FuNGI

C4R980

Protein Details

Accession

C4R980

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-61	GFPVATKRRPSKWSNRLHSKKPQTFPTD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
KEGG	ppa:PAS_chr4_0885 -
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C

Amino Acid Sequences

MNLINEVIERNLNFESTTEELRNAENVPVVSLDGFPVATKRRPSKWSNRLHSKKPQTFPTDELKSLYKKTDYVSKPDRILHLGADTPGLQSPSQGTAGQSKDLSKYISRESLPFSQRTSSENEKNSDYINPQTKSLQFVDESCCTENIEGYGTWIGGTVIEPPSVSSSKTEGIKSASSTEAYSNGEDASTKKCKLSCKTEFQQSLQWDDVEYFNELYPKCSESTIETEIPNNTTINTKEKEYIELDLNDPEFNEKLHQKYFPDLPAHPEQLAWMSPVTNETEEGDDVVYDDVKDIRFDFKGEMIPTSKVLSIPTAEGLHHHSRNPGMAGYTLHELASYACSTFPSQKCIAIQTLGRILYKLGKHSYPISVDEIEARDSGRYLLASFEDTIWKLIEEFHIIEILIKSSNERETSNLSIRSYAVEALWLWRAGEGDKRSLTSQHGSNN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.19
3	0.18
4	0.23
5	0.21
6	0.22
7	0.22
8	0.23
9	0.25
10	0.21
11	0.2
12	0.18
13	0.17
14	0.17
15	0.16
16	0.15
17	0.14
18	0.12
19	0.11
20	0.09
21	0.09
22	0.08
23	0.12
24	0.17
25	0.22
26	0.3
27	0.37
28	0.44
29	0.51
30	0.6
31	0.67
32	0.72
33	0.78
34	0.8
35	0.84
36	0.86
37	0.87
38	0.89
39	0.89
40	0.88
41	0.84
42	0.82
43	0.78
44	0.74
45	0.69
46	0.68
47	0.62
48	0.54
49	0.5
50	0.46
51	0.43
52	0.41
53	0.41
54	0.34
55	0.3
56	0.32
57	0.39
58	0.37
59	0.43
60	0.48
61	0.49
62	0.51
63	0.52
64	0.53
65	0.46
66	0.44
67	0.36
68	0.3
69	0.26
70	0.22
71	0.2
72	0.17
73	0.14
74	0.14
75	0.14
76	0.12
77	0.11
78	0.12
79	0.14
80	0.15
81	0.15
82	0.15
83	0.2
84	0.21
85	0.23
86	0.22
87	0.21
88	0.22
89	0.23
90	0.24
91	0.21
92	0.23
93	0.25
94	0.29
95	0.29
96	0.28
97	0.32
98	0.38
99	0.39
100	0.37
101	0.35
102	0.33
103	0.33
104	0.33
105	0.34
106	0.34
107	0.38
108	0.41
109	0.41
110	0.4
111	0.4
112	0.39
113	0.35
114	0.29
115	0.29
116	0.33
117	0.31
118	0.3
119	0.33
120	0.33
121	0.34
122	0.33
123	0.28
124	0.2
125	0.21
126	0.25
127	0.24
128	0.25
129	0.22
130	0.21
131	0.19
132	0.18
133	0.16
134	0.12
135	0.11
136	0.09
137	0.09
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.07
143	0.05
144	0.06
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.08
150	0.11
151	0.12
152	0.12
153	0.11
154	0.12
155	0.16
156	0.19
157	0.19
158	0.17
159	0.19
160	0.19
161	0.19
162	0.19
163	0.16
164	0.14
165	0.15
166	0.14
167	0.13
168	0.13
169	0.13
170	0.11
171	0.1
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.13
176	0.16
177	0.17
178	0.18
179	0.21
180	0.28
181	0.34
182	0.42
183	0.44
184	0.49
185	0.53
186	0.6
187	0.59
188	0.54
189	0.54
190	0.46
191	0.41
192	0.33
193	0.28
194	0.19
195	0.18
196	0.16
197	0.12
198	0.11
199	0.08
200	0.08
201	0.11
202	0.11
203	0.12
204	0.13
205	0.13
206	0.13
207	0.12
208	0.12
209	0.12
210	0.16
211	0.18
212	0.19
213	0.18
214	0.18
215	0.19
216	0.19
217	0.17
218	0.13
219	0.1
220	0.1
221	0.12
222	0.15
223	0.16
224	0.16
225	0.19
226	0.2
227	0.22
228	0.21
229	0.22
230	0.19
231	0.19
232	0.19
233	0.17
234	0.17
235	0.14
236	0.12
237	0.12
238	0.09
239	0.08
240	0.11
241	0.12
242	0.15
243	0.17
244	0.19
245	0.19
246	0.22
247	0.25
248	0.26
249	0.27
250	0.25
251	0.28
252	0.31
253	0.31
254	0.27
255	0.24
256	0.2
257	0.18
258	0.18
259	0.13
260	0.09
261	0.07
262	0.07
263	0.08
264	0.1
265	0.08
266	0.09
267	0.09
268	0.1
269	0.09
270	0.1
271	0.09
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.06
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.07
281	0.08
282	0.1
283	0.11
284	0.12
285	0.12
286	0.13
287	0.17
288	0.17
289	0.19
290	0.18
291	0.18
292	0.18
293	0.19
294	0.17
295	0.14
296	0.14
297	0.13
298	0.12
299	0.11
300	0.13
301	0.12
302	0.11
303	0.12
304	0.18
305	0.24
306	0.24
307	0.25
308	0.25
309	0.25
310	0.27
311	0.27
312	0.21
313	0.15
314	0.15
315	0.15
316	0.15
317	0.15
318	0.14
319	0.12
320	0.11
321	0.11
322	0.1
323	0.11
324	0.1
325	0.08
326	0.08
327	0.09
328	0.12
329	0.2
330	0.21
331	0.25
332	0.26
333	0.28
334	0.29
335	0.31
336	0.31
337	0.26
338	0.25
339	0.23
340	0.26
341	0.25
342	0.24
343	0.21
344	0.2
345	0.23
346	0.24
347	0.26
348	0.26
349	0.25
350	0.28
351	0.3
352	0.34
353	0.3
354	0.31
355	0.3
356	0.26
357	0.26
358	0.26
359	0.24
360	0.21
361	0.19
362	0.17
363	0.13
364	0.13
365	0.13
366	0.11
367	0.1
368	0.09
369	0.1
370	0.11
371	0.12
372	0.13
373	0.13
374	0.16
375	0.16
376	0.17
377	0.15
378	0.15
379	0.13
380	0.13
381	0.14
382	0.15
383	0.15
384	0.14
385	0.15
386	0.14
387	0.16
388	0.15
389	0.15
390	0.13
391	0.12
392	0.13
393	0.16
394	0.21
395	0.21
396	0.21
397	0.23
398	0.27
399	0.34
400	0.39
401	0.39
402	0.36
403	0.35
404	0.34
405	0.34
406	0.29
407	0.24
408	0.17
409	0.15
410	0.14
411	0.16
412	0.18
413	0.16
414	0.15
415	0.15
416	0.15
417	0.15
418	0.23
419	0.24
420	0.27
421	0.29
422	0.31
423	0.32
424	0.34
425	0.38
426	0.36

C4R980

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer