Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DXW8

Protein Details
Accession C5DXW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-76EKGDDEKKGNKRRKDLVVEKLNKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-67KKGNKRRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 3, pero 1, E.R. 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024964  CTLH/CRA  
IPR045098  Fyv10_fam  
IPR037683  Rmd5_dRing  
IPR044063  ZF_RING_GID  
IPR027370  Znf-RING_euk  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG zro:ZYRO0F08382g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10607  CTLH  
PF13445  zf-RING_UBOX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51867  ZF_RING_GID  
CDD cd16652  dRING_Rmd5p-like  
Amino Acid Sequences MSVILPSLSQEIERLYDEENGQPLVSKCVEETHEFKTQLKKLKAHLNKHIQEVEKGDDEKKGNKRRKDLVVEKLNKAHRQWDHSIKKNYKHASQQHSKISKFLQNKLHEFDLDEVYVNKLHPESRTNIDKAISFHISRYNVGSLPVNGRQEIIDYLGQVYGVTQDISERFVQLGQIVQDLKNGDTRSCIEWCHDDSLLQFELYTLNAMQLFQNGDVLNTYKYLTENIPNSAFKYRQHQVITQVSPLLTQLLLGKRADDFDNKLQLQQEKCISLFTKDYCAQNNLPFDSALFLIILSGVISFQFFTKYKSIRASAHVDWTTEDELPFDVKLPEFLTRFHPIFICPVLKEETTLENPPYSLPCHHILSKKSLERLSKNGTSTFKCPYCPVNASKAKTKKVNFVML
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.2
4 0.21
5 0.23
6 0.24
7 0.22
8 0.2
9 0.23
10 0.21
11 0.22
12 0.22
13 0.19
14 0.18
15 0.22
16 0.25
17 0.26
18 0.29
19 0.29
20 0.36
21 0.37
22 0.4
23 0.45
24 0.48
25 0.54
26 0.57
27 0.57
28 0.56
29 0.66
30 0.71
31 0.7
32 0.74
33 0.75
34 0.72
35 0.73
36 0.73
37 0.64
38 0.59
39 0.53
40 0.47
41 0.41
42 0.4
43 0.34
44 0.34
45 0.34
46 0.39
47 0.45
48 0.51
49 0.55
50 0.61
51 0.69
52 0.71
53 0.78
54 0.8
55 0.79
56 0.79
57 0.81
58 0.79
59 0.75
60 0.74
61 0.71
62 0.65
63 0.58
64 0.57
65 0.51
66 0.52
67 0.55
68 0.58
69 0.61
70 0.66
71 0.75
72 0.74
73 0.76
74 0.78
75 0.76
76 0.71
77 0.71
78 0.71
79 0.7
80 0.72
81 0.72
82 0.73
83 0.74
84 0.68
85 0.62
86 0.58
87 0.56
88 0.52
89 0.52
90 0.51
91 0.51
92 0.55
93 0.55
94 0.52
95 0.44
96 0.4
97 0.35
98 0.29
99 0.22
100 0.19
101 0.15
102 0.14
103 0.15
104 0.13
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.13
109 0.16
110 0.19
111 0.24
112 0.3
113 0.3
114 0.31
115 0.3
116 0.31
117 0.29
118 0.3
119 0.27
120 0.21
121 0.21
122 0.25
123 0.25
124 0.24
125 0.24
126 0.21
127 0.18
128 0.19
129 0.19
130 0.15
131 0.18
132 0.21
133 0.2
134 0.18
135 0.18
136 0.16
137 0.16
138 0.15
139 0.14
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.14
169 0.14
170 0.12
171 0.13
172 0.15
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.14
177 0.16
178 0.18
179 0.18
180 0.16
181 0.14
182 0.13
183 0.16
184 0.15
185 0.12
186 0.1
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.06
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.09
210 0.1
211 0.13
212 0.15
213 0.17
214 0.19
215 0.19
216 0.2
217 0.22
218 0.22
219 0.19
220 0.25
221 0.25
222 0.29
223 0.31
224 0.31
225 0.34
226 0.4
227 0.4
228 0.34
229 0.32
230 0.26
231 0.23
232 0.21
233 0.15
234 0.07
235 0.07
236 0.1
237 0.1
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.15
243 0.16
244 0.15
245 0.18
246 0.2
247 0.28
248 0.28
249 0.29
250 0.31
251 0.34
252 0.33
253 0.32
254 0.31
255 0.25
256 0.25
257 0.26
258 0.23
259 0.21
260 0.23
261 0.19
262 0.23
263 0.25
264 0.27
265 0.27
266 0.31
267 0.31
268 0.33
269 0.35
270 0.3
271 0.28
272 0.25
273 0.22
274 0.19
275 0.17
276 0.12
277 0.08
278 0.07
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.09
290 0.09
291 0.13
292 0.2
293 0.22
294 0.27
295 0.32
296 0.36
297 0.35
298 0.39
299 0.42
300 0.38
301 0.44
302 0.41
303 0.36
304 0.33
305 0.33
306 0.3
307 0.24
308 0.22
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.13
313 0.11
314 0.11
315 0.1
316 0.11
317 0.13
318 0.17
319 0.17
320 0.18
321 0.22
322 0.27
323 0.28
324 0.28
325 0.27
326 0.23
327 0.26
328 0.29
329 0.26
330 0.2
331 0.23
332 0.25
333 0.24
334 0.24
335 0.23
336 0.24
337 0.26
338 0.29
339 0.27
340 0.24
341 0.25
342 0.25
343 0.25
344 0.22
345 0.21
346 0.22
347 0.24
348 0.28
349 0.34
350 0.39
351 0.4
352 0.46
353 0.53
354 0.54
355 0.56
356 0.58
357 0.6
358 0.6
359 0.64
360 0.64
361 0.6
362 0.58
363 0.58
364 0.58
365 0.54
366 0.52
367 0.53
368 0.47
369 0.44
370 0.44
371 0.43
372 0.44
373 0.46
374 0.47
375 0.48
376 0.54
377 0.57
378 0.64
379 0.68
380 0.69
381 0.71
382 0.71
383 0.71