Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DXK0

Protein Details
Accession C5DXK0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-83AYLNSCFQRCQQQKRLNKNGSPSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
KEGG zro:ZYRO0F05698g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSSIEDILQVTCNNQDTRGYSLVQTEDISGDGAGSLRVEDVDAVLLYQLMENESLTEPFAYLNSCFQRCQQQKRLNKNGSPSLGAVFQEIDRLVVGYGLVTLQVECFSPNGDFMSYVKQIVSDVDRYIDFLSQLIQRSIVEGTVMELLEGFFPTLLRFMSQELQYFDLNDSSIYNAVLTLFEMFVTFKPIAAVFTQVTGFFGDYDCKPNDFEKTTILGPILTLSPLNPNVALRNYGENLERTQQQKNIIHESLQTEHKVVVERLFFILDKLVRGSSTSREDIMGYFSRIVNKNHLRRGEHANQNTLASNAFMTNITLILIKFSEPFLDVSFKRIDKIDVNYFNNLNLFIDLSSETRVNSDFKEADEFYDKNKKDEDCKPNFISDCFFLTMTYLHYGIGGTLLYDEKITPQVKRLKQEIDRIKKVSQSQDMFATFASVQLKQMEKSLKITQSIKDALQGFFSHRYLQLEVFDFICGASVFLMRAIDPEHLFPSKYFKLPLIPDQVGVENVDNADYLRANAPIPFKYYPEFVIEGPINYSLYISQYNTSPIFRNPRLSSFVELATAILRCPELVSNPHLKGKLVQLLSVGAMPLTDDSPGFMMDVFENDTFVSDHLLYAFLDFYVIVEKTGSSSQFYDKFNSRYSISIILEQLYYRIPKYKAQLIWQANNNADFFVRFVARMLNDLTFLLDEGLGNLAEVHNISIELENRAKGLPPTREEDDRELRSKYASAERQAKSSCGLADKSITLFELYSKDIPNAFVTPEIVDRLASMLDHNLGSLVGPKCGKLKVKDPQKFSFNPKRLLKSLTTVYIHLADQQSFVSAVAKDGRSFSKELFERAVHILAMKIGLVSDEFCHKLLEFAQRAEEQKAAEEAEDFGFDEVPDEFLDPLMFTIMNDPVILPASKMSIDRSTIKAHLLSDSTDPFNRMPLKLEQVTPNHELKRQIEEFKRQRKGNNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.24
4 0.29
5 0.31
6 0.29
7 0.25
8 0.29
9 0.29
10 0.26
11 0.25
12 0.2
13 0.17
14 0.16
15 0.15
16 0.11
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.08
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.18
50 0.24
51 0.25
52 0.27
53 0.29
54 0.4
55 0.47
56 0.56
57 0.59
58 0.62
59 0.7
60 0.8
61 0.88
62 0.86
63 0.82
64 0.81
65 0.79
66 0.72
67 0.65
68 0.55
69 0.46
70 0.4
71 0.35
72 0.27
73 0.2
74 0.16
75 0.16
76 0.15
77 0.13
78 0.1
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.05
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.19
102 0.18
103 0.18
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.18
108 0.21
109 0.16
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.19
114 0.19
115 0.17
116 0.14
117 0.11
118 0.14
119 0.15
120 0.17
121 0.16
122 0.16
123 0.15
124 0.17
125 0.17
126 0.14
127 0.11
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.11
146 0.16
147 0.18
148 0.21
149 0.22
150 0.24
151 0.23
152 0.24
153 0.22
154 0.18
155 0.16
156 0.13
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.12
173 0.11
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.12
179 0.15
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.08
188 0.09
189 0.11
190 0.11
191 0.17
192 0.17
193 0.18
194 0.19
195 0.21
196 0.26
197 0.27
198 0.26
199 0.24
200 0.26
201 0.26
202 0.25
203 0.23
204 0.17
205 0.14
206 0.14
207 0.11
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.12
215 0.13
216 0.15
217 0.17
218 0.18
219 0.16
220 0.18
221 0.19
222 0.2
223 0.21
224 0.2
225 0.21
226 0.22
227 0.25
228 0.25
229 0.28
230 0.3
231 0.36
232 0.4
233 0.42
234 0.46
235 0.42
236 0.4
237 0.38
238 0.38
239 0.33
240 0.32
241 0.28
242 0.21
243 0.21
244 0.21
245 0.22
246 0.19
247 0.19
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.16
253 0.13
254 0.16
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.11
260 0.13
261 0.15
262 0.16
263 0.2
264 0.2
265 0.2
266 0.2
267 0.21
268 0.2
269 0.22
270 0.19
271 0.16
272 0.16
273 0.16
274 0.22
275 0.25
276 0.26
277 0.31
278 0.39
279 0.45
280 0.5
281 0.54
282 0.51
283 0.52
284 0.59
285 0.59
286 0.59
287 0.54
288 0.52
289 0.47
290 0.46
291 0.42
292 0.33
293 0.24
294 0.15
295 0.12
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.14
315 0.13
316 0.16
317 0.2
318 0.2
319 0.2
320 0.2
321 0.21
322 0.2
323 0.25
324 0.3
325 0.33
326 0.35
327 0.37
328 0.36
329 0.34
330 0.31
331 0.26
332 0.18
333 0.11
334 0.09
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.14
347 0.13
348 0.13
349 0.18
350 0.17
351 0.18
352 0.21
353 0.2
354 0.21
355 0.3
356 0.29
357 0.27
358 0.3
359 0.3
360 0.32
361 0.42
362 0.48
363 0.45
364 0.52
365 0.52
366 0.52
367 0.51
368 0.45
369 0.37
370 0.28
371 0.24
372 0.18
373 0.17
374 0.13
375 0.12
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.09
380 0.07
381 0.08
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.19
397 0.28
398 0.31
399 0.36
400 0.39
401 0.41
402 0.45
403 0.54
404 0.57
405 0.57
406 0.59
407 0.58
408 0.55
409 0.52
410 0.51
411 0.47
412 0.44
413 0.37
414 0.33
415 0.33
416 0.32
417 0.28
418 0.24
419 0.2
420 0.12
421 0.13
422 0.13
423 0.09
424 0.1
425 0.12
426 0.13
427 0.12
428 0.16
429 0.17
430 0.16
431 0.2
432 0.24
433 0.23
434 0.26
435 0.28
436 0.25
437 0.27
438 0.28
439 0.24
440 0.24
441 0.23
442 0.2
443 0.19
444 0.18
445 0.16
446 0.17
447 0.17
448 0.14
449 0.13
450 0.15
451 0.15
452 0.15
453 0.14
454 0.13
455 0.13
456 0.12
457 0.11
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.06
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.05
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.16
479 0.16
480 0.17
481 0.17
482 0.16
483 0.2
484 0.21
485 0.26
486 0.26
487 0.24
488 0.23
489 0.23
490 0.23
491 0.19
492 0.18
493 0.13
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.09
506 0.11
507 0.11
508 0.16
509 0.16
510 0.16
511 0.17
512 0.18
513 0.16
514 0.17
515 0.18
516 0.13
517 0.16
518 0.15
519 0.14
520 0.14
521 0.13
522 0.1
523 0.09
524 0.09
525 0.06
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.11
532 0.12
533 0.13
534 0.13
535 0.16
536 0.23
537 0.24
538 0.3
539 0.3
540 0.32
541 0.36
542 0.36
543 0.34
544 0.28
545 0.27
546 0.2
547 0.19
548 0.16
549 0.12
550 0.1
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.05
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.09
559 0.14
560 0.19
561 0.21
562 0.25
563 0.25
564 0.24
565 0.25
566 0.26
567 0.28
568 0.22
569 0.21
570 0.18
571 0.18
572 0.18
573 0.16
574 0.12
575 0.05
576 0.05
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.05
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.06
590 0.08
591 0.07
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.09
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.08
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.04
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.08
615 0.1
616 0.1
617 0.09
618 0.11
619 0.15
620 0.2
621 0.22
622 0.24
623 0.27
624 0.3
625 0.31
626 0.32
627 0.29
628 0.25
629 0.26
630 0.27
631 0.24
632 0.23
633 0.21
634 0.19
635 0.18
636 0.17
637 0.15
638 0.12
639 0.12
640 0.1
641 0.16
642 0.17
643 0.21
644 0.26
645 0.32
646 0.33
647 0.38
648 0.46
649 0.46
650 0.5
651 0.5
652 0.49
653 0.43
654 0.42
655 0.37
656 0.28
657 0.22
658 0.17
659 0.12
660 0.11
661 0.1
662 0.08
663 0.08
664 0.11
665 0.11
666 0.13
667 0.14
668 0.12
669 0.12
670 0.12
671 0.12
672 0.09
673 0.09
674 0.08
675 0.06
676 0.05
677 0.05
678 0.06
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.04
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.04
687 0.04
688 0.05
689 0.07
690 0.08
691 0.11
692 0.13
693 0.13
694 0.13
695 0.14
696 0.15
697 0.16
698 0.22
699 0.24
700 0.26
701 0.31
702 0.35
703 0.39
704 0.41
705 0.45
706 0.46
707 0.45
708 0.46
709 0.42
710 0.38
711 0.35
712 0.33
713 0.3
714 0.31
715 0.31
716 0.35
717 0.43
718 0.43
719 0.47
720 0.47
721 0.44
722 0.37
723 0.34
724 0.28
725 0.22
726 0.23
727 0.18
728 0.19
729 0.19
730 0.18
731 0.16
732 0.15
733 0.12
734 0.11
735 0.11
736 0.11
737 0.13
738 0.15
739 0.16
740 0.17
741 0.17
742 0.18
743 0.19
744 0.18
745 0.16
746 0.14
747 0.14
748 0.14
749 0.14
750 0.14
751 0.12
752 0.11
753 0.1
754 0.1
755 0.09
756 0.08
757 0.08
758 0.08
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.08
763 0.08
764 0.08
765 0.14
766 0.13
767 0.15
768 0.16
769 0.17
770 0.2
771 0.25
772 0.31
773 0.29
774 0.38
775 0.44
776 0.55
777 0.61
778 0.65
779 0.67
780 0.68
781 0.69
782 0.7
783 0.71
784 0.67
785 0.7
786 0.7
787 0.7
788 0.66
789 0.65
790 0.58
791 0.53
792 0.51
793 0.48
794 0.42
795 0.36
796 0.35
797 0.32
798 0.29
799 0.28
800 0.25
801 0.19
802 0.18
803 0.17
804 0.16
805 0.14
806 0.14
807 0.12
808 0.1
809 0.12
810 0.16
811 0.17
812 0.17
813 0.2
814 0.23
815 0.24
816 0.26
817 0.24
818 0.29
819 0.29
820 0.32
821 0.33
822 0.31
823 0.31
824 0.32
825 0.32
826 0.22
827 0.21
828 0.19
829 0.14
830 0.14
831 0.1
832 0.08
833 0.06
834 0.06
835 0.06
836 0.07
837 0.08
838 0.12
839 0.13
840 0.14
841 0.15
842 0.15
843 0.17
844 0.2
845 0.28
846 0.27
847 0.26
848 0.31
849 0.33
850 0.36
851 0.37
852 0.35
853 0.25
854 0.24
855 0.25
856 0.21
857 0.17
858 0.15
859 0.15
860 0.14
861 0.14
862 0.12
863 0.11
864 0.1
865 0.1
866 0.1
867 0.09
868 0.09
869 0.09
870 0.09
871 0.09
872 0.09
873 0.09
874 0.08
875 0.08
876 0.08
877 0.08
878 0.07
879 0.1
880 0.11
881 0.11
882 0.11
883 0.11
884 0.1
885 0.13
886 0.13
887 0.1
888 0.1
889 0.11
890 0.13
891 0.14
892 0.17
893 0.19
894 0.23
895 0.26
896 0.29
897 0.32
898 0.33
899 0.35
900 0.33
901 0.3
902 0.3
903 0.27
904 0.26
905 0.26
906 0.28
907 0.29
908 0.28
909 0.3
910 0.26
911 0.32
912 0.34
913 0.3
914 0.31
915 0.33
916 0.39
917 0.41
918 0.45
919 0.45
920 0.46
921 0.52
922 0.52
923 0.54
924 0.49
925 0.49
926 0.51
927 0.46
928 0.51
929 0.5
930 0.54
931 0.55
932 0.63
933 0.69
934 0.73
935 0.8
936 0.75