGRVTKRSQAHKKNNK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.833, mito_nucl 12.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR047189  RRM2_Nop12p-like  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG zro:ZYRO0D05654g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12670  RRM2_Nop12p_like  
Amino Acid Sequences MSSSVENLFGSVNDAKIESSVGKLFSTSSGPIDKNVVNARKRTVLPDLPAKKDESESEKEPEQQSEQESKEESEEESEEEQAPEPLPEPLPESKPKSQSKKRHSDEDEGLEERYFAKLMDQEPAEDAGDADKQAEKPQQDERPQEGAKKIDLKEDELEKAERTVFVGNVPADVIPNKSLHRQFKKLFQDEKGLESIRFRSISFEVPLPRKVAFVQQKLHKSRGSVNAYVVYKNKNSVSSVCSRLNGQVFVDRHLRVDSVTHPAKHDNKRSVFVGNLDFEEDEESLWRHFGSCGEIEYVRIIRDPKTNMGKGFAYVQFKDFPNVSKALLLNDKPLESNGKSRKLRVTRCRNLKKSSNKNGAQSLKQNGIMNKLSDSHKTKLGRAKKVLNKADSAQLGKEITVEGIRASKADSKPSAILKKRKKRSQSGRVTKRSQAHKKNNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.14
4 0.15
5 0.11
6 0.13
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.16
12 0.16
13 0.18
14 0.17
15 0.18
16 0.23
17 0.23
18 0.24
19 0.28
20 0.27
21 0.3
22 0.37
23 0.42
24 0.41
25 0.45
26 0.48
27 0.5
28 0.51
29 0.49
30 0.49
31 0.47
32 0.47
33 0.54
34 0.56
35 0.54
36 0.55
37 0.53
38 0.46
39 0.43
40 0.43
41 0.39
42 0.39
43 0.37
44 0.4
45 0.4
46 0.44
47 0.43
48 0.42
49 0.38
50 0.35
51 0.36
52 0.38
53 0.37
54 0.34
55 0.33
56 0.31
57 0.29
58 0.27
59 0.23
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.17
64 0.18
65 0.17
66 0.17
67 0.17
68 0.15
69 0.14
70 0.12
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.11
75 0.15
76 0.18
77 0.23
78 0.29
79 0.36
80 0.41
81 0.49
82 0.58
83 0.64
84 0.7
85 0.76
86 0.8
87 0.84
88 0.82
89 0.84
90 0.8
91 0.78
92 0.74
93 0.69
94 0.63
95 0.53
96 0.48
97 0.37
98 0.32
99 0.24
100 0.18
101 0.12
102 0.08
103 0.09
104 0.11
105 0.12
106 0.17
107 0.17
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.17
112 0.14
113 0.13
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.14
121 0.18
122 0.18
123 0.2
124 0.28
125 0.35
126 0.4
127 0.44
128 0.46
129 0.49
130 0.49
131 0.5
132 0.46
133 0.4
134 0.37
135 0.39
136 0.34
137 0.33
138 0.32
139 0.31
140 0.31
141 0.32
142 0.3
143 0.25
144 0.26
145 0.2
146 0.2
147 0.17
148 0.14
149 0.12
150 0.12
151 0.1
152 0.09
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.08
162 0.1
163 0.11
164 0.17
165 0.23
166 0.32
167 0.38
168 0.44
169 0.45
170 0.53
171 0.61
172 0.63
173 0.61
174 0.54
175 0.56
176 0.49
177 0.49
178 0.43
179 0.34
180 0.27
181 0.24
182 0.23
183 0.18
184 0.17
185 0.15
186 0.15
187 0.16
188 0.18
189 0.18
190 0.19
191 0.21
192 0.23
193 0.24
194 0.23
195 0.21
196 0.19
197 0.18
198 0.24
199 0.27
200 0.29
201 0.33
202 0.38
203 0.47
204 0.49
205 0.52
206 0.45
207 0.39
208 0.4
209 0.44
210 0.43
211 0.35
212 0.33
213 0.35
214 0.35
215 0.35
216 0.3
217 0.24
218 0.19
219 0.2
220 0.2
221 0.16
222 0.17
223 0.17
224 0.19
225 0.21
226 0.26
227 0.25
228 0.24
229 0.24
230 0.26
231 0.25
232 0.22
233 0.18
234 0.19
235 0.18
236 0.2
237 0.23
238 0.2
239 0.2
240 0.2
241 0.19
242 0.13
243 0.14
244 0.13
245 0.17
246 0.2
247 0.2
248 0.21
249 0.27
250 0.35
251 0.41
252 0.47
253 0.48
254 0.48
255 0.5
256 0.5
257 0.46
258 0.38
259 0.34
260 0.29
261 0.21
262 0.19
263 0.17
264 0.15
265 0.13
266 0.14
267 0.11
268 0.08
269 0.07
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.15
284 0.15
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.2
290 0.22
291 0.27
292 0.35
293 0.37
294 0.36
295 0.38
296 0.36
297 0.31
298 0.33
299 0.31
300 0.27
301 0.25
302 0.26
303 0.27
304 0.27
305 0.28
306 0.24
307 0.22
308 0.21
309 0.22
310 0.2
311 0.19
312 0.19
313 0.21
314 0.26
315 0.24
316 0.25
317 0.25
318 0.25
319 0.22
320 0.23
321 0.25
322 0.21
323 0.3
324 0.33
325 0.42
326 0.44
327 0.48
328 0.56
329 0.6
330 0.68
331 0.7
332 0.73
333 0.74
334 0.83
335 0.89
336 0.87
337 0.86
338 0.85
339 0.86
340 0.85
341 0.86
342 0.85
343 0.79
344 0.77
345 0.78
346 0.74
347 0.69
348 0.65
349 0.59
350 0.53
351 0.52
352 0.5
353 0.43
354 0.43
355 0.4
356 0.34
357 0.31
358 0.31
359 0.3
360 0.33
361 0.38
362 0.34
363 0.39
364 0.4
365 0.45
366 0.51
367 0.58
368 0.6
369 0.61
370 0.69
371 0.7
372 0.78
373 0.79
374 0.74
375 0.68
376 0.61
377 0.61
378 0.55
379 0.48
380 0.39
381 0.34
382 0.31
383 0.26
384 0.24
385 0.17
386 0.14
387 0.13
388 0.12
389 0.1
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.14
394 0.21
395 0.23
396 0.3
397 0.32
398 0.33
399 0.38
400 0.46
401 0.54
402 0.55
403 0.63
404 0.67
405 0.75
406 0.82
407 0.87
408 0.88
409 0.89
410 0.91
411 0.92
412 0.92
413 0.93
414 0.93
415 0.93
416 0.89
417 0.86
418 0.84
419 0.84
420 0.83
421 0.83