FuNGI

C5DQD9

Protein Details

Accession

C5DQD9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
768-790	EVKPTPRNPSKIRVHTNPRAYQY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto 5, cysk 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039766 Vps53 IPR031745 Vps53_C IPR038260 Vps53_C_sf IPR007234 Vps53_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0010008 C:endosome membrane GO:0000938 C:GARP complex GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
KEGG	zro:ZYRO0A10714g -
Pfam	View protein in Pfam PF16854 VPS53_C PF04100 Vps53_N

Amino Acid Sequences

MISNSVDYNPFEDITTILSAKESLNDIDRLICATRRYKLQLADEIKESEGQEESDKVGRSSDERRFDFGKVFREIEETKNFASGTQSTISQLTEGISHLDNAKRNLTQCMTLFQNLQILTDSYFHCKELIGRSAYKEMASSYKMMCSLAENTFKPYKSVDEINKLLASISRLRADTFEKIKHSYSRVLSGKVAESEAIEAELREGACDILDSDSSGKAQIIDTCLKKLLNEIGEIFRVDDEAGSLENLSRRYIFFKKVLNNFNSKFARYFLAEWEMPLRLTSTFFKMTAKDLEILLKKEFQGKDASIDLFMGALQETLDFEKYIDVRFSNKLRETKLSQHFESYLSLWVSHQDKMMNEKFLSYMSGGDLGSNLGDSLIIPSSADLFRTYRSVLTQTFELIENNSNNGILVSLANFFTKWLIAYSNKILQPLILPDSEEMQNKEETIKYTVTMINTADYCSVTIGQLEEKLAELSPDPVKIEQSFAMVRDTYDGLSAKGNSILLNRVLSVDLAFVAREFNNLDWARVVVENYSRYMTTLKEILCFDPSPGRKSTLQLILSQFNRDVYSWNFLDKVIDQVTQEFSGYIIRLLQPMPPFATSTSTRKFDPIKVVSIGEQLLLDTELLKEILYSLPGSVSDEANSAQTTAFKRVKKHIDTNLSQLLQFIKILVAPLSSVDDYHEAYQKLTDYNTSSVVWAYLLSLKGIPWDFNLWKQHWSAFDMDRDSHGSNDGNKDLFIFKWNTKLLTQFEYNLLRIQDPTWSKFVKEELEVKPTPRNPSKIRVHTNPRAYQYQTPPSDGPESHQQQQQQSPQGTPTSPLANVKNLMTSNRFFDIGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.17
3	0.15
4	0.13
5	0.13
6	0.13
7	0.13
8	0.15
9	0.15
10	0.14
11	0.18
12	0.19
13	0.19
14	0.2
15	0.2
16	0.2
17	0.2
18	0.21
19	0.23
20	0.27
21	0.32
22	0.37
23	0.43
24	0.46
25	0.51
26	0.54
27	0.58
28	0.59
29	0.58
30	0.54
31	0.5
32	0.44
33	0.41
34	0.34
35	0.27
36	0.22
37	0.19
38	0.18
39	0.17
40	0.19
41	0.21
42	0.21
43	0.2
44	0.2
45	0.21
46	0.24
47	0.31
48	0.37
49	0.41
50	0.43
51	0.47
52	0.48
53	0.49
54	0.52
55	0.49
56	0.47
57	0.42
58	0.41
59	0.37
60	0.4
61	0.41
62	0.39
63	0.4
64	0.37
65	0.32
66	0.34
67	0.33
68	0.27
69	0.29
70	0.23
71	0.21
72	0.19
73	0.19
74	0.18
75	0.19
76	0.19
77	0.15
78	0.14
79	0.11
80	0.1
81	0.1
82	0.11
83	0.1
84	0.11
85	0.15
86	0.19
87	0.23
88	0.25
89	0.29
90	0.29
91	0.31
92	0.36
93	0.35
94	0.35
95	0.32
96	0.34
97	0.33
98	0.32
99	0.32
100	0.26
101	0.29
102	0.23
103	0.23
104	0.2
105	0.17
106	0.16
107	0.18
108	0.18
109	0.19
110	0.2
111	0.2
112	0.19
113	0.19
114	0.21
115	0.25
116	0.3
117	0.29
118	0.3
119	0.33
120	0.36
121	0.37
122	0.33
123	0.27
124	0.22
125	0.22
126	0.21
127	0.21
128	0.18
129	0.19
130	0.2
131	0.19
132	0.18
133	0.16
134	0.19
135	0.22
136	0.27
137	0.25
138	0.3
139	0.35
140	0.35
141	0.34
142	0.31
143	0.29
144	0.28
145	0.35
146	0.36
147	0.38
148	0.4
149	0.41
150	0.4
151	0.36
152	0.32
153	0.25
154	0.22
155	0.2
156	0.21
157	0.22
158	0.22
159	0.22
160	0.25
161	0.27
162	0.31
163	0.32
164	0.33
165	0.34
166	0.36
167	0.39
168	0.42
169	0.41
170	0.41
171	0.38
172	0.42
173	0.42
174	0.41
175	0.39
176	0.37
177	0.35
178	0.29
179	0.27
180	0.18
181	0.16
182	0.14
183	0.12
184	0.11
185	0.08
186	0.07
187	0.07
188	0.09
189	0.08
190	0.07
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.09
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.09
206	0.1
207	0.13
208	0.19
209	0.2
210	0.21
211	0.23
212	0.22
213	0.21
214	0.22
215	0.23
216	0.19
217	0.19
218	0.2
219	0.2
220	0.21
221	0.21
222	0.18
223	0.13
224	0.12
225	0.1
226	0.08
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.09
234	0.1
235	0.1
236	0.11
237	0.11
238	0.17
239	0.21
240	0.24
241	0.26
242	0.32
243	0.39
244	0.46
245	0.53
246	0.51
247	0.56
248	0.52
249	0.57
250	0.53
251	0.46
252	0.39
253	0.33
254	0.32
255	0.26
256	0.26
257	0.19
258	0.22
259	0.21
260	0.2
261	0.2
262	0.18
263	0.16
264	0.15
265	0.13
266	0.08
267	0.11
268	0.12
269	0.15
270	0.16
271	0.16
272	0.18
273	0.18
274	0.2
275	0.21
276	0.2
277	0.17
278	0.16
279	0.22
280	0.23
281	0.24
282	0.22
283	0.21
284	0.2
285	0.26
286	0.26
287	0.21
288	0.23
289	0.21
290	0.23
291	0.23
292	0.23
293	0.16
294	0.16
295	0.14
296	0.09
297	0.09
298	0.06
299	0.04
300	0.04
301	0.03
302	0.03
303	0.04
304	0.05
305	0.06
306	0.05
307	0.06
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.1
312	0.1
313	0.12
314	0.17
315	0.19
316	0.23
317	0.28
318	0.31
319	0.33
320	0.37
321	0.39
322	0.44
323	0.51
324	0.5
325	0.45
326	0.43
327	0.41
328	0.37
329	0.34
330	0.26
331	0.19
332	0.14
333	0.14
334	0.12
335	0.15
336	0.15
337	0.15
338	0.15
339	0.14
340	0.14
341	0.21
342	0.24
343	0.23
344	0.21
345	0.21
346	0.2
347	0.18
348	0.19
349	0.12
350	0.09
351	0.07
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.1
375	0.11
376	0.09
377	0.1
378	0.13
379	0.12
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.12
384	0.12
385	0.11
386	0.1
387	0.12
388	0.1
389	0.11
390	0.1
391	0.09
392	0.08
393	0.08
394	0.07
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.07
408	0.08
409	0.1
410	0.12
411	0.17
412	0.18
413	0.18
414	0.17
415	0.15
416	0.15
417	0.15
418	0.14
419	0.09
420	0.09
421	0.08
422	0.11
423	0.13
424	0.13
425	0.13
426	0.13
427	0.13
428	0.12
429	0.14
430	0.12
431	0.12
432	0.14
433	0.13
434	0.11
435	0.13
436	0.15
437	0.14
438	0.14
439	0.12
440	0.11
441	0.11
442	0.11
443	0.09
444	0.08
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.05
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.1
464	0.09
465	0.11
466	0.11
467	0.12
468	0.1
469	0.11
470	0.11
471	0.11
472	0.13
473	0.11
474	0.11
475	0.11
476	0.11
477	0.09
478	0.1
479	0.1
480	0.09
481	0.1
482	0.11
483	0.09
484	0.1
485	0.1
486	0.09
487	0.09
488	0.1
489	0.1
490	0.1
491	0.1
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.08
496	0.06
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.04
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.07
505	0.07
506	0.15
507	0.16
508	0.16
509	0.15
510	0.15
511	0.15
512	0.15
513	0.15
514	0.08
515	0.11
516	0.12
517	0.13
518	0.14
519	0.12
520	0.13
521	0.13
522	0.13
523	0.12
524	0.15
525	0.14
526	0.16
527	0.17
528	0.17
529	0.19
530	0.19
531	0.18
532	0.22
533	0.24
534	0.24
535	0.25
536	0.27
537	0.26
538	0.28
539	0.32
540	0.32
541	0.31
542	0.31
543	0.33
544	0.35
545	0.34
546	0.34
547	0.28
548	0.22
549	0.22
550	0.18
551	0.18
552	0.14
553	0.19
554	0.18
555	0.18
556	0.18
557	0.17
558	0.18
559	0.15
560	0.17
561	0.14
562	0.14
563	0.14
564	0.15
565	0.16
566	0.15
567	0.15
568	0.11
569	0.09
570	0.1
571	0.1
572	0.08
573	0.08
574	0.08
575	0.09
576	0.1
577	0.13
578	0.13
579	0.14
580	0.16
581	0.15
582	0.15
583	0.15
584	0.19
585	0.19
586	0.25
587	0.29
588	0.29
589	0.29
590	0.33
591	0.35
592	0.35
593	0.41
594	0.38
595	0.36
596	0.36
597	0.36
598	0.32
599	0.31
600	0.27
601	0.17
602	0.14
603	0.1
604	0.09
605	0.08
606	0.07
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.06
611	0.05
612	0.05
613	0.06
614	0.06
615	0.07
616	0.07
617	0.06
618	0.07
619	0.07
620	0.1
621	0.1
622	0.1
623	0.1
624	0.1
625	0.11
626	0.11
627	0.11
628	0.09
629	0.08
630	0.12
631	0.14
632	0.21
633	0.27
634	0.29
635	0.34
636	0.43
637	0.52
638	0.56
639	0.62
640	0.63
641	0.66
642	0.66
643	0.68
644	0.66
645	0.57
646	0.49
647	0.42
648	0.34
649	0.25
650	0.23
651	0.16
652	0.09
653	0.09
654	0.1
655	0.09
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.1
660	0.1
661	0.09
662	0.1
663	0.12
664	0.13
665	0.16
666	0.2
667	0.17
668	0.18
669	0.19
670	0.19
671	0.18
672	0.18
673	0.18
674	0.17
675	0.18
676	0.2
677	0.19
678	0.18
679	0.17
680	0.16
681	0.13
682	0.1
683	0.1
684	0.11
685	0.1
686	0.11
687	0.11
688	0.11
689	0.15
690	0.16
691	0.15
692	0.14
693	0.2
694	0.21
695	0.27
696	0.34
697	0.32
698	0.34
699	0.35
700	0.37
701	0.33
702	0.33
703	0.32
704	0.29
705	0.32
706	0.32
707	0.31
708	0.3
709	0.32
710	0.3
711	0.26
712	0.25
713	0.23
714	0.24
715	0.28
716	0.28
717	0.25
718	0.24
719	0.25
720	0.24
721	0.22
722	0.22
723	0.22
724	0.21
725	0.28
726	0.31
727	0.31
728	0.31
729	0.36
730	0.35
731	0.36
732	0.37
733	0.31
734	0.35
735	0.36
736	0.36
737	0.34
738	0.31
739	0.26
740	0.25
741	0.23
742	0.25
743	0.27
744	0.29
745	0.32
746	0.32
747	0.31
748	0.33
749	0.37
750	0.33
751	0.33
752	0.37
753	0.36
754	0.42
755	0.44
756	0.43
757	0.48
758	0.49
759	0.54
760	0.54
761	0.58
762	0.56
763	0.64
764	0.72
765	0.73
766	0.77
767	0.78
768	0.8
769	0.81
770	0.85
771	0.82
772	0.78
773	0.73
774	0.69
775	0.68
776	0.66
777	0.67
778	0.6
779	0.58
780	0.53
781	0.51
782	0.52
783	0.44
784	0.4
785	0.41
786	0.43
787	0.44
788	0.47
789	0.48
790	0.49
791	0.57
792	0.6
793	0.58
794	0.55
795	0.51
796	0.51
797	0.5
798	0.44
799	0.39
800	0.34
801	0.3
802	0.29
803	0.33
804	0.33
805	0.34
806	0.35
807	0.33
808	0.35
809	0.33
810	0.35
811	0.35
812	0.34
813	0.33
814	0.33

C5DQD9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer